MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009485	AAT	2	6	344959	344964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009485	GCC	2	6	344981	344986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_009485	GC	3	6	345020	345025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_009485	GC	3	6	345089	345094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_009485	GTC	2	6	345103	345108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009485	GGC	2	6	345200	345205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_009485	ACG	2	6	345221	345226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009485	CATCG	2	10	345246	345255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_009485	GCC	3	9	345286	345294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_009485	TCC	3	9	345900	345908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_009485	CGAG	2	8	345924	345931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_009485	T	6	6	345952	345957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009485	TCA	2	6	346014	346019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_009485	ACC	2	6	346049	346054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_009485	GAG	2	6	346705	346710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009485	GTC	2	6	347544	347549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_009485	GAC	2	6	347564	347569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009485	GCG	2	6	348788	348793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009485	GCC	2	6	348819	348824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_009485	AGA	2	6	348860	348865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009485	TGG	2	6	348879	348884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009485	AGG	2	6	348899	348904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009485	CG	3	6	348917	348922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_009485	CGC	2	6	350188	350193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_009485	CTCCC	2	10	350206	350215	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1026	NC_009485	TGC	2	6	350278	350283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_009485	GAC	2	6	350349	350354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009485	TCG	2	6	350355	350360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_009485	GCG	2	6	350372	350377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009485	CTG	2	6	350434	350439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_009485	CGCTT	2	10	350551	350560	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1032	NC_009485	CG	3	6	350612	350617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_009485	GC	3	6	350619	350624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_009485	GACG	2	8	350635	350642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_009485	ACGA	2	8	350648	350655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_009485	ATC	2	6	350721	350726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009485	GAG	2	6	350760	350765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009485	AGGG	2	8	350795	350802	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009485	GCC	2	6	350834	350839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_009485	TTTC	2	8	350845	350852	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_009485	GGCCT	2	10	350879	350888	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1042	NC_009485	TTG	2	6	350967	350972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009485	CGC	2	6	351012	351017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_009485	CGC	2	6	351037	351042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_009485	ACT	2	6	351049	351054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_009485	CGGGC	2	10	351067	351076	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1047	NC_009485	GA	3	6	351114	351119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009485	CGGC	2	8	351587	351594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_009485	CGG	2	6	351660	351665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009485	GCA	2	6	351724	351729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009485	GCG	3	9	351733	351741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009485	GCA	2	6	351762	351767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_009485	TTC	2	6	352687	352692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_009485	ACT	2	6	354393	354398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_009485	GCC	2	6	355109	355114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_009485	GTGAG	2	10	356437	356446	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009485	GAT	2	6	356881	356886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009485	CAAT	2	8	356892	356899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_009485	G	6	6	356938	356943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009485	GCT	2	6	358494	358499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009485	GCGA	2	8	358926	358933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_009485	CGC	2	6	358958	358963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_009485	ATG	2	6	358984	358989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009485	CGT	2	6	359049	359054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_009485	CG	3	6	359409	359414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_009485	AGC	2	6	359425	359430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_009485	CG	3	6	359501	359506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_009485	GCG	2	6	359509	359514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_009485	CG	4	8	359519	359526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_009485	CGT	2	6	359597	359602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_009485	CAT	2	6	359617	359622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009485	TGA	2	6	359628	359633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009485	ACGCC	2	10	360726	360735	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1074	NC_009485	GC	3	6	360742	360747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_009485	TCAT	2	8	360758	360765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_009485	GAC	2	6	360824	360829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_009485	GC	3	6	361653	361658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_009485	CGGTG	2	10	361665	361674	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1079	NC_009485	CTC	2	6	361898	361903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_009485	CGC	2	6	361922	361927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_009485	CGG	2	6	361933	361938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_009485	CAT	2	6	361942	361947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_009485	CGGG	2	8	361975	361982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_009485	CG	3	6	362026	362031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_009485	AGC	2	6	362052	362057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_009485	CTG	2	6	362059	362064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_009485	GC	4	8	363577	363584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_009485	GAA	2	6	363620	363625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009485	CGG	2	6	363639	363644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_009485	TCG	2	6	363648	363653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_009485	GAC	2	6	363656	363661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_009485	GCG	2	6	363662	363667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_009485	AT	3	6	363707	363712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009485	GCAC	2	8	363714	363721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_009485	GCGA	2	8	363760	363767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_009485	GCTTC	2	10	363805	363814	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_009485	GAC	2	6	363824	363829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_009485	A	6	6	363840	363845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009485	CGA	2	6	363886	363891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009485	CGG	2	6	364290	364295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_009485	GCG	2	6	365190	365195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_009485	CCA	3	9	365220	365228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_009485	AGG	3	9	365261	365269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009485	GC	4	8	365939	365946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_009485	ACG	2	6	365950	365955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_009485	TGGA	2	8	366404	366411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009485	GTC	2	6	366413	366418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009485	GCGA	2	8	366422	366429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_009485	TCG	2	6	366471	366476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_009485	CTC	2	6	366482	366487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_009485	TGC	2	6	368069	368074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009485	GAG	2	6	368083	368088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009485	GGC	2	6	368112	368117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009485	TCG	2	6	368122	368127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_009485	CGC	2	6	368144	368149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_009485	CTC	2	6	368158	368163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_009485	GTC	2	6	368173	368178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_009485	TCGCAA	2	12	369399	369410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009485	CG	3	6	369440	369445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_009485	CG	3	6	369455	369460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_009485	GCG	2	6	369470	369475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_009485	TGC	2	6	370937	370942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009485	CGG	2	6	370986	370991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009485	GGTT	2	8	374210	374217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009485	GGA	2	6	374263	374268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009485	CGG	2	6	375240	375245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009485	GGCG	2	8	375252	375259	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_009485	ACT	2	6	375271	375276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009485	GCCGCG	2	12	375283	375294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_009485	TGA	2	6	375297	375302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1132	NC_009485	CCG	2	6	375932	375937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_009485	CAAGCG	2	12	375939	375950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_009485	CCG	2	6	377659	377664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1410	NC_009485	CCCAG	2	10	475715	475724	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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