MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703 chromosome

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008618	GCGGAT	2	12	19548	19559	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008618	TCGATT	2	12	37443	37454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008618	ACGGTC	2	12	151714	151725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008618	GCAACA	2	12	152338	152349	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008618	CGAAAA	2	12	190689	190700	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008618	ATGGCA	2	12	216106	216117	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008618	ATCGAA	2	12	245003	245014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008618	CGGCTG	2	12	250530	250541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008618	TGCCGC	2	12	250674	250685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008618	GCCGCG	2	12	294465	294476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008618	CGGTCA	2	12	306569	306580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008618	ATTTAG	2	12	363648	363659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008618	AATCGC	2	12	366248	366259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008618	TCAGCT	2	12	373719	373730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008618	TTGTCG	2	12	465840	465851	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008618	TACCCT	2	12	484284	484295	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008618	ATTGCG	2	12	490214	490225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008618	AACGAA	2	12	534547	534558	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008618	GGTGAC	2	12	552143	552154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008618	CGAAAA	2	12	636038	636049	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008618	TTGGAT	2	12	657964	657975	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008618	CGCAAT	2	12	661410	661421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008618	TTGCCT	2	12	692696	692707	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008618	GAGGTG	2	12	743852	743863	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008618	ATCGCA	2	12	771897	771908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008618	GCATAT	2	12	787990	788001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008618	CGGCTG	2	12	791922	791933	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008618	ATCAAT	2	12	847810	847821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008618	GCTGCG	2	12	857289	857300	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008618	GGCACA	2	12	857330	857341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008618	GCATGA	2	12	938533	938544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008618	CATAAA	2	12	950340	950351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008618	GGCATA	2	12	952799	952810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008618	CTTGGC	2	12	1017617	1017628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008618	TCTTGT	2	12	1028466	1028477	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008618	TGAAAA	2	12	1071248	1071259	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008618	CGGACA	2	12	1222635	1222646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008618	ATTACG	2	12	1233025	1233036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008618	CAATCG	2	12	1253989	1254000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008618	CACATA	2	12	1265215	1265226	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008618	AAATCA	2	12	1317676	1317687	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008618	ATTGCG	2	12	1396567	1396578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008618	TTATCT	2	12	1502574	1502585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008618	CGCAAA	2	12	1503556	1503567	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008618	ATTTAT	2	12	1505124	1505135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008618	GTCGCC	2	12	1550121	1550132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008618	CATACC	2	12	1553493	1553504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008618	TCGTGT	2	12	1566839	1566850	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008618	GTCGCC	2	12	1611401	1611412	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008618	CATACC	2	12	1614779	1614790	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008618	ATATAG	2	12	1662858	1662869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008618	CGCGAC	2	12	1732260	1732271	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008618	GCGTAC	2	12	1733129	1733140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008618	CAATTC	2	12	1756060	1756071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008618	TCAGCC	2	12	1762526	1762537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008618	GCATGG	2	12	1774288	1774299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008618	TAGGCG	2	12	1820552	1820563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008618	CGCAAT	2	12	1821235	1821246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008618	CGCAAT	2	12	1834286	1834297	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008618	ATGTCG	2	12	1836239	1836250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008618	CCATCG	2	12	1872187	1872198	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008618	GTCGCC	2	12	1906421	1906432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008618	CATACC	2	12	1909801	1909812	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008618	GCCCAG	2	12	1966732	1966743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008618	GTCGCC	2	12	1984870	1984881	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008618	CATACC	2	12	1988242	1988253	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008618	GATAGT	2	12	2042642	2042653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008618	TTGCCT	2	12	2042675	2042686	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008618	TGCCGT	2	12	2043001	2043012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008618	GTCGCC	2	12	2057482	2057493	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008618	CATACC	2	12	2060854	2060865	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008618	AATCGA	2	12	2074047	2074058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.