MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009485	CAT	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009485	GTGG	2	8	137	144	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009485	TCC	2	6	353	358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009485	CCT	2	6	359	364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009485	GC	3	6	437	442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009485	CGC	2	6	488	493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009485	ACC	2	6	539	544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009485	GC	3	6	2003	2008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009485	GTCC	2	8	2033	2040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009485	GCT	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009485	CCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009485	CGGG	2	8	2279	2286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009485	CCAT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009485	CAA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009485	CTT	2	6	3826	3831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009485	AGG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009485	TCG	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009485	CAC	2	6	8095	8100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009485	ACC	2	6	8120	8125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009485	GCC	2	6	8145	8150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009485	GGC	2	6	8156	8161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009485	AGC	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009485	CG	3	6	8243	8248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009485	GGC	2	6	8267	8272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009485	A	6	6	8276	8281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009485	A	7	7	8286	8292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009485	TTC	2	6	8298	8303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009485	CG	3	6	8378	8383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009485	CTC	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009485	GCCT	2	8	12079	12086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009485	GTC	2	6	12135	12140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009485	CAT	2	6	13502	13507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009485	CGC	2	6	13546	13551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009485	GC	3	6	13554	13559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009485	CGA	2	6	13584	13589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009485	C	6	6	14103	14108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_009485	CGC	2	6	14241	14246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009485	GATC	2	8	14769	14776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009485	CGG	2	6	14845	14850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009485	GCC	2	6	14978	14983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009485	GATG	2	8	15044	15051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009485	CGG	2	6	15052	15057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009485	GC	3	6	15064	15069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009485	CGG	2	6	15164	15169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009485	CAA	2	6	15192	15197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009485	GCC	2	6	15282	15287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009485	CTT	2	6	15293	15298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009485	TTG	2	6	15450	15455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009485	CGC	2	6	15474	15479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009485	GCT	2	6	15529	15534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009485	GCC	2	6	15538	15543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009485	CTCA	2	8	18080	18087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009485	AGC	2	6	18117	18122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009485	CGG	2	6	20993	20998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009485	GAC	2	6	21011	21016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009485	GCG	2	6	21023	21028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009485	TCG	2	6	21061	21066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009485	GCC	2	6	22272	22277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009485	GCT	2	6	22304	22309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009485	CG	3	6	22315	22320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009485	GGA	2	6	22332	22337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009485	GCCC	2	8	23292	23299	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_009485	TGC	2	6	24221	24226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009485	CTGG	2	8	24236	24243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009485	TCT	2	6	24264	24269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009485	CT	3	6	24310	24315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009485	GCG	2	6	24338	24343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009485	GAC	2	6	24366	24371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009485	GAC	2	6	24440	24445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009485	GA	3	6	24504	24509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009485	GCA	2	6	24554	24559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009485	CG	3	6	25022	25027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009485	CTC	2	6	25044	25049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009485	AATG	2	8	25136	25143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009485	TGC	2	6	25675	25680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009485	CCA	2	6	25748	25753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009485	TGC	2	6	25801	25806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009485	TGC	2	6	25849	25854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009485	GC	3	6	25864	25869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009485	TTGT	2	8	26574	26581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009485	CAG	2	6	26648	26653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009485	CCA	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009485	CAC	2	6	29080	29085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009485	GGCCC	2	10	29114	29123	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_009485	GGAA	2	8	29192	29199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009485	CCAG	2	8	30954	30961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009485	GGCCTG	2	12	30996	31007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009485	GC	3	6	31028	31033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009485	CGC	2	6	31061	31066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009485	TCT	2	6	31082	31087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009485	CTG	2	6	31124	31129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009485	GGC	2	6	31164	31169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009485	ATTGA	2	10	31191	31200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009485	CAG	2	6	33427	33432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009485	GC	3	6	33473	33478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009485	GC	3	6	33501	33506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009485	CCG	3	9	33516	33524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009485	AT	3	6	33585	33590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009485	CTC	2	6	35760	35765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009485	GGCGCA	2	12	35806	35817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009485	GCC	2	6	35828	35833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009485	GCC	2	6	36265	36270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009485	CG	3	6	36281	36286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009485	CGC	2	6	36477	36482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009485	ATC	2	6	36483	36488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009485	CGG	2	6	36510	36515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009485	ATC	2	6	36550	36555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009485	CA	3	6	36562	36567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009485	GAACG	2	10	36569	36578	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009485	GGA	2	6	36579	36584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009485	GC	3	6	37803	37808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009485	CG	3	6	37821	37826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009485	TC	3	6	37909	37914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009485	GCT	2	6	38991	38996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009485	ACG	2	6	40579	40584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009485	CAT	2	6	40594	40599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009485	GCA	2	6	41755	41760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009485	GCA	3	9	41777	41785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009485	CG	3	6	42339	42344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009485	GGCC	2	8	42368	42375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009485	AG	3	6	42986	42991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009485	CAT	3	9	43018	43026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009485	CGG	2	6	43370	43375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009485	GCA	2	6	43460	43465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009485	CG	3	6	43511	43516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009485	CG	3	6	43578	43583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009485	CAA	2	6	43588	43593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009485	TGG	2	6	44798	44803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009485	GC	3	6	46021	46026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009485	AGCA	2	8	48498	48505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009485	CATGA	2	10	48518	48527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009485	GC	3	6	48528	48533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009485	T	7	7	51873	51879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009485	TGC	2	6	51913	51918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009485	CG	3	6	51931	51936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009485	GCA	2	6	51937	51942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009485	TGC	2	6	51957	51962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009485	TAGT	2	8	51973	51980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009485	GGC	2	6	52514	52519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009485	TCC	2	6	52524	52529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009485	GAC	2	6	52588	52593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009485	CTA	2	6	52694	52699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009485	GCC	2	6	52760	52765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_009485	TCG	2	6	52816	52821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009485	CG	3	6	52859	52864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009485	GCAT	2	8	52910	52917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009485	AC	3	6	52986	52991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009485	CG	3	6	54866	54871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009485	CGC	2	6	54883	54888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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151	NC_009485	GC	3	6	54926	54931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_009485	GAC	2	6	54943	54948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_009485	GTC	2	6	55014	55019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_009485	CGC	2	6	55022	55027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_009485	CGCT	2	8	55091	55098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_009485	CGG	2	6	55217	55222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_009485	CGC	2	6	63486	63491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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