MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella canis ATCC 23365 chromosome II

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010104	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010104	CCCCG	2	10	13906	13915	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_010104	AGCGG	2	10	22104	22113	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010104	CGGCC	2	10	24380	24389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_010104	ATCCG	2	10	24827	24836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010104	GGCCT	2	10	37497	37506	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010104	ATGAA	2	10	40068	40077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010104	TTTGT	2	10	41229	41238	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010104	CGCTC	2	10	43438	43447	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010104	TGCGG	2	10	60813	60822	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010104	TATCT	2	10	73064	73073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010104	TCGGT	2	10	81773	81782	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010104	TTCTC	2	10	81802	81811	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010104	CGCGG	2	10	82010	82019	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010104	TCTGC	2	10	83156	83165	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010104	ACTTG	2	10	87330	87339	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010104	CGGTA	2	10	97203	97212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010104	CCAAG	2	10	97378	97387	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010104	CTTGC	2	10	108037	108046	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010104	CCTGC	2	10	112711	112720	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010104	GCCCG	2	10	115971	115980	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_010104	GCACA	2	10	117262	117271	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010104	GTTCG	2	10	117283	117292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010104	GAAAA	2	10	119215	119224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010104	CGATA	2	10	121441	121450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010104	GCCCG	2	10	121855	121864	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_010104	AGATA	2	10	134607	134616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010104	CCGGG	2	10	152394	152403	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010104	CGGAT	2	10	159751	159760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010104	TGGGC	2	10	159882	159891	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010104	TGTTT	2	10	160335	160344	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010104	CCCGT	2	10	161060	161069	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_010104	GCCGA	2	10	175250	175259	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010104	GCCCC	2	10	175277	175286	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
35	NC_010104	GGATA	2	10	188171	188180	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010104	TGACG	2	10	191917	191926	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010104	AGCAG	2	10	203683	203692	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010104	TTTTG	2	10	209266	209275	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010104	ATCAA	2	10	209435	209444	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010104	TGAAA	2	10	209445	209454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010104	TAAGT	2	10	214525	214534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010104	CGCTG	2	10	253319	253328	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_010104	GGCGG	2	10	288447	288456	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010104	GCTTT	2	10	305033	305042	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010104	GCCGG	2	10	320056	320065	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010104	TTTGT	2	10	323024	323033	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010104	GGTGG	2	10	340524	340533	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010104	CTCCC	2	10	347004	347013	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
49	NC_010104	GCGCC	2	10	347299	347308	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_010104	AGGGC	2	10	347479	347488	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010104	AAAAC	2	10	347665	347674	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010104	TGCGC	2	10	361437	361446	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010104	GGCAT	2	10	361503	361512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010104	TTTGT	2	10	365288	365297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010104	GCTTC	2	10	374982	374991	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010104	GGTGC	2	10	375734	375743	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010104	GCGCC	2	10	382245	382254	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_010104	TGGAG	2	10	408802	408811	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010104	TCATA	2	10	409893	409902	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010104	GCCCA	2	10	411404	411413	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_010104	AGCAA	2	10	416255	416264	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010104	GCCGG	2	10	423879	423888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010104	ATAAA	2	10	428869	428878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010104	CGGAA	2	10	442946	442955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010104	GCGCC	2	10	447997	448006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_010104	GGCAA	2	10	450276	450285	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010104	AGTGA	2	10	450869	450878	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010104	ATCCC	2	10	455448	455457	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_010104	AAAGC	2	10	475297	475306	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010104	ACTGG	2	10	502195	502204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_010104	CGGCC	2	10	511208	511217	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_010104	ATTCA	2	10	522342	522351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010104	TCGCA	2	10	531886	531895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_010104	TCATT	2	10	539378	539387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010104	AGCGG	2	10	572782	572791	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010104	ACAAA	2	10	575088	575097	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010104	TTTGC	2	10	599003	599012	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010104	ATTTC	2	10	601835	601844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010104	GCAGA	2	10	605731	605740	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010104	GCCTT	2	10	607178	607187	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_010104	