MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009485	GC	3	6	1703998	1704003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_009485	GCTG	2	8	1705392	1705399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_009485	GC	3	6	1705421	1705426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_009485	GGC	2	6	1705435	1705440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_009485	GTC	2	6	1705519	1705524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_009485	CGGA	2	8	1705529	1705536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_009485	ATC	2	6	1705550	1705555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_009485	GCT	2	6	1705571	1705576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_009485	GGT	2	6	1705578	1705583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_009485	AGCG	2	8	1705597	1705604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_009485	GAATA	2	10	1705864	1705873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_009485	TCG	2	6	1705884	1705889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_009485	GCC	2	6	1705956	1705961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_009485	GCG	2	6	1707639	1707644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_009485	CGGG	2	8	1707692	1707699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_009485	G	6	6	1707697	1707702	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_009485	CGG	2	6	1707806	1707811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_009485	AGG	2	6	1709009	1709014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_009485	GGT	2	6	1709068	1709073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_009485	CAG	2	6	1710331	1710336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_009485	AG	3	6	1710335	1710340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_009485	CAA	2	6	1710364	1710369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_009485	GCG	2	6	1710386	1710391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_009485	ATC	2	6	1710425	1710430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_009485	GATC	2	8	1710457	1710464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_009485	TGCT	2	8	1710466	1710473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_009485	TCG	2	6	1712075	1712080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_009485	CGG	2	6	1712095	1712100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_009485	TGT	2	6	1712181	1712186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_009485	TGC	2	6	1712212	1712217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_009485	GCG	2	6	1712229	1712234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_009485	GCT	2	6	1712282	1712287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_009485	GTT	2	6	1712289	1712294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_009485	TCG	2	6	1712297	1712302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_009485	CATAAT	2	12	1712333	1712344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5536	NC_009485	AGT	2	6	1712364	1712369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_009485	GTC	2	6	1712372	1712377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_009485	TCG	2	6	1712379	1712384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_009485	GACG	2	8	1712443	1712450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_009485	CAAC	2	8	1713914	1713921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_009485	TC	4	8	1713933	1713940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_009485	GCC	2	6	1714234	1714239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_009485	GCA	2	6	1714263	1714268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_009485	CTG	2	6	1714296	1714301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_009485	AG	3	6	1714303	1714308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_009485	CCG	2	6	1714348	1714353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_009485	GCG	2	6	1714371	1714376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_009485	GC	4	8	1714408	1714415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_009485	CGG	2	6	1714474	1714479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_009485	TGG	2	6	1714528	1714533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_009485	CG	4	8	1717733	1717740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_009485	CCA	2	6	1718179	1718184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_009485	GAG	2	6	1719390	1719395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009485	CGA	2	6	1719401	1719406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_009485	GCC	2	6	1719427	1719432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_009485	GCTTC	2	10	1719440	1719449	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5557	NC_009485	GA	3	6	1719465	1719470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009485	GGA	2	6	1719499	1719504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_009485	TCC	2	6	1721192	1721197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_009485	CCG	2	6	1721198	1721203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_009485	GAC	2	6	1721490	1721495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_009485	CGCGG	2	10	1721497	1721506	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5563	NC_009485	CGA	2	6	1721551	1721556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_009485	CGG	2	6	1721615	1721620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_009485	TGA	2	6	1721622	1721627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_009485	GC	3	6	1721667	1721672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_009485	CG	3	6	1721691	1721696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_009485	GCC	2	6	1721732	1721737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_009485	T	6	6	1721741	1721746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_009485	CGT	2	6	1721802	1721807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_009485	GCACC	2	10	1721815	1721824	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5572	NC_009485	GC	3	6	1721844	1721849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_009485	AT	3	6	1721865	1721870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_009485	GATC	2	8	1721887	1721894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_009485	GTT	2	6	1721988	1721993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_009485	TTC	2	6	1723433	1723438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_009485	GCA	2	6	1723470	1723475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_009485	CGT	2	6	1723490	1723495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_009485	GCA	2	6	1724396	1724401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_009485	GAG	2	6	1724464	1724469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_009485	GGC	2	6	1725269	1725274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_009485	GCC	2	6	1725292	1725297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_009485	GCCG	2	8	1726663	1726670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_009485	CG	3	6	1726669	1726674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_009485	CCG	2	6	1726675	1726680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_009485	TA	3	6	1726716	1726721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_009485	GCCG	2	8	1727682	1727689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_009485	GAT	2	6	1728962	1728967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_009485	GAG	2	6	1728983	1728988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_009485	CGG	2	6	1729888	1729893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_009485	CAT	2	6	1730018	1730023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_009485	CCGG	3	12	1730030	1730041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_009485	GCC	2	6	1730290	1730295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_009485	CG	3	6	1730313	1730318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_009485	TGC	2	6	1730319	1730324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_009485	CTG	2	6	1730388	1730393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_009485	GTC	2	6	1730400	1730405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_009485	TCGA	2	8	1730995	1731002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_009485	CCCG	2	8	1731003	1731010	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5600	NC_009485	TGC	2	6	1731048	1731053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_009485	CG	3	6	1731060	1731065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_009485	GGTC	2	8	1731385	1731392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_009485	CGA	2	6	1731717	1731722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_009485	ATG	2	6	1731727	1731732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_009485	CT	3	6	1731780	1731785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_009485	GCG	2	6	1731790	1731795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_009485	A	6	6	1731820	1731825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_009485	CGG	2	6	1732852	1732857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_009485	AGC	2	6	1732893	1732898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_009485	CGA	3	9	1733250	1733258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_009485	ACG	2	6	1733266	1733271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_009485	TTC	2	6	1733290	1733295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_009485	TTG	2	6	1733340	1733345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_009485	CA	3	6	1733361	1733366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_009485	TCG	2	6	1733397	1733402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_009485	GCA	2	6	1733416	1733421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_009485	GCC	2	6	1733441	1733446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_009485	CCG	2	6	1733455	1733460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_009485	TGAT	2	8	1733467	1733474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_009485	GGC	2	6	1733477	1733482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_009485	GC	3	6	1733503	1733508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_009485	GATC	2	8	1735020	1735027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5623	NC_009485	GAT	2	6	1737627	1737632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_009485	CGG	2	6	1737642	1737647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_009485	GAC	2	6	1738129	1738134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_009485	GACCA	2	10	1738136	1738145	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5627	NC_009485	GTT	2	6	1738180	1738185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_009485	CGATCG	2	12	1738192	1738203	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5630	NC_009485	TCG	2	6	1738221	1738226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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