MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella ovis ATCC 25840 chromosome I

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009505	ACGGTT	2	12	35683	35694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009505	GCATCG	2	12	74322	74333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009505	GAGCCG	2	12	74360	74371	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009505	ATGCCG	2	12	76777	76788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009505	GCTGCC	2	12	78023	78034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009505	CGCGGG	2	12	78051	78062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009505	TTTTGC	2	12	95074	95085	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009505	GCTTTT	2	12	103852	103863	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009505	AAGGGC	2	12	124985	124996	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009505	GCCGAG	2	12	162862	162873	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009505	GGGGAA	2	12	170075	170086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009505	TCTGGC	2	12	186469	186480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009505	CCAGTG	2	12	209369	209380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009505	AGGGGA	2	12	245332	245343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009505	CAGGTG	2	12	246530	246541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009505	CCGCAG	2	12	267211	267222	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009505	GGGCGA	2	12	267831	267842	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009505	GGTGTA	2	12	268797	268808	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009505	CTCCCG	2	12	274242	274253	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009505	CACGCG	2	12	279689	279700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009505	ACGCGC	2	12	279810	279821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009505	GAAGCC	2	12	288154	288165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009505	GCTTCC	2	12	293286	293297	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009505	CTGATG	2	12	296354	296365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009505	GGCACA	2	12	306771	306782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009505	CTGACG	2	12	324604	324615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009505	CGGAAT	2	12	336419	336430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009505	ATGCCG	2	12	349438	349449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009505	CGAAGA	2	12	351821	351832	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009505	CTGAAA	2	12	353254	353265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009505	CTTTTT	2	12	359783	359794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009505	TGATTT	2	12	359802	359813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009505	CTGTCT	2	12	364861	364872	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009505	ATCGAC	2	12	383546	383557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009505	ACCTGG	2	12	387264	387275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009505	CGGGCG	2	12	391882	391893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009505	TTGCAA	2	12	399044	399055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009505	CAGCGC	2	12	407748	407759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009505	CTGCAC	2	12	412275	412286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009505	TTTAAC	2	12	455025	455036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009505	CCGCAT	2	12	455915	455926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009505	GAAGGC	2	12	488562	488573	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009505	TATCAA	2	12	508400	508411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009505	GGTCAT	2	12	510670	510681	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009505	CGTTTT	2	12	528369	528380	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009505	CGTCAC	2	12	536178	536189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009505	ATGACC	2	12	537280	537291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009505	GATATT	2	12	555943	555954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009505	TTACGT	2	12	578549	578560	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009505	CATCGA	2	12	581148	581159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009505	GCATGG	2	12	604289	604300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009505	AAGGAC	2	12	604460	604471	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009505	TTTTCG	2	12	608139	608150	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009505	GCCTAT	2	12	609339	609350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009505	AAACGT	2	12	646187	646198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009505	TCCAAA	2	12	646330	646341	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009505	CGGTGC	2	12	652782	652793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009505	TCGCCG	2	12	661955	661966	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009505	GCCGGA	2	12	682185	682196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009505	ATTTGT	2	12	683262	683273	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009505	CAAGAA	2	12	763133	763144	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009505	ATTGAA	2	12	776174	776185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009505	CTTTTC	2	12	792146	792157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009505	AAAGTT	2	12	801547	801558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009505	TCGCGC	2	12	832779	832790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009505	GAAATT	2	12	926842	926853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009505	GCTGAT	2	12	1007437	1007448	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009505	AAGCGC	2	12	1010234	1010245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009505	TTTCCT	2	12	1018783	1018794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009505	GGATGG	2	12	1018963	1018974	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009505	CGCCAG	2	12	1019344	1019355	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009505	TATTTT	2	12	1026784	1026795	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009505	TGGCGG	2	12	1029215	1029226	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009505	ATTTCG	2	12	1029607	1029618	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009505	ACGGTC	2	12	1063753	1063764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009505	ATCGTG	2	12	1063766	1063777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009505	AGCGGC	2	12	1071085	1071096	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009505	CTCTTC	2	12	1077856	1077867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009505	CTGATC	2	12	1127638	1127649	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009505	AAAGAG	2	12	1128089	1128100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009505	TTTTCC	2	12	1145045	1145056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009505	CCATGA	2	12	1170223	1170234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009505	CAAAAA	2	12	1185815	1185826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009505	ACCGCC	2	12	1236799	1236810	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009505	GCCGAC	2	12	1246491	1246502	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009505	GCCTGC	2	12	1286418	1286429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009505	TCAATT	2	12	1289930	1289941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009505	CGTTTC	2	12	1298793	1298804	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009505	CACCGC	2	12	1299846	1299857	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009505	AAAACA	2	12	1300035	1300046	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009505	GGCATG	2	12	1306170	1306181	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009505	GCATCG	2	12	1308855	1308866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009505	TGGAAC	2	12	1320265	1320276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009505	TTCAAA	2	12	1321952	1321963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009505	GTTTTC	2	12	1326112	1326123	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009505	AAAGCG	2	12	1339278	1339289	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009505	ATAGCC	2	12	1339528	1339539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009505	ATTGCC	2	12	1377447	1377458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009505	GTAAAA	2	12	1410230	1410241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009505	GCATTT	2	12	1416177	1416188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009505	GATCGC	2	12	1419790	1419801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009505	CGGTCA	2	12	1427859	1427870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009505	GGAACT	2	12	1428124	1428135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009505	CCTTGA	2	12	1428860	1428871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009505	ATGCCA	2	12	1444205	1444216	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009505	GAGAAT	2	12	1449206	1449217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009505	CTGAAA	2	12	1455125	1455136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009505	GCTCTG	2	12	1478538	1478549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009505	TGACCA	2	12	1496501	1496512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009505	CATCAC	2	12	1538143	1538154	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009505	AAAAGC	2	12	1551005	1551016	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009505	CGCTGG	2	12	1566415	1566426	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009505	GCTTGC	2	12	1566446	1566457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009505	CTGCCG	2	12	1598496	1598507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009505	AATGCC	2	12	1657180	1657191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009505	CCTTGC	2	12	1696893	1696904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009505	GGCGGT	2	12	1696915	1696926	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009505	TTATCG	2	12	1697683	1697694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009505	GCCCTT	2	12	1704576	1704587	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009505	CGCTGG	2	12	1715031	1715042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009505	GGCATA	2	12	1721377	1721388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009505	TCAGCG	2	12	1756136	1756147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009505	ATGAAA	2	12	1756843	1756854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009505	ATGGCG	2	12	1757116	1757127	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009505	CAAAAA	2	12	1786468	1786479	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009505	CTGCCG	2	12	1799646	1799657	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009505	CCATGC	2	12	1830134	1830145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009505	CATAGG	2	12	1830520	1830531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009505	ATCGAT	2	12	1830839	1830850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_009505	AGAAAC	2	12	1845739	1845750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009505	AACTCA	2	12	1861872	1861883	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009505	ACGTAA	2	12	1865364	1865375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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134	NC_009505	CCAACA	2	12	1943568	1943579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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136	NC_009505	ATAAGG	2	12	1972841	1972852	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.