MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009485	GCC	2	6	499423	499428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_009485	GCC	2	6	499444	499449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_009485	CCG	2	6	499458	499463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_009485	GC	3	6	500810	500815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_009485	GCG	2	6	500820	500825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_009485	GCG	2	6	500830	500835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_009485	GGA	2	6	501560	501565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009485	GGA	2	6	501576	501581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_009485	CGGC	2	8	501597	501604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_009485	TG	3	6	501632	501637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_009485	AGG	2	6	501993	501998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009485	CGG	2	6	503662	503667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_009485	CGG	2	6	503670	503675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_009485	CCA	2	6	504933	504938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_009485	CGGT	2	8	504966	504973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_009485	CCG	2	6	504975	504980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_009485	AG	3	6	505002	505007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_009485	CGC	2	6	505788	505793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_009485	AGC	2	6	505803	505808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_009485	ATCG	2	8	505832	505839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_009485	TGC	2	6	505851	505856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_009485	GCG	3	9	505870	505878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_009485	TC	3	6	506306	506311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_009485	GTCG	2	8	506335	506342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_009485	TTG	2	6	506376	506381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_009485	CG	3	6	509506	509511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_009485	AGG	2	6	509514	509519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009485	CG	3	6	509538	509543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_009485	GC	3	6	509556	509561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_009485	CG	3	6	510037	510042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_009485	ATT	2	6	510086	510091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009485	T	6	6	510098	510103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_009485	TCCG	2	8	510217	510224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_009485	GCCAG	2	10	510244	510253	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1535	NC_009485	A	6	6	511058	511063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_009485	GGC	2	6	511124	511129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_009485	TGC	2	6	511134	511139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_009485	CTG	2	6	511206	511211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_009485	TGG	2	6	511225	511230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009485	A	7	7	511266	511272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009485	TTC	2	6	511415	511420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_009485	ATGTG	2	10	511422	511431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_009485	GAG	2	6	511452	511457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_009485	TGA	2	6	511502	511507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_009485	CGT	2	6	511583	511588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_009485	CGTG	2	8	511590	511597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_009485	TTG	2	6	511599	511604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009485	ATC	2	6	511620	511625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_009485	TGGCC	2	10	512440	512449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1550	NC_009485	GT	3	6	512487	512492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009485	CATTG	2	10	512527	512536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_009485	GCCG	2	8	512560	512567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_009485	CG	3	6	512573	512578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_009485	AACG	2	8	512602	512609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_009485	GCG	2	6	512655	512660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_009485	GCA	2	6	514243	514248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_009485	GGC	2	6	514266	514271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_009485	CGC	2	6	514284	514289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_009485	CGA	2	6	514390	514395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_009485	CGG	2	6	514409	514414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_009485	GAG	2	6	514427	514432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_009485	GGA	2	6	514953	514958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009485	GAGCC	2	10	514968	514977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1564	NC_009485	TGG	3	9	515009	515017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_009485	AGA	2	6	518811	518816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_009485	GCC	2	6	519695	519700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_009485	CGT	2	6	520098	520103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_009485	GTCA	2	8	520217	520224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_009485	GTGC	2	8	520767	520774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_009485	GCC	2	6	520786	520791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_009485	TGA	2	6	520827	520832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009485	CGA	2	6	520847	520852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_009485	TGT	2	6	520863	520868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009485	GGGAC	2	10	520967	520976	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_009485	GCG	2	6	521032	521037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_009485	GCA	2	6	521055	521060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_009485	CCG	2	6	521126	521131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_009485	CTA	2	6	521132	521137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_009485	CTG	2	6	521186	521191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_009485	TCT	2	6	521224	521229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_009485	CTG	3	9	521952	521960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_009485	CGG	2	6	521978	521983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_009485	CGG	2	6	522009	522014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_009485	CTG	2	6	525607	525612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_009485	GGC	2	6	526069	526074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_009485	TCGCG	2	10	526110	526119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1587	NC_009485	CGGC	2	8	526196	526203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_009485	AGA	2	6	526316	526321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_009485	GATT	2	8	526361	526368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_009485	GGT	2	6	528529	528534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_009485	TTG	2	6	528555	528560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_009485	AG	3	6	531549	531554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009485	AAG	2	6	531603	531608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009485	GAG	2	6	531621	531626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_009485	G	6	6	536115	536120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009485	CCG	2	6	536136	536141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_009485	CCCA	2	8	536150	536157	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1598	NC_009485	GCCG	2	8	536194	536201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_009485	CGTCCG	2	12	536202	536213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_009485	GGGGA	2	10	536232	536241	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_009485	GTC	2	6	537010	537015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_009485	AGCGC	2	10	537107	537116	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1603	NC_009485	CGAT	2	8	537154	537161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_009485	TGG	2	6	537178	537183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009485	TCG	2	6	537190	537195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_009485	CG	4	8	537194	537201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_009485	CGAC	2	8	539287	539294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_009485	GAT	2	6	541420	541425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_009485	GGC	2	6	541450	541455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_009485	A	6	6	541490	541495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_009485	GC	3	6	541568	541573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_009485	GTG	2	6	541593	541598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_009485	T	7	7	541619	541625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_009485	CTG	2	6	541644	541649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_009485	CGA	2	6	543173	543178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_009485	G	6	6	544511	544516	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_009485	CGGC	3	12	544528	544539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_009485	GCG	2	6	545322	545327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_009485	CG	3	6	545375	545380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_009485	TGG	2	6	545382	545387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009485	GGCC	2	8	545401	545408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_009485	CG	3	6	545426	545431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_009485	CGC	2	6	545434	545439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_009485	CGG	2	6	545442	545447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_009485	GCT	2	6	547223	547228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_009485	TGC	2	6	547280	547285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_009485	CGGGTT	2	12	547454	547465	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1628	NC_009485	TTC	2	6	547472	547477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_009485	GC	3	6	547496	547501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_009485	CGA	2	6	547506	547511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_009485	CG	3	6	547549	547554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_009485	GCA	2	6	548532	548537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_009485	CCCCGC	2	12	548569	548580	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
1634	NC_009485	CGC	2	6	548611	548616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_009485	GCG	2	6	548646	548651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_009485	CGC	2	6	548665	548670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1909	NC_009485	CG	3	6	632373	632378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1998	NC_009485	GTGCA	2	10	662795	662804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2000	NC_009485	AATG	2	8	662850	662857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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