MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009485	GCG	2	6	984445	984450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_009485	GGC	2	6	984494	984499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_009485	C	6	6	984503	984508	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3004	NC_009485	GC	3	6	985074	985079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_009485	CGG	2	6	985089	985094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_009485	GCCC	2	8	985111	985118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3007	NC_009485	GCC	2	6	985143	985148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_009485	CT	3	6	986866	986871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_009485	GGC	2	6	986941	986946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_009485	CCGG	2	8	986960	986967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_009485	GCAAG	2	10	986968	986977	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3012	NC_009485	CGA	2	6	986991	986996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_009485	AG	3	6	987004	987009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009485	CG	4	8	987048	987055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_009485	CCG	2	6	990498	990503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_009485	CGG	2	6	990506	990511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_009485	CG	3	6	990512	990517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_009485	CTG	2	6	991668	991673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_009485	CCGG	2	8	991700	991707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_009485	GCG	2	6	991758	991763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_009485	CCG	2	6	992287	992292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_009485	CGG	2	6	992301	992306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_009485	T	6	6	992308	992313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_009485	CGGAT	2	10	992800	992809	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_009485	GC	3	6	994101	994106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_009485	C	6	6	994140	994145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3027	NC_009485	GCGA	2	8	994167	994174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_009485	ATG	2	6	994189	994194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_009485	TCCG	2	8	995276	995283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_009485	CGC	2	6	996802	996807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_009485	GGCG	2	8	996811	996818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_009485	ACG	2	6	996927	996932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_009485	GAG	2	6	996933	996938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009485	CCA	2	6	996949	996954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_009485	CTAT	2	8	998629	998636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_009485	GCT	3	9	998653	998661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_009485	TCA	2	6	998667	998672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_009485	GTC	2	6	998726	998731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_009485	CAG	2	6	1000330	1000335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_009485	TCAGT	2	10	1000406	1000415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3041	NC_009485	CTC	2	6	1001072	1001077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_009485	ATC	2	6	1001210	1001215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_009485	CGCA	2	8	1001219	1001226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_009485	GCCCC	2	10	1001293	1001302	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3045	NC_009485	ATC	2	6	1001370	1001375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_009485	ATG	2	6	1001376	1001381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_009485	ATC	3	9	1001465	1001473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_009485	GC	3	6	1001489	1001494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_009485	AGC	2	6	1001507	1001512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_009485	AAG	2	6	1001569	1001574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009485	CGT	2	6	1004187	1004192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_009485	CGT	2	6	1004223	1004228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_009485	CGC	2	6	1004365	1004370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_009485	TTCG	2	8	1006090	1006097	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_009485	CG	3	6	1006119	1006124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_009485	TCG	2	6	1006142	1006147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_009485	CAT	2	6	1006154	1006159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_009485	AGGC	2	8	1006211	1006218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_009485	GCT	2	6	1006253	1006258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_009485	ATC	2	6	1006294	1006299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_009485	GCC	2	6	1006325	1006330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_009485	TGG	2	6	1006717	1006722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_009485	AGCGC	2	10	1006747	1006756	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3064	NC_009485	CGTG	2	8	1006773	1006780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_009485	CGG	2	6	1006848	1006853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_009485	GAC	2	6	1006860	1006865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_009485	CGT	2	6	1006963	1006968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_009485	CTC	2	6	1007053	1007058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_009485	AGG	2	6	1007113	1007118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009485	CGA	2	6	1007119	1007124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_009485	CT	3	6	1007133	1007138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_009485	CGC	2	6	1007152	1007157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_009485	GAT	2	6	1007181	1007186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_009485	CGT	2	6	1007258	1007263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_009485	CATCT	2	10	1007271	1007280	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3076	NC_009485	CCG	2	6	1007293	1007298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_009485	GTCA	2	8	1008479	1008486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_009485	GAG	2	6	1008573	1008578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_009485	AGC	2	6	1010101	1010106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_009485	TCC	2	6	1010157	1010162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_009485	TTG	2	6	1010179	1010184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_009485	TTG	