MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella ovis ATCC 25840 chromosome II

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009504	TTTTCG	2	12	2123	2134	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009504	GCATCG	2	12	22565	22576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009504	TCGGCG	2	12	22621	22632	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009504	CCGGTT	2	12	30508	30519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009504	GCCAGC	2	12	45681	45692	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009504	CTTTCG	2	12	82134	82145	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009504	GGCTAT	2	12	105118	105129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009504	GCGCTG	2	12	129396	129407	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009504	GATGCC	2	12	144732	144743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009504	TGCCGG	2	12	145039	145050	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009504	TGTCAG	2	12	175026	175037	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009504	GCGAGC	2	12	181591	181602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009504	GGCAGG	2	12	262958	262969	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009504	CTGGTG	2	12	276222	276233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009504	GCCGAT	2	12	284016	284027	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009504	ACGCCG	2	12	285335	285346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009504	GGATGT	2	12	288285	288296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009504	TTTTAA	2	12	301501	301512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009504	GAAGGA	2	12	321351	321362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009504	CCGGAT	2	12	323571	323582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009504	GGGCTG	2	12	356831	356842	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009504	AAATAA	2	12	375743	375754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009504	AGCGCC	2	12	390851	390862	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009504	CTGTTG	2	12	415104	415115	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009504	GAGGCC	2	12	431824	431835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009504	CCGGAA	2	12	432899	432910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009504	ATAGGC	2	12	439239	439250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009504	TTCTTA	2	12	474014	474025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009504	TTTCCC	2	12	494485	494496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009504	TGAAAA	2	12	502572	502583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009504	CTTTGC	2	12	507997	508008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009504	CGTCAC	2	12	512229	512240	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009504	GAGCTA	2	12	540740	540751	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009504	TCAAAA	2	12	540982	540993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009504	AGCATC	2	12	581016	581027	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009504	CGATAT	2	12	606747	606758	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009504	GCAGCC	2	12	615185	615196	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009504	GCCTCG	2	12	629444	629455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009504	GTGATC	2	12	632152	632163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009504	CCGATC	2	12	647052	647063	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009504	TCACAA	2	12	686857	686868	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009504	ACGGCG	2	12	694283	694294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009504	AGTTCG	2	12	705201	705212	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009504	AAAAGG	2	12	708448	708459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009504	CTCCTT	2	12	724036	724047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009504	ATAGTA	2	12	726540	726551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009504	CTGGCG	2	12	731230	731241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009504	ATTGGC	2	12	741628	741639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009504	CACCGG	2	12	741880	741891	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009504	GTAAAG	2	12	748807	748818	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009504	CCAGCG	2	12	766768	766779	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009504	TCGCCC	2	12	814310	814321	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009504	CCAGCA	2	12	846833	846844	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009504	ATCTCA	2	12	850898	850909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009504	CATCGG	2	12	854776	854787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009504	GCGCAG	2	12	855080	855091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009504	GACTGT	2	12	864406	864417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009504	TTATGG	2	12	893580	893591	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009504	ATCGTC	2	12	956997	957008	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009504	TGACCT	2	12	983851	983862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009504	CCAGCG	2	12	984313	984324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009504	TATCGA	2	12	988638	988649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009504	CGGAAA	2	12	1029982	1029993	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009504	TGATCT	2	12	1036607	1036618	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009504	CTGCCG	2	12	1068194	1068205	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009504	AGCGGC	2	12	1069428	1069439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009504	AAATCG	2	12	1115073	1115084	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009504	CCCTTG	2	12	1117693	1117704	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009504	GATAGG	2	12	1123639	1123650	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009504	GCCTCG	2	12	1127236	1127247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009504	TGCCAA	2	12	1133167	1133178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009504	CATTGC	2	12	1139079	1139090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009504	GCTGAT	2	12	1151626	1151637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009504	GAGGAA	2	12	1164204	1164215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.