MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 chromosome 2

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010086	ATATTT	2	12	7429	7440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010086	GCTCGC	2	12	7804	7815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010086	GAATGC	2	12	33223	33234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010086	TGCAGG	2	12	122922	122933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010086	GCGCCG	2	12	128258	128269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010086	CCGGCG	2	12	133655	133666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010086	TGCGCG	2	12	133699	133710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010086	TCGGCT	2	12	133791	133802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010086	TTCCGT	2	12	195227	195238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010086	CACCGC	2	12	198959	198970	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010086	GCCGCG	2	12	200965	200976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010086	CGATCG	2	12	213626	213637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010086	AGGCGC	2	12	255496	255507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010086	AGAGCA	2	12	272295	272306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010086	TCGCAG	2	12	330456	330467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010086	GCGTGC	2	12	348964	348975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010086	GCGGCC	2	12	350263	350274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010086	CGCTGC	2	12	361001	361012	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010086	CGTGCT	2	12	368765	368776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010086	GGATTC	2	12	388882	388893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010086	CGGGCG	2	12	403395	403406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010086	CTGTAG	2	12	424718	424729	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010086	CGCGAA	2	12	445342	445353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010086	CATCGC	2	12	445438	445449	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010086	ATCGAC	2	12	462725	462736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010086	GGCGCG	2	12	466929	466940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010086	TCAGCA	2	12	496845	496856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010086	GCCGGT	2	12	518581	518592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010086	CTGCCG	2	12	524381	524392	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010086	CGCGTG	2	12	526372	526383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010086	GTGCGC	2	12	543413	543424	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010086	CGATTG	2	12	587901	587912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010086	CGCTGC	2	12	638130	638141	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010086	CGACAG	2	12	698722	698733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010086	CGAATG	2	12	752237	752248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010086	CGCGAA	2	12	790961	790972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010086	GCCCGC	2	12	803650	803661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010086	AGGCAG	2	12	819325	819336	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010086	GAGCAA	2	12	819937	819948	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010086	CGCTGA	2	12	824454	824465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010086	TTGATT	2	12	887709	887720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010086	AGCCGA	19	114	896614	896727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010086	GCCGAT	2	12	951762	951773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010086	TCCGGT	2	12	975883	975894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010086	CTATCG	2	12	975915	975926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010086	ATATGA	2	12	998041	998052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010086	CGCCGG	2	12	1005863	1005874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010086	GCGCTG	2	12	1017811	1017822	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010086	GCGCGG	2	12	1017823	1017834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010086	TGAACG	2	12	1037741	1037752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010086	GGTCGA	2	12	1039333	1039344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010086	GCGCAG	2	12	1063931	1063942	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010086	CGGGCG	2	12	1132357	1132368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010086	ACGACA	2	12	1134293	1134304	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010086	ACGCGT	2	12	1141779	1141790	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010086	GAACGG	2	12	1157488	1157499	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010086	CTTTTG	2	12	1185068	1185079	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010086	ATCGCG	2	12	1187047	1187058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010086	CGCATA	2	12	1194836	1194847	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010086	CCGCGC	2	12	1200354	1200365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010086	GAATCG	2	12	1216620	1216631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010086	GTGCGC	2	12	1223818	1223829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010086	ACGGAA	2	12	1284061	1284072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010086	CGAAAA	2	12	1287305	1287316	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010086	CGCGGA	2	12	1291248	1291259	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010086	TCCGCC	2	12	1308018	1308029	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010086	GTATGC	2	12	1314141	1314152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010086	ACGCGC	2	12	1364116	1364127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010086	ACCTCG	2	12	1415504	1415515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010086	GTTCAA	2	12	1432006	1432017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010086	CGAAAC	2	12	1480114	1480125	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010086	CAGAAA	2	12	1480909	1480920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010086	CGCGCC	2	12	1481909	1481920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010086	CGGGTG	2	12	1491723	1491734	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010086	CGTCTG	2	12	1558731	1558742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010086	GCCCGC	2	12	1622087	1622098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010086	TCCGCG	2	12	1632507	1632518	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010086	ATGCGC	2	12	1635042	1635053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010086	GCGCCG	2	12	1651143	1651154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010086	CGGTTC	2	12	1658917	1658928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010086	TCTCCT	2	12	1681131	1681142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010086	CTTCGT	2	12	1688913	1688924	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010086	TGCGAC	4	24	1703051	1703074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010086	CGCGCC	2	12	1708098	1708109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010086	CGCTGC	2	12	1717966	1717977	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010086	TTCGGC	2	12	1795581	1795592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010086	ATCCGC	2	12	1795750	1795761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010086	TCCGTT	2	12	1797174	1797185	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010086	CGACGC	2	12	1800302	1800313	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010086	CCGTCG	2	12	1846206	1846217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010086	TGATCG	2	12	1846632	1846643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010086	TCCCAT	2	12	1871346	1871357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010086	GCTCCT	2	12	1914715	1914726	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010086	CCGACC	2	12	1929831	1929842	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010086	TTGCCC	2	12	1937318	1937329	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010086	GGAGGC	2	12	1962678	1962689	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010086	TCGATC	2	12	1974690	1974701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010086	CCCGCA	2	12	1979816	1979827	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010086	CACGCG	2	12	1999359	1999370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010086	GCGAGA	3	18	2019536	2019553	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010086	CCGGTT	2	12	2025562	2025573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010086	CGAACG	2	12	2026765	2026776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010086	AACGGC	2	12	2091670	2091681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010086	TGCATA	2	12	2101502	2101513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010086	CACGAC	2	12	2110124	2110135	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010086	CAACCG	2	12	2117280	2117291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010086	CGCGTT	2	12	2200297	2200308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010086	TCCTGA	2	12	2214661	2214672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010086	ATATCG	2	12	2240697	2240708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010086	GACGCC	2	12	2253051	2253062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010086	CGAACG	2	12	2257912	2257923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010086	ATGACG	2	12	2263053	2263064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010086	TGCGCG	2	12	2277575	2277586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010086	TAACGT	2	12	2298280	2298291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010086	TGCCGC	2	12	2348256	2348267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010086	CGTCGC	2	12	2352613	2352624	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010086	CGGCCG	2	12	2356017	2356028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010086	ATTTCT	2	12	2365520	2365531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010086	AAAACG	2	12	2375047	2375058	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010086	ACGATG	2	12	2397597	2397608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010086	CCGCTT	2	12	2415176	2415187	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010086	GCACCG	2	12	2419546	2419557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010086	CCGGCT	2	12	2440406	2440417	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.