MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens FZB42

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009725	TTTGAA	2	12	17250	17261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009725	TCATAT	2	12	65428	65439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009725	AGTCAA	2	12	102144	102155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009725	AGGTAT	2	12	166826	166837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009725	TTTATA	2	12	206046	206057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009725	CAAAGT	2	12	230127	230138	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009725	GAGAAT	2	12	272524	272535	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009725	GATAAA	2	12	321256	321267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009725	ATTGAT	2	12	322662	322673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009725	ACGATT	2	12	334105	334116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009725	ATATCA	2	12	337516	337527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009725	TGATAA	2	12	403505	403516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009725	TTTTTC	2	12	435823	435834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009725	AAACGG	2	12	462464	462475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009725	AATAAA	2	12	464583	464594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009725	CGGCTC	2	12	477591	477602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009725	AAATAA	2	12	517083	517094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009725	TAAAGA	2	12	521941	521952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009725	ATCCTC	2	12	529872	529883	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009725	ATGTGA	2	12	569478	569489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009725	ATTAAT	2	12	625287	625298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009725	AAAAGG	2	12	640185	640196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009725	TCAATC	2	12	656630	656641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009725	CTTTCT	2	12	668877	668888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009725	TTTCTC	2	12	688825	688836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009725	AAATGA	2	12	716912	716923	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009725	GGTACA	2	12	729881	729892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009725	GTTTAC	2	12	753427	753438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009725	ATTTTT	2	12	760161	760172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009725	TTTTTC	2	12	810135	810146	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009725	CTTTTT	2	12	817529	817540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009725	GGATTT	2	12	818078	818089	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009725	TAAAAA	2	12	819898	819909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009725	TTTTTA	2	12	838558	838569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009725	TCATTT	2	12	851845	851856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009725	CTTTTT	2	12	860321	860332	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009725	AAAAAG	2	12	871946	871957	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009725	TTATAT	2	12	882626	882637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009725	GTGCTG	2	12	885477	885488	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009725	CATCTT	2	12	887328	887339	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009725	CCTTTC	2	12	919311	919322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009725	ATGAAA	2	12	920048	920059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009725	CGCCTC	2	12	989968	989979	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009725	ATGCTC	2	12	1021393	1021404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009725	ATAATG	2	12	1031998	1032009	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009725	TCTTTT	2	12	1038121	1038132	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009725	GAAAAA	2	12	1041150	1041161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009725	GAAAAG	2	12	1046983	1046994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009725	TTACTA	2	12	1052144	1052155	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009725	TTTTGT	2	12	1191721	1191732	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009725	GTTAAC	2	12	1207361	1207372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009725	TAATTG	2	12	1338016	1338027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009725	ATCATT	2	12	1351422	1351433	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009725	ATCATT	2	12	1354662	1354673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009725	CCGTAA	2	12	1390408	1390419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009725	TCAAAC	2	12	1469448	1469459	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009725	CTTTTT	2	12	1513836	1513847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009725	TATTGA	2	12	1550991	1551002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009725	TCCGGT	2	12	1591813	1591824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009725	TTTGTT	2	12	1666068	1666079	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009725	TAGCCG	2	12	1778998	1779009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009725	CCGAAT	2	12	1779160	1779171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009725	CCCGAA	2	12	1779180	1779191	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009725	AAAATA	2	12	1787050	1787061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009725	GATATA	2	12	1832965	1832976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009725	TAAAAA	2	12	1832985	1832996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009725	TAAAAT	2	12	1848001	1848012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009725	CTCTAT	2	12	1865034	1865045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009725	ATAAAA	2	12	1973560	1973571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009725	AAGAGA	2	12	1973637	1973648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009725	TATAAC	2	12	1991746	1991757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009725	CGTATT	2	12	1992943	1992954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009725	TACACA	2	12	1993074	1993085	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009725	CTTTTT	2	12	2016486	2016497	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009725	CCTTCC	2	12	2046557	2046568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009725	ATCCGT	2	12	2072381	2072392	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009725	CTTTTT	2	12	2086349	2086360	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009725	TAATGC	2	12	2090605	2090616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009725	AAATAA	2	12	2121985	2121996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009725	ATCAAA	2	12	2194269	2194280	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009725	ATAAAA	2	12	2346368	2346379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009725	CGTCAT	2	12	2361520	2361531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009725	ATATTT	2	12	2365612	2365623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009725	AACGGA	2	12	2386512	2386523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009725	CAATCT	2	12	2409745	2409756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009725	ACCGTT	2	12	2415417	2415428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009725	TGAAAA	2	12	2418249	2418260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009725	TTCTAA	2	12	2469430	2469441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009725	TGACTT	2	12	2495548	2495559	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009725	GAAGCA	2	12	2517392	2517403	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009725	AATAAA	2	12	2529899	2529910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009725	TTCTCC	2	12	2543046	2543057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009725	GAATCA	2	12	2652228	2652239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009725	CCCTCT	2	12	2671514	2671525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009725	CTCTTT	2	12	2718317	2718328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009725	CTTATA	2	12	2731419	2731430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009725	TTTAAG	2	12	2745123	2745134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009725	GGAAAA	2	12	2760830	2760841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009725	CTTATC	2	12	2812722	2812733	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009725	CTAAAA	2	12	2852733	2852744	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009725	TTAAGA	2	12	2935024	2935035	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009725	CTTCAT	2	12	2965356	2965367	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009725	CCCGAA	2	12	2982880	2982891	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009725	ATTATC	2	12	3033015	3033026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009725	CCGCGG	2	12	3040521	3040532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009725	ATTTTA	2	12	3043418	3043429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009725	TAAATG	2	12	3118875	3118886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009725	TAATGA	2	12	3156809	3156820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009725	GAAAAA	2	12	3174155	3174166	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009725	AATAAC	2	12	3254497	3254508	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_009725	GAGAAA	2	12	3305183	3305194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009725	TTTCTT	2	12	3308794	3308805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009725	TTTCAT	2	12	3343727	3343738	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009725	TCTTAT	2	12	3370082	3370093	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009725	CAATCA	2	12	3406467	3406478	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009725	AAAGCA	2	12	3429108	3429119	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009725	GATGAA	2	12	3438541	3438552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009725	TCATTT	2	12	3453389	3453400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009725	CTACCA	2	12	3457327	3457338	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009725	GCATAA	2	12	3463595	3463606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009725	ATTCCC	2	12	3465923	3465934	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009725	AAAATA	2	12	3495371	3495382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009725	CAAAAA	2	12	3567664	3567675	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009725	ACATAT	2	12	3567714	3567725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009725	ATCTCC	2	12	3587873	3587884	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009725	CAAAAA	2	12	3588004	3588015	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009725	AATATA	2	12	3660030	3660041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.