GTTTT	2	10	617574	617583	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010104	ACAAA	2	10	629151	629160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010104	TCGCT	2	10	635669	635678	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010104	ACGGC	2	10	691934	691943	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010104	TTACG	2	10	708000	708009	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010104	TCAGG	2	10	719260	719269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010104	TTCCC	2	10	742401	742410	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_010104	CCCTG	2	10	751975	751984	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_010104	ATTAT	2	10	753103	753112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010104	ATATT	2	10	753116	753125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010104	CATGA	2	10	754633	754642	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010104	GGCCG	2	10	755178	755187	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010104	TCAAA	2	10	777627	777636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010104	ACAAA	2	10	781113	781122	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010104	TCCCC	2	10	789904	789913	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_010104	CATTC	2	10	803951	803960	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_010104	GCAGT	2	10	819909	819918	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010104	TCCGA	2	10	830198	830207	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_010104	TGCGA	2	10	832565	832574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010104	GCCGC	2	10	838794	838803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_010104	ACGCC	2	10	839077	839086	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_010104	GCACC	2	10	839788	839797	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_010104	GGCAA	2	10	840227	840236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010104	AGAGG	2	10	842784	842793	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010104	CAATT	2	10	867916	867925	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010104	CGTAT	2	10	867927	867936	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010104	GAAAA	2	10	873101	873110	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010104	GGTTT	2	10	881036	881045	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010104	TGATA	2	10	888012	888021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010104	CCCTC	2	10	910753	910762	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
111	NC_010104	AAATC	2	10	914997	915006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010104	ACAAA	2	10	921485	921494	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010104	GGTGG	2	10	949874	949883	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010104	CATGG	2	10	953642	953651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010104	CCGGG	4	20	953652	953671	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010104	GCCTC	2	10	953711	953720	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_010104	GCCTG	2	10	954203	954212	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010104	GGAAC	2	10	963223	963232	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010104	AGGCC	2	10	968395	968404	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010104	CGCGC	3	15	971610	971624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_010104	CCCTT	2	10	973051	973060	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_010104	CTGCG	2	10	986467	986476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_010104	GCGGA	2	10	988074	988083	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010104	CCCCG	2	10	988759	988768	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_010104	TAAAA	2	10	992835	992844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010104	AGCGA	2	10	1023599	1023608	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010104	CGCTT	2	10	1033440	1033449	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010104	TGCGC	2	10	1037151	1037160	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010104	CGCCT	2	10	1052797	1052806	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_010104	ATTAA	2	10	1054205	1054214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010104	AACCG	2	10	1056033	1056042	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010104	TTTTC	2	10	1066160	1066169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010104	GTTGA	2	10	1072408	1072417	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010104	GATCG	2	10	1083503	1083512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010104	GCGCT	2	10	1093401	1093410	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010104	CTATT	2	10	1094565	1094574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010104	GAAAG	2	10	1101134	1101143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010104	TTTTC	2	10	1101473	1101482	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010104	TTCAA	2	10	1104893	1104902	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010104	CCTCT	2	10	1104911	1104920	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_010104	GCTGT	2	10	1106522	1106531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010104	CGAAG	2	10	1107335	1107344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010104	AGCCC	2	10	1107889	1107898	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_010104	CACGA	2	10	1108034	1108043	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_010104	TTATT	2	10	1113831	1113840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010104	TGCGG	2	10	1135379	1135388	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010104	CGGCG	2	10	1138396	1138405	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_010104	GCGTC	2	10	1143231	1143240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_010104	GCAAC	2	10	1143858	1143867	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_010104	CAGCG	2	10	1144258	1144267	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_010104	AGCCC	2	10	1144385	1144394	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
152	NC_010104	TGATC	2	10	1144834	1144843	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_010104	TTCTG	2	10	1150057	1150066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_010104	CGATG	2	10	1159211	1159220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_010104	GGAAG	2	10	1182196	1182205	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010104	AAAGC	2	10	1193783	1193792	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_010104	GCTTT	2	10	1193798	1193807	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_010104	ACGGC	2	10	1194068	1194077	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
159	NC_010104	GATCG	2	10	1199890	1199899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_010104	GCGCC	2	10	1200058	1200067	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.