MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009485	CGG	2	6	1294821	1294826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_009485	AGC	2	6	1294895	1294900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_009485	AG	3	6	1294991	1294996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_009485	CT	3	6	1295014	1295019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_009485	CCA	2	6	1295046	1295051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_009485	AAG	2	6	1295075	1295080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_009485	TG	3	6	1295164	1295169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009485	CAT	2	6	1295178	1295183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_009485	AGC	2	6	1298279	1298284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_009485	AG	3	6	1298289	1298294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009485	GC	3	6	1300203	1300208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_009485	CAG	2	6	1300509	1300514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_009485	TCC	2	6	1301130	1301135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_009485	CGT	2	6	1301179	1301184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_009485	GCA	2	6	1301190	1301195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_009485	CGG	2	6	1301254	1301259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_009485	CGC	2	6	1301285	1301290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_009485	ACC	2	6	1301343	1301348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_009485	GCC	3	9	1301351	1301359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_009485	GAT	2	6	1303685	1303690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_009485	GTC	2	6	1304438	1304443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_009485	GTC	2	6	1304448	1304453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_009485	GTC	2	6	1304460	1304465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_009485	AGA	2	6	1304484	1304489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_009485	AGC	2	6	1304695	1304700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_009485	ATAA	2	8	1304891	1304898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_009485	GT	3	6	1306781	1306786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_009485	AGC	2	6	1307142	1307147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_009485	GT	3	6	1307162	1307167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_009485	GGCT	2	8	1307381	1307388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_009485	TTG	2	6	1307511	1307516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009485	AAC	2	6	1307539	1307544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_009485	C	6	6	1307647	1307652	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4034	NC_009485	TGG	2	6	1307667	1307672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_009485	AG	3	6	1307673	1307678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_009485	GA	3	6	1307679	1307684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009485	CGC	2	6	1307691	1307696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_009485	AG	3	6	1307755	1307760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_009485	CTGAG	2	10	1307790	1307799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4040	NC_009485	CCG	2	6	1307820	1307825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_009485	CGC	2	6	1309788	1309793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_009485	AAT	2	6	1309916	1309921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009485	AAGG	2	8	1309952	1309959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_009485	CTT	2	6	1309963	1309968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_009485	TC	3	6	1310632	1310637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_009485	TCG	2	6	1310658	1310663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_009485	CCA	2	6	1310691	1310696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_009485	TGA	2	6	1310707	1310712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_009485	TC	4	8	1310736	1310743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_009485	TCG	2	6	1310770	1310775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_009485	GCT	2	6	1310785	1310790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_009485	ACG	2	6	1310898	1310903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_009485	C	6	6	1311554	1311559	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4054	NC_009485	TC	3	6	1316064	1316069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_009485	GAG	2	6	1316097	1316102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_009485	GCG	2	6	1316141	1316146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_009485	T	6	6	1319207	1319212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_009485	CG	3	6	1319256	1319261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_009485	ACG	2	6	1319275	1319280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_009485	GC	4	8	1319329	1319336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_009485	CGT	2	6	1319337	1319342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_009485	GC	3	6	1319349	1319354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_009485	GCG	2	6	1319429	1319434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_009485	CTT	2	6	1319772	1319777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_009485	GCC	3	9	1319778	1319786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_009485	AAC	2	6	1319898	1319903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_009485	GGT	2	6	1319960	1319965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_009485	GCG	2	6	1320003	1320008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_009485	A	7	7	1320042	1320048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_009485	GCG	2	6	1320049	1320054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_009485	GAA	2	6	1320099	1320104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_009485	CG	3	6	1320162	1320167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_009485	GCA	2	6	1320323	1320328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_009485	GGT	2	6	1320532	1320537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_009485	GTC	2	6	1320562	1320567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_009485	GGGT	2	8	1320754	1320761	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_009485	CAT	2	6	1320775	1320780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_009485	AGC	2	6	1320834	1320839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_009485	TGG	2	6	1320845	1320850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_009485	GCCA	2	8	1321329	1321336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_009485	TGG	2	6	1321337	1321342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_009485	TAA	2	6	1321364	1321369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_009485	TC	3	6	1321386	1321391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_009485	TAA	2	6	1321398	1321403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_009485	TGCC	2	8	1321407	1321414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_009485	CCA	2	6	1321422	1321427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_009485	GCTC	2	8	1321430	1321437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_009485	GAG	2	6	1323754	1323759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_009485	AAG	2	6	1323771	1323776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_009485	GA	3	6	1324142	1324147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_009485	TGG	2	6	1324227	1324232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_009485	GCAC	2	8	1324239	1324246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_009485	TTCG	2	8	1324253	1324260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_009485	TTC	2	6	1326443	1326448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_009485	AAAT	2	8	1326510	1326517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_009485	ATC	2	6	1326578	1326583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_009485	CAAC	2	8	1326626	1326633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_009485	GCC	2	6	1326646	1326651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_009485	GAG	2	6	1326712	1326717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_009485	TCG	2	6	1326807	1326812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_009485	CTC	2	6	1328134	1328139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_009485	AGA	2	6	1331276	1331281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_009485	CAGG	2	8	1332209	1332216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_009485	GAA	2	6	1332226	1332231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_009485	TAA	2	6	1332257	1332262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_009485	TTC	2	6	1332782	1332787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_009485	TTC	2	6	1332859	1332864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_009485	CGG	2	6	1332872	1332877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_009485	AAC	2	6	1332912	1332917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_009485	CG	3	6	1335888	1335893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_009485	TCG	2	6	1335939	1335944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_009485	GTTG	2	8	1340514	1340521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_009485	CAAC	2	8	1340532	1340539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_009485	TCT	2	6	1340602	1340607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_009485	GCG	2	6	1340608	1340613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_009485	GCTC	2	8	1340638	1340645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_009485	GAT	2	6	1340691	1340696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009485	TCG	2	6	1340762	1340767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_009485	AGC	2	6	1340777	1340782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_009485	GC	3	6	1340803	1340808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_009485	CG	3	6	1340856	1340861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_009485	GTC	2	6	1340868	1340873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_009485	TCG	2	6	1340894	1340899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_009485	CGG	2	6	1340924	1340929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_009485	TCA	2	6	1340931	1340936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_009485	GAC	2	6	1341721	1341726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_009485	ATG	2	6	1341742	1341747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_009485	GTC	2	6	1341795	1341800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_009485	CG	3	6	1341820	1341825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_009485	CGA	2	6	1341839	1341844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_009485	GCAA	2	8	1341846	1341853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_009485	CGC	2	6	1341878	1341883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_009485	CCG	2	6	1341893	1341898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4247	NC_009485	TCG	2	6	1395607	1395612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4252	NC_009485	TGA	3	9	1395741	1395749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_009485	GAG	2	6	1395773	1395778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_009485	GAT	2	6	1395844	1395849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4258	NC_009485	TGA	2	6	1396768	1396773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_009485	GCGGCT	2	12	1398132	1398143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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4261	NC_009485	CG	3	6	1398622	1398627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_009485	CGAG	2	8	1398648	1398655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4387	NC_009485	CCCG	2	8	1433974	1433981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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