2	6	1010196	1010201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_009485	AGAA	2	8	1010213	1010220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009485	CGC	2	6	1010259	1010264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_009485	GC	4	8	1010263	1010270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_009485	AAC	2	6	1010286	1010291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_009485	GAC	2	6	1010921	1010926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_009485	GTG	2	6	1012287	1012292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009485	TTAA	2	8	1012323	1012330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_009485	GCG	2	6	1012351	1012356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_009485	CCG	2	6	1012360	1012365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_009485	ATC	2	6	1013081	1013086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_009485	CG	3	6	1013094	1013099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_009485	ATGA	2	8	1013132	1013139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_009485	GTT	2	6	1013177	1013182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_009485	CG	3	6	1013708	1013713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_009485	GCC	2	6	1013788	1013793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_009485	TCG	2	6	1013799	1013804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_009485	GTG	2	6	1014670	1014675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_009485	GTCG	2	8	1014716	1014723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_009485	CAAAT	2	10	1014727	1014736	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3102	NC_009485	GCC	2	6	1014787	1014792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_009485	CG	3	6	1016900	1016905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_009485	GCTC	3	12	1016919	1016930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_009485	CGT	2	6	1016973	1016978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_009485	CTG	2	6	1017071	1017076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_009485	GCGA	2	8	1017837	1017844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_009485	CGT	2	6	1017875	1017880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_009485	GC	3	6	1017887	1017892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_009485	CAC	2	6	1018349	1018354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_009485	CTG	2	6	1018388	1018393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_009485	CGT	2	6	1018420	1018425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_009485	GCA	2	6	1018529	1018534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_009485	GACCT	2	10	1018564	1018573	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3115	NC_009485	CG	3	6	1018649	1018654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_009485	GC	3	6	1018662	1018667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_009485	CTG	2	6	1018684	1018689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_009485	CGA	2	6	1019205	1019210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_009485	CGC	3	9	1019242	1019250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_009485	GTC	2	6	1019295	1019300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_009485	GCT	2	6	1019303	1019308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_009485	CAA	2	6	1020610	1020615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_009485	CCG	2	6	1020624	1020629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_009485	GCGT	2	8	1020660	1020667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_009485	GATC	2	8	1020687	1020694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_009485	CG	3	6	1020973	1020978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_009485	GC	3	6	1020997	1021002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_009485	TC	3	6	1021365	1021370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_009485	GAG	2	6	1021395	1021400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_009485	AACTC	2	10	1021448	1021457	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3131	NC_009485	CGG	2	6	1021555	1021560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_009485	GA	3	6	1022276	1022281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_009485	GT	3	6	1022334	1022339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_009485	GCTT	2	8	1022395	1022402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_009485	GGC	2	6	1022415	1022420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_009485	TGA	2	6	1022422	1022427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_009485	CTC	2	6	1022607	1022612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3141	NC_009485	CGG	2	6	1024437	1024442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_009485	GACA	2	8	1024466	1024473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3143	NC_009485	CAG	2	6	1024480	1024485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_009485	ATTG	2	8	1024531	1024538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_009485	AAG	2	6	1024643	1024648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_009485	GTC	2	6	1025589	1025594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_009485	TAGA	2	8	1033902	1033909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3165	NC_009485	TTG	2	6	1034039	1034044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3167	NC_009485	GGC	2	6	1034103	1034108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3173	NC_009485	GCCGG	2	10	1036629	1036638	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3174	NC_009485	CG	3	6	1036639	1036644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3175	NC_009485	CG	3	6	1042159	1042164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3248	NC_009485	GCCGG	2	10	1072495	1072504	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3251	NC_009485	AGC	2	6	1072540	1072545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_009485	ATG	2	6	1072558	1072563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_009485	CCG	2	6	1072564	1072569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_009485	AG	3	6	1072621	1072626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_009485	CTT	2	6	1072736	1072741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_009485	T	7	7	1072748	1072754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_009485	GATC	2	8	1072759	1072766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3258	NC_009485	G	6	6	1072797	1072802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_009485	GAT	2	6	1072853	1072858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_009485	CGT	2	6	1072867	1072872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_009485	AGCA	2	8	1072875	1072882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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