MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella tribocorum CIP 105476 plasmid pBT01

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010160	TATTTT	2	12	10	21	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010160	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010160	T	6	6	58	63	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010160	AT	4	8	75	82	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010160	T	8	8	93	100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010160	AATA	2	8	102	109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010160	TA	3	6	108	113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010160	TTA	2	6	951	956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010160	TA	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010160	TAT	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010160	TATT	2	8	992	999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010160	CGT	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010160	AATC	2	8	2003	2010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010160	TAT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010160	ACC	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010160	A	7	7	2181	2187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010160	GAA	2	6	2200	2205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010160	A	6	6	2238	2243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010160	CTT	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010160	TCA	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010160	T	6	6	3082	3087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010160	AGA	2	6	3162	3167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010160	TCA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010160	AAT	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010160	TG	3	6	3289	3294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010160	AT	3	6	3324	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010160	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010160	CAT	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010160	T	6	6	3417	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010160	AAT	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010160	TCACA	2	10	4134	4143	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010160	CT	3	6	5565	5570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010160	A	8	8	5580	5587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010160	T	6	6	5662	5667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010160	GTA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010160	GTA	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010160	T	7	7	5748	5754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010160	ACAA	2	8	5858	5865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010160	CAAA	2	8	5873	5880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010160	ATTC	2	8	5911	5918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010160	TCT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010160	TTTCA	2	10	5942	5951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010160	AC	4	8	5959	5966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010160	CAT	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010160	A	6	6	6029	6034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010160	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010160	AATT	2	8	6102	6109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010160	TTA	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010160	ATAAA	2	10	6199	6208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010160	A	6	6	6259	6264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010160	AATTT	2	10	6293	6302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010160	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010160	AAATG	2	10	6419	6428	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010160	TCAT	2	8	6440	6447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010160	GCA	2	6	6481	6486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010160	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010160	T	6	6	6563	6568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010160	AAT	2	6	6587	6592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010160	GATT	2	8	6659	6666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010160	T	7	7	6681	6687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010160	ATT	2	6	6790	6795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010160	A	7	7	6805	6811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010160	GGC	2	6	6816	6821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010160	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010160	A	6	6	6867	6872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010160	A	6	6	6930	6935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010160	GTTT	2	8	7067	7074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010160	A	6	6	7098	7103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010160	AAG	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010160	GAG	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010160	CT	3	6	7299	7304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010160	CAT	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010160	TAATA	2	10	7383	7392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010160	TA	3	6	7400	7405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010160	CATT	2	8	7408	7415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010160	GAT	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010160	CTTT	2	8	7481	7488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010160	TC	3	6	7495	7500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010160	ATG	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010160	AAG	2	6	7525	7530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010160	TTAT	2	8	7546	7553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010160	CGC	2	6	8356	8361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010160	TTTA	2	8	8370	8377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010160	AGA	2	6	8987	8992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010160	T	6	6	9011	9016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010160	CGC	2	6	9032	9037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010160	GTT	2	6	9866	9871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010160	CGC	2	6	9887	9892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010160	AGA	2	6	10588	10593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010160	CGC	2	6	10632	10637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010160	AAAG	2	8	11449	11456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010160	GTT	2	6	11482	11487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010160	TA	3	6	11535	11540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010160	TATT	2	8	11551	11558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010160	ATA	2	6	11564	11569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010160	T	6	6	11577	11582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010160	T	7	7	11587	11593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010160	T	7	7	11597	11603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010160	CTT	2	6	11645	11650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010160	TTATAT	2	12	11651	11662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010160	TAT	2	6	11676	11681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010160	GTT	2	6	11702	11707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010160	T	6	6	11706	11711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010160	T	6	6	11780	11785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010160	AATTTT	2	12	11795	11806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010160	T	7	7	11803	11809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010160	TTG	2	6	11817	11822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010160	CAT	2	6	11955	11960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010160	TTTTCA	2	12	11961	11972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010160	AT	3	6	11993	11998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010160	ATT	2	6	12128	12133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010160	T	6	6	12132	12137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010160	ATG	2	6	12230	12235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010160	AGTG	2	8	12298	12305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010160	TTATG	2	10	12494	12503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010160	TAT	2	6	12540	12545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010160	ATT	2	6	12548	12553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010160	T	7	7	12557	12563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010160	ATT	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010160	AAC	2	6	12612	12617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010160	AT	4	8	12723	12730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010160	CT	3	6	12733	12738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010160	CTT	2	6	12791	12796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010160	A	8	8	12808	12815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010160	ATT	2	6	12861	12866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010160	ATG	3	9	12893	12901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010160	T	6	6	12905	12910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010160	TTTG	2	8	12918	12925	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010160	TTG	2	6	12969	12974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010160	GGT	2	6	13009	13014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010160	AGG	2	6	13018	13023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010160	AGC	2	6	13544	13549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010160	TAA	2	6	13582	13587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010160	TTG	2	6	18589	18594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010160	ATA	2	6	18598	18603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010160	AG	3	6	18611	18616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010160	ATG	2	6	18643	18648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010160	TTA	2	6	18726	18731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010160	A	7	7	18754	18760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010160	A	6	6	18775	18780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010160	T	6	6	18789	18794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010160	T	6	6	18803	18808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010160	T	6	6	18814	18819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010160	AGT	2	6	18854	18859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010160	A	7	7	18882	18888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010160	AG	3	6	18957	18962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010160	GTT	2	6	19053	19058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010160	ATA	2	6	19085	19090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010160	A	7	7	19107	19113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010160	TAAT	2	8	19119	19126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010160	TGTC	2	8	21862	21869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010160	GGC	2	6	21892	21897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010160	GCC	2	6	21988	21993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_010160	AT	3	6	21995	22000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010160	ATTT	2	8	22012	22019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010160	AAGA	2	8	22038	22045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010160	AAC	2	6	22136	22141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010160	A	6	6	22163	22168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010160	T	7	7	22172	22178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010160	T	6	6	22180	22185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010160	T	7	7	22203	22209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010160	A	6	6	22234	22239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010160	TAA	2	6	22262	22267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010160	TAA	2	6	22270	22275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010160	GTT	2	6	22282	22287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010160	TAT	2	6	22298	22303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010160	GAA	2	6	22312	22317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010160	TTGTG	2	10	22335	22344	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010160	CAT	2	6	22353	22358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_010160	TCA	2	6	22894	22899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_010160	CTC	2	6	22944	22949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_010160	ATCA	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.