MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens FZB42

Total Repeats: 466

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009725	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009725	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009725	TCGTG	2	10	10838	10847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009725	GGACG	2	10	11539	11548	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009725	CCTTT	2	10	15591	15600	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009725	GAAAT	2	10	23238	23247	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009725	TCGTG	2	10	32402	32411	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009725	GGACG	2	10	33103	33112	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009725	ACAAA	2	10	36203	36212	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009725	TTTTG	2	10	53796	53805	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009725	TAAAG	2	10	64761	64770	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009725	GAAAG	2	10	71106	71115	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009725	TAAAA	2	10	83450	83459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009725	TCGTG	2	10	92258	92267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009725	GGACG	2	10	93017	93026	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009725	TCGTG	2	10	98143	98152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009725	GGACG	2	10	98902	98911	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009725	TTACG	2	10	120654	120663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009725	TAAAA	2	10	121294	121303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009725	TTGTG	2	10	154524	154533	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009725	CGGCC	2	10	159334	159343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009725	TCGTG	2	10	162790	162799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009725	GGACG	2	10	163491	163500	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009725	GTTCA	2	10	166786	166795	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009725	TACAT	2	10	167054	167063	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009725	TCGTG	2	10	167706	167715	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009725	GGACG	2	10	168581	168590	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009725	TCGTG	2	10	173062	173071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009725	GGACG	2	10	173763	173772	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009725	TTTTC	2	10	181605	181614	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009725	TTCCT	2	10	181672	181681	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009725	GATGA	2	10	196911	196920	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009725	ACAAG	2	10	203712	203721	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009725	TATAA	2	10	206101	206110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009725	TTTTC	2	10	206329	206338	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009725	CTTGG	2	10	208394	208403	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009725	GAACA	2	10	215026	215035	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009725	AATAA	2	10	217367	217376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009725	ACAAA	2	10	230146	230155	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009725	AAATT	2	10	231654	231663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009725	TCCTT	2	10	234474	234483	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009725	GCCCG	2	10	236290	236299	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_009725	AGATT	2	10	243583	243592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009725	TTAAT	2	10	245950	245959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009725	AATAA	2	10	248412	248421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009725	TGATA	2	10	248485	248494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009725	GAATA	2	10	251199	251208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009725	TAAAA	2	10	257493	257502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009725	ATAAA	2	10	258089	258098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009725	CAAAA	2	10	258417	258426	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009725	TAATT	2	10	259643	259652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009725	CGTTT	2	10	259711	259720	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009725	CTTTT	2	10	267108	267117	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009725	GAGAA	2	10	271667	271676	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009725	AAATG	2	10	311161	311170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009725	TTATG	2	10	368852	368861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009725	GGGAA	2	10	371794	371803	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009725	TATCA	2	10	373878	373887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009725	AGGGA	2	10	424064	424073	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009725	ATCGG	2	10	424614	424623	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009725	AAGAA	2	10	442860	442869	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009725	CTATA	2	10	444149	444158	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009725	ACGGG	2	10	454317	454326	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009725	TGCTG	2	10	454544	454553	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009725	TTTTA	2	10	458820	458829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009725	AAAAT	2	10	460209	460218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009725	AGGAA	2	10	476354	476363	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009725	CTGAG	2	10	481383	481392	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009725	ATAAA	2	10	482858	482867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009725	CTTGA	2	10	504833	504842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009725	TTTTG	2	10	504859	504868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009725	CATGT	2	10	505392	505401	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009725	TGAAA	2	10	517052	517061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009725	TGATA	2	10	521297	521306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009725	AGATT	2	10	522145	522154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009725	AACTT	2	10	522772	522781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009725	CATGT	2	10	527782	527791	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009725	AAATC	2	10	529968	529977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009725	AAGAT	2	10	535518	535527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009725	AGAAA	2	10	537887	537896	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009725	GATGC	2	10	541643	541652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009725	TATCT	2	10	545535	545544	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009725	AAACA	2	10	552818	552827	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009725	GAGAG	2	10	555764	555773	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009725	TCGTA	2	10	574302	574311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009725	AAAGG	2	10	577515	577524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009725	TCCGC	2	10	581778	581787	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_009725	CCGCT	2	10	587045	587054	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_009725	CAAAA	2	10	591566	591575	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009725	TTTTC	2	10	591634	591643	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009725	TAAAA	2	10	598243	598252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009725	ATTCA	2	10	601622	601631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009725	TCGTG	2	10	606133	606142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009725	GGACG	2	10	606834	606843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009725	AAACG	2	10	610070	610079	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009725	AAAAG	2	10	625399	625408	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009725	TACTG	2	10	625914	625923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009725	GATGA	2	10	640207	640216	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009725	ATTGA	2	10	656522	656531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009725	GCGGG	2	10	659414	659423	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009725	AGGAA	2	10	681748	681757	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009725	GCAAG	2	10	699196	699205	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009725	TGAGA	2	10	708132	708141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009725	ATTGT	2	10	708303	708312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009725	CAACC	2	10	712278	712287	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_009725	AGCTA	2	10	730287	730296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009725	GGCGG	2	10	758123	758132	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009725	GATGC	2	10	758230	758239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009725	AATCA	2	10	758485	758494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009725	ACAAA	2	10	760301	760310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009725	TTCAA	2	10	786617	786626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009725	ATCAG	2	10	791965	791974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009725	AATTA	2	10	802008	802017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009725	AGAGC	2	10	810166	810175	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009725	ATGAA	2	10	816691	816700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009725	TCCCA	2	10	817479	817488	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_009725	TAAAA	2	10	833322	833331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009725	AAAAG	2	10	833354	833363	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009725	ATAAA	2	10	833501	833510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009725	TGATA	2	10	838858	838867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009725	TTATA	2	10	851827	851836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009725	TTTTC	2	10	855060	855069	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009725	AAGGA	2	10	858079	858088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009725	CCTTT	2	10	859074	859083	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009725	TCGTG	2	10	877254	877263	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009725	GGACG	2	10	877955	877964	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009725	TATTT	2	10	881934	881943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009725	GTTTC	2	10	897432	897441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009725	TAAAG	2	10	920032	920041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009725	GGGGA	2	10	920065	920074	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009725	GTGAT	2	10	921786	921795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009725	CCGCT	2	10	928812	928821	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_009725	ATAAA	2	10	940012	940021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009725	ATGTT	2	10	947285	947294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009725	AAGTC	2	10	947519	947528	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009725	ATATT	2	10	949455	949464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009725	GGAAG	2	10	953387	953396	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009725	CGGCG	2	10	959424	959433	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_009725	GACAA	2	10	965496	965505	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009725	ATGAT	2	10	966654	966663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009725	AAAAG	2	10	966665	966674	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009725	AGTGG	2	10	980941	980950	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009725	TTTTG	2	10	988912	988921	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009725	AAATT	2	10	998796	998805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009725	ATTAC	2	10	999503	999512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009725	TTTTC	2	10	1001274	1001283	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009725	AATAA	2	10	1001296	1001305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009725	CAAAA	2	10	1004509	1004518	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.