MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 chromosome 3

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009254	CAGGGC	2	12	5958	5969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009254	ACCACG	2	12	30953	30964	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009254	CAGGGG	2	12	35790	35801	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009254	ACAGCG	2	12	42263	42274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009254	GACTTT	2	12	79262	79273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009254	CCATCA	2	12	96418	96429	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009254	TGCTCA	2	12	98620	98631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009254	GCGGTG	2	12	107255	107266	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009254	TTCCGC	2	12	112366	112377	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009254	GCGGAA	2	12	113330	113341	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009254	CGCTCG	2	12	117935	117946	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009254	CGGGAT	2	12	126973	126984	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009254	CGCTGC	2	12	148005	148016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009254	GCCACC	12	72	193429	193500	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009254	CGATGC	2	12	223533	223544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009254	TGGCCG	2	12	227821	227832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009254	GCCGCA	2	12	276481	276492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009254	CGGCGC	2	12	325479	325490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009254	CCGCGA	2	12	332768	332779	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009254	AGATAT	2	12	365102	365113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009254	CGAAGC	2	12	421672	421683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009254	CGAAGT	2	12	421684	421695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009254	CCGACA	11	66	421701	421766	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009254	CGTCGA	2	12	445894	445905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009254	TTCGCG	2	12	460837	460848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009254	GGGCCG	2	12	472740	472751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009254	GCGATC	2	12	487021	487032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009254	GCCAGC	2	12	517063	517074	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009254	TCTGGC	2	12	517151	517162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009254	GCTCCG	2	12	588002	588013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009254	TCCGTT	2	12	615299	615310	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009254	CGGCGA	2	12	658524	658535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009254	GCTCCT	2	12	678740	678751	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009254	ACGGCC	2	12	691788	691799	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009254	CCATGG	2	12	722571	722582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009254	CCGGCA	2	12	724648	724659	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009254	AATGCG	2	12	727203	727214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009254	ACGGCC	2	12	747134	747145	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009254	GCCCGT	2	12	789523	789534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009254	ACAACG	2	12	815120	815131	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009254	TTTGAA	2	12	830255	830266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009254	GCCGAT	3	18	877920	877937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009254	CGATGC	2	12	898575	898586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009254	CGTCAC	2	12	910971	910982	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009254	GAACGA	2	12	921717	921728	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009254	CGGCCG	2	12	928098	928109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009254	GCATGC	2	12	982691	982702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009254	CGTGCC	2	12	982723	982734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009254	AGCGCC	2	12	982880	982891	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009254	TCGACA	2	12	988434	988445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009254	TCGCGC	2	12	1007692	1007703	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009254	GGCTTG	2	12	1007948	1007959	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009254	AGCGCC	2	12	1032441	1032452	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009254	CGCCCG	2	12	1035805	1035816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009254	CGCGCC	2	12	1042241	1042252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009254	CGTTTT	2	12	1054058	1054069	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009254	GACGCG	2	12	1054399	1054410	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009254	TCCGCA	2	12	1059744	1059755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009254	GCGTCG	2	12	1082996	1083007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009254	CGCACG	2	12	1088266	1088277	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009254	CGAACG	2	12	1113030	1113041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009254	TTCAAA	2	12	1133390	1133401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009254	CGGCCG	2	12	1145411	1145422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009254	TCGGCG	2	12	1150643	1150654	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009254	TCGCCC	2	12	1150871	1150882	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009254	GCCGCG	2	12	1152309	1152320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009254	CGTCCA	2	12	1152430	1152441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009254	GGCCGG	2	12	1152563	1152574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009254	CACTCG	2	12	1153736	1153747	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009254	CGAAGC	2	12	1170002	1170013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009254	GCACGC	2	12	1188857	1188868	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009254	GCCGCG	2	12	1210512	1210523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009254	GATCAG	2	12	1210556	1210567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009254	GTCGGT	2	12	1211018	1211029	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009254	CGGCGC	2	12	1214012	1214023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009254	ACGCGC	2	12	1231785	1231796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.