MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009485	AAC	2	6	183751	183756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_009485	CG	3	6	183814	183819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_009485	CA	3	6	183824	183829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_009485	TTCCC	2	10	183844	183853	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
505	NC_009485	TGA	2	6	183922	183927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009485	CAT	2	6	183956	183961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009485	CCG	2	6	183969	183974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_009485	CCG	2	6	184705	184710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_009485	TCGA	2	8	184754	184761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_009485	GAT	2	6	184763	184768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009485	CAT	2	6	185227	185232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_009485	GTT	2	6	185244	185249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009485	GC	3	6	186143	186148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_009485	ACC	2	6	186170	186175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_009485	GC	3	6	186230	186235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_009485	GAACGT	2	12	186237	186248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
517	NC_009485	GTG	2	6	188533	188538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009485	TGG	2	6	188546	188551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009485	TGCG	2	8	188586	188593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_009485	CCGG	2	8	188619	188626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_009485	ATTG	2	8	188781	188788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009485	TG	3	6	188791	188796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009485	TTTTG	2	10	188809	188818	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009485	CGAA	2	8	188898	188905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_009485	CA	3	6	190171	190176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_009485	GC	3	6	190180	190185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_009485	TC	3	6	192692	192697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_009485	G	7	7	192768	192774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009485	GCC	2	6	192817	192822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_009485	GAG	2	6	192849	192854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009485	CCCG	2	8	194032	194039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
532	NC_009485	CGG	2	6	194705	194710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009485	T	6	6	194767	194772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_009485	TGG	2	6	194795	194800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009485	TCC	2	6	195556	195561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_009485	TGAT	2	8	195564	195571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009485	CCT	2	6	195586	195591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_009485	CG	3	6	195598	195603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_009485	CG	3	6	195607	195612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_009485	AGG	2	6	195620	195625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009485	CGG	2	6	195626	195631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_009485	GC	3	6	195644	195649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_009485	CAA	2	6	195686	195691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009485	CGGGC	2	10	195698	195707	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
545	NC_009485	GC	3	6	195709	195714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_009485	GAA	2	6	196651	196656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009485	CGGC	2	8	196685	196692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_009485	GAT	2	6	196823	196828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009485	CGC	2	6	196839	196844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_009485	GCG	3	9	196866	196874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_009485	GCGCG	2	10	196898	196907	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
552	NC_009485	GCC	2	6	196939	196944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_009485	GTCA	2	8	197018	197025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_009485	CCT	2	6	197029	197034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_009485	TCG	2	6	197047	197052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009485	CCCA	2	8	197107	197114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
557	NC_009485	AAG	2	6	197127	197132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009485	ACG	2	6	199040	199045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_009485	GC	3	6	199125	199130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_009485	CG	3	6	199137	199142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_009485	CGGG	2	8	199166	199173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
562	NC_009485	CGC	2	6	200327	200332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_009485	GC	3	6	200337	200342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_009485	CGT	2	6	200346	200351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_009485	TGC	2	6	200359	200364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_009485	A	6	6	200376	200381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009485	CCGCC	2	10	200446	200455	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
568	NC_009485	GCT	2	6	202861	202866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009485	CGG	2	6	202918	202923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009485	ACCA	2	8	203753	203760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_009485	CG	3	6	204426	204431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_009485	GGTT	2	8	204449	204456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009485	TTC	2	6	204530	204535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009485	GCC	2	6	204559	204564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_009485	C	6	6	204592	204597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
576	NC_009485	GTG	2	6	204711	204716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009485	CCG	2	6	204717	204722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_009485	GGC	2	6	205639	205644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009485	GC	3	6	205796	205801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_009485	CCG	2	6	205812	205817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_009485	TG	3	6	205843	205848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009485	TGC	2	6	207432	207437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009485	GGC	2	6	211326	211331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009485	CT	3	6	211336	211341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_009485	GA	3	6	211353	211358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009485	TCC	2	6	211391	211396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_009485	GGA	2	6	211509	211514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009485	CAG	2	6	214055	214060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_009485	GGC	2	6	214078	214083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_009485	CGGT	2	8	214094	214101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_009485	GC	3	6	214151	214156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_009485	CTG	2	6	214185	214190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009485	TA	3	6	214256	214261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009485	GCC	2	6	215560	215565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_009485	CTT	2	6	215568	215573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_009485	ATG	2	6	215584	215589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009485	TTG	2	6	215654	215659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_009485	GCG	2	6	215667	215672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_009485	GGC	2	6	217194	217199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_009485	CCA	2	6	217238	217243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_009485	TTTG	2	8	217245	217252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009485	TCC	2	6	218210	218215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_009485	GA	3	6	221875	221880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009485	CCCCA	2	10	221882	221891	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
605	NC_009485	CTG	2	6	221928	221933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_009485	GGC	2	6	223064	223069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_009485	CGC	2	6	223078	223083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_009485	CTT	2	6	223153	223158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009485	GGC	2	6	223588	223593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_009485	GCC	2	6	223846	223851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_009485	GCG	2	6	223859	223864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009485	GTTG	2	8	223892	223899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009485	ACCC	2	8	223926	223933	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
614	NC_009485	CGA	2	6	223973	223978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009485	AAAAG	2	10	224485	224494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009485	CG	3	6	225148	225153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_009485	TGC	2	6	225274	225279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009485	CCGC	2	8	225294	225301	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
619	NC_009485	GCG	2	6	225317	225322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009485	AGCGGC	2	12	225331	225342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009485	CA	3	6	225377	225382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_009485	CAT	2	6	225388	225393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009485	CGATG	2	10	227195	227204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
624	NC_009485	CGG	2	6	227218	227223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_009485	GCC	2	6	227298	227303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_009485	CGA	2	6	228037	228042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_009485	GCC	2	6	228047	228052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_009485	AACG	2	8	228062	228069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_009485	CAAC	2	8	228072	228079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_009485	GCG	2	6	228174	228179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_009485	GCG	2	6	228331	228336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_009485	GGATC	2	10	228353	228362	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
633	NC_009485	GAG	2	6	229197	229202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009485	CGA	2	6	229208	229213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_009485	TCGC	2	8	229255	229262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
636	NC_009485	GTCC	2	8	230300	230307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
637	NC_009485	GGA	2	6	230312	230317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009485	GCG	2	6	230327	230332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_009485	TA	3	6	230366	230371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_009485	GC	3	6	230461	230466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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643	NC_009485	CGT	2	6	230637	230642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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645	NC_009485	CGGC	2	8	230679	230686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
646	NC_009485	TCG	2	6	230694	230699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_009485	GCCG	2	8	231699	231706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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655	NC_009485	AGCCG	2	10	233671	233680	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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659	NC_009485	CTG	2	6	233947	233952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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