MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella canis ATCC 23365 chromosome II

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010104	CCTTGT	2	12	14385	14396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010104	TTCTCG	2	12	24349	24360	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010104	GTGCTG	2	12	82192	82203	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010104	CTTTCG	2	12	82462	82473	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010104	GTGCTG	2	12	156375	156386	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010104	ACGCTG	2	12	157283	157294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010104	CTGACG	2	12	157880	157891	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010104	GCCTAT	2	12	158567	158578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010104	GAAAAG	2	12	168858	168869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010104	TGTCAG	2	12	175669	175680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010104	GAAGCC	2	12	205894	205905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010104	TTCCGG	2	12	206476	206487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010104	GGGATT	2	12	217660	217671	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010104	CTGGTG	2	12	276814	276825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010104	TGGCGC	2	12	318614	318625	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010104	GATATC	2	12	318908	318919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010104	TGGCTG	2	12	319045	319056	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010104	GAAGGA	2	12	322334	322345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010104	ACGGCA	2	12	375911	375922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010104	AAATAA	2	12	398321	398332	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010104	GCGCAG	2	12	456062	456073	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010104	TGAAAA	2	12	528170	528181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010104	GAGCTA	2	12	538971	538982	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010104	TCAAAA	2	12	539213	539224	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010104	GCAGCC	2	12	613773	613784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010104	TGTTCA	2	12	637608	637619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010104	TCACAA	2	12	684816	684827	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010104	ACGGCG	2	12	692334	692345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010104	AAAAGG	2	12	706499	706510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010104	CTCCTT	3	18	722091	722108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010104	GCCTTT	2	12	741897	741908	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010104	AAAGGA	2	12	746922	746933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010104	AAAGAT	2	12	751887	751898	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010104	GCTGAT	2	12	754962	754973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010104	TGACCG	2	12	800339	800350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010104	TTGTCG	2	12	800584	800595	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010104	ATATGC	2	12	801765	801776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010104	CGCTTG	2	12	839520	839531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010104	ATCTCA	2	12	848471	848482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010104	AGCCGA	2	12	888605	888616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010104	TTATGG	2	12	891217	891228	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010104	AAGCCG	2	12	986276	986287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010104	TCGCCA	2	12	987467	987478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010104	CGGAAA	2	12	1026751	1026762	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010104	TACCAA	2	12	1082989	1083000	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010104	CCGGAA	2	12	1093587	1093598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010104	CTGCCG	2	12	1109583	1109594	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010104	AACCGG	2	12	1139638	1139649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010104	GGCAGC	2	12	1139957	1139968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010104	GACGCT	2	12	1141537	1141548	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010104	CGGTGC	2	12	1142698	1142709	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010104	AATTTC	2	12	1142759	1142770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010104	GCACCG	2	12	1143798	1143809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010104	CGGCAC	2	12	1144660	1144671	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010104	AGCTTC	2	12	1144790	1144801	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010104	ACGATC	2	12	1146960	1146971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010104	AAATCG	2	12	1157089	1157100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010104	TCGCCA	2	12	1197765	1197776	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010104	GAGGAA	2	12	1206784	1206795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.