MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009445	CCG	2	6	294990	294995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_009445	GCT	2	6	295478	295483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_009445	CTT	2	6	295507	295512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_009445	CCG	2	6	295544	295549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_009445	CG	3	6	295553	295558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_009445	CCG	2	6	295597	295602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_009445	GA	3	6	297147	297152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009445	GC	3	6	297161	297166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_009445	CAT	2	6	297187	297192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009445	CGG	2	6	298570	298575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009445	TCC	2	6	298576	298581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_009445	CGT	2	6	298608	298613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009445	CCG	2	6	298671	298676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_009445	CGGA	2	8	298711	298718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_009445	GCC	2	6	300512	300517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_009445	GACG	2	8	300736	300743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_009445	GGC	2	6	300768	300773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009445	GTG	2	6	300828	300833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009445	GCC	2	6	300845	300850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_009445	GCA	2	6	301162	301167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_009445	GTT	2	6	301178	301183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009445	CAT	2	6	301193	301198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_009445	CT	3	6	301209	301214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_009445	CGC	2	6	301285	301290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_009445	CGG	2	6	301358	301363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009445	CCG	2	6	301423	301428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_009445	CGC	2	6	302512	302517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_009445	GCC	2	6	302528	302533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_009445	GCA	2	6	302560	302565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_009445	TC	3	6	302581	302586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_009445	CAG	2	6	302596	302601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009445	CGC	2	6	303127	303132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_009445	T	7	7	303150	303156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009445	CGCGGC	2	12	303168	303179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_009445	CCA	2	6	303195	303200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_009445	GCA	2	6	303246	303251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009445	CG	3	6	305488	305493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_009445	CG	3	6	305512	305517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_009445	GCC	2	6	305532	305537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_009445	CGGGT	2	10	305544	305553	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1041	NC_009445	GA	3	6	305588	305593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009445	CGC	2	6	305637	305642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_009445	ACCGGC	2	12	305662	305673	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_009445	GTCC	2	8	305696	305703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_009445	CGC	2	6	305708	305713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_009445	CGC	2	6	305739	305744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_009445	C	6	6	305792	305797	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1048	NC_009445	GCC	2	6	305805	305810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_009445	GC	3	6	306603	306608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_009445	CTT	2	6	308305	308310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009445	GCT	2	6	308393	308398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009445	TCCG	2	8	308453	308460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_009445	GCC	2	6	308493	308498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_009445	AGC	2	6	308625	308630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_009445	AAT	2	6	308666	308671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009445	GAC	2	6	308690	308695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009445	GGT	2	6	308714	308719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009445	AC	3	6	308725	308730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_009445	CGC	3	9	309485	309493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_009445	CAG	2	6	309507	309512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_009445	CCG	2	6	309534	309539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_009445	GCC	2	6	309586	309591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_009445	TTC	2	6	309607	309612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009445	CGAC	2	8	309656	309663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_009445	AGC	2	6	309688	309693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009445	AG	3	6	309724	309729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009445	TCA	2	6	309806	309811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_009445	ATG	2	6	309823	309828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009445	CTC	2	6	309951	309956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_009445	GC	4	8	310018	310025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_009445	GAA	3	9	310098	310106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009445	GAACGA	2	12	310185	310196	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1073	NC_009445	CTT	2	6	310232	310237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_009445	CGC	2	6	310247	310252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_009445	CCAGCA	2	12	310397	310408	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_009445	CCGGC	3	15	310437	310451	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1077	NC_009445	CCGC	2	8	310473	310480	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1078	NC_009445	TTC	2	6	310483	310488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_009445	ATG	2	6	310501	310506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009445	GC	3	6	310542	310547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_009445	GTTC	2	8	310567	310574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_009445	GCT	2	6	310601	310606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_009445	ATA	2	6	310620	310625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009445	GCC	2	6	310693	310698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_009445	CAA	2	6	310703	310708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_009445	CCG	2	6	310729	310734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_009445	CGG	2	6	310778	310783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009445	G	6	6	310841	310846	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009445	ACC	2	6	310902	310907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_009445	CCCG	2	8	310936	310943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1091	NC_009445	GCG	2	6	310981	310986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_009445	GCA	2	6	311010	311015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_009445	CGA	2	6	311100	311105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009445	CAA	2	6	311121	311126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_009445	AGC	2	6	311151	311156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_009445	GTT	2	6	311186	311191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009445	GCA	2	6	311302	311307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_009445	CGG	2	6	311338	311343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_009445	GCT	2	6	311360	311365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009445	CAAG	2	8	311416	311423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_009445	G	6	6	311428	311433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009445	GTG	2	6	311529	311534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009445	GCG	2	6	311601	311606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_009445	CGGC	2	8	311620	311627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_009445	CG	3	6	311640	311645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_009445	CGGG	2	8	311662	311669	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_009445	CG	3	6	311670	311675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_009445	CG	4	8	311687	311694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_009445	CGG	2	6	311762	311767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_009445	CGGC	2	8	314868	314875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_009445	CTCG	2	8	314914	314921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_009445	CTC	2	6	314932	314937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_009445	CGG	2	6	314965	314970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009445	GCC	2	6	314982	314987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_009445	ATG	2	6	315029	315034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009445	GTG	2	6	315854	315859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009445	CA	3	6	315899	315904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_009445	GCT	2	6	317029	317034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009445	CG	3	6	317096	317101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_009445	GGTG	2	8	317105	317112	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009445	GCC	2	6	317169	317174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_009445	TCT	2	6	318221	318226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009445	CCGC	2	8	318232	318239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1124	NC_009445	CGA	2	6	318272	318277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_009445	GCCGC	2	10	318712	318721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1126	NC_009445	CGG	2	6	318740	318745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009445	GTT	2	6	318760	318765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009445	GCGCGA	2	12	318779	318790	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009445	GAC	2	6	318879	318884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_009445	GC	4	8	318897	318904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_009445	AAAG	2	8	318927	318934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009445	CCGAA	2	10	318990	318999	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1133	NC_009445	CTT	2	6	320875	320880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_009445	CAC	2	6	320983	320988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_009445	GA	3	6	320992	320997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009445	ACG	2	6	321003	321008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1254	NC_009445	GAG	2	6	357301	357306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_009445	CAG	2	6	361307	361312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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