MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009485	CGC	2	6	1840245	1840250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_009485	CGTC	2	8	1840382	1840389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_009485	TG	3	6	1841051	1841056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_009485	TGC	2	6	1843341	1843346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_009485	TGG	2	6	1844349	1844354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_009485	TCGA	2	8	1844579	1844586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_009485	CG	5	10	1844615	1844624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_009485	CGG	2	6	1844644	1844649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_009485	GAC	2	6	1844658	1844663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_009485	CCGAT	2	10	1844685	1844694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6011	NC_009485	ACC	3	9	1844720	1844728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_009485	TGT	2	6	1844765	1844770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_009485	GAC	2	6	1844790	1844795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_009485	CGG	2	6	1844801	1844806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_009485	ACG	2	6	1844807	1844812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_009485	ACG	2	6	1844845	1844850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_009485	CCG	2	6	1844855	1844860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_009485	CG	3	6	1844859	1844864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_009485	CG	3	6	1844871	1844876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_009485	AGCG	2	8	1845354	1845361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_009485	ACG	2	6	1845374	1845379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_009485	CGC	2	6	1846421	1846426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_009485	GGC	2	6	1847005	1847010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_009485	TCG	2	6	1847031	1847036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_009485	AC	3	6	1847094	1847099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_009485	TCGCA	2	10	1847113	1847122	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6027	NC_009485	CCGC	2	8	1847458	1847465	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6028	NC_009485	CGG	2	6	1847533	1847538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_009485	G	6	6	1848055	1848060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_009485	CG	3	6	1848061	1848066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_009485	GCA	2	6	1848137	1848142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_009485	TC	3	6	1848155	1848160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_009485	CG	3	6	1848176	1848181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_009485	CGCC	2	8	1848195	1848202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6035	NC_009485	GCG	2	6	1848203	1848208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_009485	CGT	2	6	1848241	1848246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_009485	GCGT	2	8	1848522	1848529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_009485	GTGA	2	8	1848552	1848559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009485	GCC	2	6	1849043	1849048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_009485	CGC	2	6	1849049	1849054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_009485	TCC	2	6	1849061	1849066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_009485	GTT	2	6	1849244	1849249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_009485	GCCC	2	8	1849257	1849264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6044	NC_009485	GAG	2	6	1849281	1849286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_009485	CGA	2	6	1849292	1849297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_009485	GCC	2	6	1849352	1849357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_009485	ACG	2	6	1849381	1849386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_009485	CTT	2	6	1849394	1849399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_009485	TCC	2	6	1849419	1849424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_009485	GCG	2	6	1849464	1849469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_009485	CAGA	2	8	1849507	1849514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_009485	AGAAA	2	10	1849562	1849571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_009485	GGC	2	6	1849575	1849580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_009485	CAC	2	6	1849584	1849589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_009485	CCCT	2	8	1849612	1849619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6056	NC_009485	CCG	2	6	1849682	1849687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_009485	TCGT	2	8	1849767	1849774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_009485	GAC	2	6	1849838	1849843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_009485	AACGG	2	10	1849866	1849875	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6060	NC_009485	GCC	2	6	1849903	1849908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_009485	ATTT	2	8	1849914	1849921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_009485	CGGG	2	8	1849951	1849958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_009485	CGGG	2	8	1849972	1849979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_009485	G	6	6	1850000	1850005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_009485	GACAG	2	10	1850065	1850074	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_009485	TGA	2	6	1850079	1850084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_009485	GCG	2	6	1850115	1850120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_009485	GCC	2	6	1850146	1850151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_009485	GGT	2	6	1850197	1850202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_009485	GTCT	2	8	1850242	1850249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_009485	CGT	2	6	1850265	1850270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_009485	GCT	2	6	1850312	1850317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_009485	TCA	2	6	1850336	1850341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_009485	GCT	2	6	1850734	1850739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_009485	CAGC	2	8	1853996	1854003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_009485	TGG	2	6	1854019	1854024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6078	NC_009485	CGG	2	6	1854066	1854071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_009485	ATC	2	6	1854078	1854083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_009485	CGGA	2	8	1854086	1854093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6081	NC_009485	GGC	2	6	1854096	1854101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_009485	GCC	2	6	1854112	1854117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_009485	ACG	3	9	1854118	1854126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6085	NC_009485	CCG	2	6	1854471	1854476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_009485	ATG	2	6	1854707	1854712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_009485	GCC	2	6	1855734	1855739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_009485	GGC	2	6	1858309	1858314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_009485	CG	3	6	1858319	1858324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_009485	CG	3	6	1859897	1859902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_009485	GAT	2	6	1860047	1860052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_009485	TGA	2	6	1860071	1860076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_009485	CGA	2	6	1862876	1862881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_009485	CGC	2	6	1862883	1862888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_009485	CG	3	6	1862897	1862902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_009485	CAT	2	6	1862934	1862939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6098	NC_009485	G	6	6	1863383	1863388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_009485	GCC	2	6	1863914	1863919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_009485	CT	3	6	1863940	1863945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_009485	ATC	2	6	1864182	1864187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_009485	TGT	2	6	1864191	1864196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6104	NC_009485	CAGG	2	8	1864547	1864554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_009485	GCG	2	6	1864558	1864563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_009485	GT	3	6	1864621	1864626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_009485	CGGT	2	8	1864647	1864654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_009485	CG	3	6	1864669	1864674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_009485	ATG	2	6	1865421	1865426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_009485	GCG	2	6	1869624	1869629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_009485	TGG	2	6	1869677	1869682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_009485	ACC	2	6	1869703	1869708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_009485	CGC	2	6	1871686	1871691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_009485	GGGC	2	8	1871766	1871773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6131	NC_009485	ATG	2	6	1871838	1871843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_009485	AG	3	6	1906334	1906339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_009485	TGA	2	6	1908251	1908256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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