MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009485	GAC	2	6	5163649	5163654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_009485	CG	3	6	5163734	5163739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16003	NC_009485	TGG	2	6	5163745	5163750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_009485	CAA	2	6	5163752	5163757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_009485	GCC	2	6	5163841	5163846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16006	NC_009485	TTTC	2	8	5163852	5163859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16007	NC_009485	TG	3	6	5163914	5163919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_009485	GCT	2	6	5163983	5163988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_009485	GTC	2	6	5164012	5164017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_009485	GC	4	8	5164032	5164039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16011	NC_009485	CCG	2	6	5164071	5164076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16012	NC_009485	CGG	2	6	5164077	5164082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_009485	GAC	2	6	5164159	5164164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_009485	CGTCG	2	10	5164203	5164212	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16015	NC_009485	AAC	2	6	5164224	5164229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_009485	TCG	2	6	5164234	5164239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_009485	GC	3	6	5164254	5164259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16018	NC_009485	CCGCA	2	10	5164280	5164289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16019	NC_009485	AGC	2	6	5164299	5164304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_009485	CCA	2	6	5164352	5164357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_009485	ACG	2	6	5170006	5170011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_009485	GGC	2	6	5170029	5170034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_009485	CGT	2	6	5170045	5170050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_009485	ACCG	2	8	5170146	5170153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16025	NC_009485	C	6	6	5170163	5170168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16026	NC_009485	CGC	2	6	5170237	5170242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16027	NC_009485	TGC	3	9	5170278	5170286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_009485	CTC	2	6	5170290	5170295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16029	NC_009485	CTC	2	6	5170303	5170308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16030	NC_009485	CCGC	2	8	5170309	5170316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16031	NC_009485	CTCCCC	2	12	5170332	5170343	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
16032	NC_009485	GCC	2	6	5171649	5171654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16033	NC_009485	CCT	2	6	5173455	5173460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16034	NC_009485	GCA	2	6	5175307	5175312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_009485	GCG	2	6	5175427	5175432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_009485	GCC	2	6	5175488	5175493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16037	NC_009485	GCT	2	6	5175498	5175503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_009485	GGGCT	2	10	5175523	5175532	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16039	NC_009485	ACC	2	6	5175563	5175568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16040	NC_009485	CCTC	2	8	5175638	5175645	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16041	NC_009485	CTG	2	6	5175679	5175684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_009485	CAC	2	6	5175704	5175709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16043	NC_009485	CG	4	8	5176307	5176314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_009485	ATG	2	6	5177731	5177736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_009485	GAA	2	6	5177743	5177748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_009485	CT	3	6	5177761	5177766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16047	NC_009485	AGCA	2	8	5177813	5177820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16048	NC_009485	AAG	2	6	5177890	5177895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_009485	TCCCG	2	10	5177912	5177921	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16050	NC_009485	AGC	2	6	5177943	5177948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_009485	AGA	2	6	5177949	5177954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_009485	AG	3	6	5178024	5178029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_009485	CGG	2	6	5178035	5178040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_009485	GAA	2	6	5178058	5178063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_009485	AAG	2	6	5178082	5178087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_009485	GCA	2	6	5178134	5178139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_009485	CCG	2	6	5178152	5178157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16058	NC_009485	GGCA	2	8	5178211	5178218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16059	NC_009485	CAA	2	6	5178256	5178261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_009485	CG	3	6	5178267	5178272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16061	NC_009485	ATGG	2	8	5178561	5178568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_009485	CGATC	2	10	5178575	5178584	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16063	NC_009485	CGC	2	6	5178639	5178644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16064	NC_009485	CAAT	2	8	5178663	5178670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16065	NC_009485	CG	3	6	5178673	5178678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16066	NC_009485	CGG	2	6	5178703	5178708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_009485	GAG	2	6	5179199	5179204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_009485	GGC	2	6	5179223	5179228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_009485	AGC	2	6	5179236	5179241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_009485	AG	3	6	5179265	5179270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_009485	CGA	2	6	5179310	5179315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_009485	GCG	2	6	5179320	5179325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_009485	CG	3	6	5179403	5179408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_009485	GCG	2	6	5179578	5179583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_009485	GCG	2	6	5179624	5179629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_009485	TCG	2	6	5179650	5179655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_009485	GC	3	6	5179661	5179666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16078	NC_009485	AG	3	6	5179695	5179700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_009485	GCT	2	6	5179704	5179709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16080	NC_009485	CTT	2	6	5179840	5179845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_009485	TGA	2	6	5179876	5179881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_009485	AGA	2	6	5179978	5179983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_009485	CTG	2	6	5180010	5180015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_009485	GC	3	6	5182306	5182311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16085	NC_009485	CCCG	2	8	5182316	5182323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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16089	NC_009485	GTA	2	6	5182469	5182474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_009485	TA	3	6	5182480	5182485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_009485	CGGG	2	8	5182575	5182582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16092	NC_009485	GCAG	2	8	5182602	5182609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16093	NC_009485	AGAA	2	8	5182707	5182714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_009485	CCCG	2	8	5182729	5182736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16095	NC_009485	GCA	2	6	5182791	5182796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16097	NC_009485	CTC	2	6	5182824	5182829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16098	NC_009485	CG	3	6	5182872	5182877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16099	NC_009485	GCGCC	2	10	5182926	5182935	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16100	NC_009485	GCA	2	6	5182980	5182985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_009485	A	6	6	5183008	5183013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_009485	CCGA	2	8	5183753	5183760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16103	NC_009485	CGA	2	6	5183769	5183774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16106	NC_009485	AG	3	6	5184752	5184757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_009485	GGC	2	6	5185780	5185785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_009485	TGA	2	6	5187666	5187671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_009485	TCG	2	6	5187728	5187733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_009485	ACG	2	6	5187753	5187758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_009485	CAAC	2	8	5187790	5187797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16112	NC_009485	A	6	6	5189149	5189154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_009485	GCG	2	6	5189182	5189187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_009485	GCT	2	6	5189211	5189216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16117	NC_009485	A	6	6	5190806	5190811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_009485	CAT	2	6	5190931	5190936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16120	NC_009485	TGA	2	6	5190967	5190972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_009485	CAAGAT	2	12	5191004	5191015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16122	NC_009485	CAG	2	6	5191016	5191021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16124	NC_009485	TC	3	6	5191394	5191399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16125	NC_009485	CTTTG	2	10	5191402	5191411	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16126	NC_009485	GCC	2	6	5191486	5191491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16127	NC_009485	TCC	2	6	5191560	5191565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16129	NC_009485	TCA	2	6	5191711	5191716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16377	NC_009485	AGGC	2	8	5237966	5237973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16381	NC_009485	GA	3	6	5238159	5238164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16382	NC_009485	ATCG	2	8	5239457	5239464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16383	NC_009485	GTCGAT	2	12	5239638	5239649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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16385	NC_009485	GCG	2	6	5239773	5239778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16386	NC_009485	CAT	2	6	5239820	5239825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16424	NC_009485	CGGT	2	8	5252074	5252081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16425	NC_009485	CCTGC	2	10	5252108	5252117	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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16497	NC_009485	TGC	2	6	5276303	5276308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16500	NC_009485	TC	3	6	5277216	5277221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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