MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 3559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009485	GTGG	2	8	137	144	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009485	GTCC	2	8	2033	2040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009485	CGGG	2	8	2279	2286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009485	CCAT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009485	GCCT	2	8	12079	12086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009485	GATC	2	8	14769	14776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009485	GATG	2	8	15044	15051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009485	CTCA	2	8	18080	18087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009485	GCCC	2	8	23292	23299	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_009485	CTGG	2	8	24236	24243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009485	AATG	2	8	25136	25143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009485	TTGT	2	8	26574	26581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009485	GGAA	2	8	29192	29199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009485	CCAG	2	8	30954	30961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009485	GGCC	2	8	42368	42375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009485	AGCA	2	8	48498	48505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009485	TAGT	2	8	51973	51980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009485	GCAT	2	8	52910	52917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009485	CGCT	2	8	55091	55098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009485	GCAA	2	8	55433	55440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009485	CCCA	2	8	63571	63578	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009485	GCCT	2	8	63754	63761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009485	TCCC	2	8	71413	71420	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009485	GGCG	2	8	72406	72413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009485	ACAG	2	8	72893	72900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009485	TCGC	2	8	73157	73164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009485	GGCC	2	8	74310	74317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009485	GACC	2	8	75406	75413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009485	TTAT	2	8	75426	75433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009485	GCGA	2	8	79156	79163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009485	CTGC	2	8	84032	84039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009485	CGAT	2	8	86005	86012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009485	TGGA	2	8	90469	90476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009485	ACCG	2	8	90866	90873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009485	CATC	2	8	91763	91770	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009485	CTCC	2	8	98530	98537	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_009485	CGGC	2	8	98905	98912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009485	GCCG	2	8	98919	98926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009485	GCCG	2	8	103126	103133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009485	CGGA	2	8	105894	105901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009485	ATCA	2	8	106359	106366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009485	ATCA	2	8	107952	107959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009485	GCGG	2	8	110045	110052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009485	GATC	2	8	113741	113748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009485	TCGC	2	8	119086	119093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009485	CGAT	2	8	121777	121784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009485	TAGA	2	8	127264	127271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009485	TCGG	2	8	129501	129508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009485	CGGC	2	8	129694	129701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009485	CAGG	2	8	129725	129732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009485	GTTT	2	8	130045	130052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009485	CGAT	2	8	130072	130079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009485	CAAG	2	8	131270	131277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009485	GCAG	2	8	131317	131324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009485	CCGG	2	8	133413	133420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009485	ATCG	2	8	136941	136948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009485	GCCG	2	8	137140	137147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009485	ACGG	2	8	137436	137443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009485	CCGC	2	8	141257	141264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009485	CCGA	2	8	141323	141330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009485	CCCG	2	8	143475	143482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009485	GCCG	2	8	145717	145724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009485	GCCC	2	8	149674	149681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_009485	ACCA	2	8	153939	153946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009485	CTGA	2	8	161412	161419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009485	TCCA	2	8	161495	161502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009485	GACG	2	8	162313	162320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009485	CGAG	2	8	165522	165529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009485	TCCC	2	8	166212	166219	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_009485	GGGC	2	8	174104	174111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009485	GGCG	2	8	174218	174225	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009485	CAGC	2	8	178750	178757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009485	TCGA	2	8	184754	184761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009485	TGCG	2	8	188586	188593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009485	CCGG	2	8	188619	188626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009485	ATTG	2	8	188781	188788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009485	CGAA	2	8	188898	188905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009485	CCCG	2	8	194032	194039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009485	TGAT	2	8	195564	195571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009485	CGGC	2	8	196685	196692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009485	GTCA	2	8	197018	197025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009485	CCCA	2	8	197107	197114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_009485	CGGG	2	8	199166	199173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009485	ACCA	2	8	203753	203760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009485	GGTT	2	8	204449	204456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009485	CGGT	2	8	214094	214101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009485	TTTG	2	8	217245	217252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009485	GTTG	2	8	223892	223899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009485	ACCC	2	8	223926	223933	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_009485	CCGC	2	8	225294	225301	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_009485	AACG	2	8	228062	228069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009485	CAAC	2	8	228072	228079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009485	TCGC	2	8	229255	229262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009485	GTCC	2	8	230300	230307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009485	CGGC	2	8	230679	230686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009485	GATC	2	8	230719	230726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009485	GCCG	2	8	231699	231706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009485	TCGG	2	8	233628	233635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009485	TAAA	2	8	234018	234025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009485	ACGC	2	8	234499	234506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009485	CGTC	2	8	236733	236740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009485	CGAT	2	8	237566	237573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009485	ATGA	2	8	243700	243707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009485	AAAT	2	8	243735	243742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009485	CAGC	2	8	246337	246344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009485	CCAT	2	8	249169	249176	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009485	GATG	2	8	249198	249205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009485	TTGC	2	8	249233	249240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009485	CCGG	2	8	250542	250549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009485	GCCG	2	8	251178	251185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009485	GCGT	2	8	252560	252567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009485	TCGC	2	8	252642	252649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009485	CCAG	2	8	252714	252721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009485	GCCC	2	8	258008	258015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_009485	AATC	2	8	270645	270652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009485	AATC	2	8	270685	270692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009485	GTGC	3	12	272980	272991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009485	GCCG	2	8	276661	276668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009485	CGTG	2	8	276689	276696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009485	CAAG	2	8	277827	277834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009485	CGGC	2	8	279436	279443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009485	GATC	2	8	280877	280884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009485	GGAC	2	8	282604	282611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009485	GTTC	2	8	286984	286991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009485	ACGG	2	8	293938	293945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009485	GCGA	2	8	295274	295281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009485	GAGG	2	8	297307	297314	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009485	AAAG	2	8	297370	297377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009485	GCCG	2	8	303422	303429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009485	TTTG	2	8	307275	307282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009485	GGCC	3	12	310172	310183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009485	GGCC	2	8	315107	315114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009485	TCCG	2	8	326116	326123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009485	TCCA	2	8	329339	329346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009485	GTTC	2	8	339323	339330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009485	GAAA	2	8	339971	339978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009485	AGGG	2	8	343044	343051	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009485	CGGT	2	8	343080	343087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009485	GCAA	2	8	344801	344808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009485	CGAG	2	8	345924	345931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009485	GACG	2	8	350635	350642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009485	ACGA	2	8	350648	350655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009485	AGGG	2	8	350795	350802	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009485	TTTC	2	8	350845	350852	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009485	CGGC	2	8	351587	351594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009485	CAAT	2	8	356892	356899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009485	GCGA	2	8	358926	358933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009485	TCAT	2	8	360758	360765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009485	CGGG	2	8	361975	361982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009485	GCAC	2	8	363714	363721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009485	GCGA	2	8	363760	363767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009485	TGGA	2	8	366404	366411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009485	GCGA	2	8	366422	366429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_009485	TCGC	2	8	1073241	1073248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
483	NC_009485	TGAG	2	8	1079415	1079422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_009485	GTCG	2	8	1082282	1082289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_009485	CGAC	2	8	1082323	1082330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_009485	GCCC	2	8	1084273	1084280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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500	NC_009485	AGCC	2	8	1097982	1097989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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