MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 383

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008600	TTTCGT	2	12	10906	10917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008600	TTTCGT	2	12	30706	30717	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008600	TTTAAA	2	12	41445	41456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008600	CTTTTT	2	12	74476	74487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008600	TTATAT	2	12	82139	82150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008600	TATATT	2	12	82234	82245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008600	AGTCAA	2	12	93111	93122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008600	GGAGAG	2	12	122756	122767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008600	TAAACA	2	12	139030	139041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008600	AAATAC	2	12	169248	169259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008600	GTATGT	2	12	184231	184242	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008600	GTATGT	2	12	190071	190082	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008600	AAATTG	2	12	198716	198727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008600	AAAATA	2	12	219120	219131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008600	AAGGGG	2	12	219204	219215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008600	AGAGGT	2	12	224174	224185	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008600	TTTCAT	2	12	238461	238472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008600	ATTTTT	2	12	242262	242273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008600	ATAAAA	2	12	253032	253043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008600	TTATAT	2	12	300884	300895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008600	AAGATG	2	12	319363	319374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008600	AGTAAT	2	12	324359	324370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008600	TATATT	2	12	348792	348803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008600	AAACAA	2	12	348975	348986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008600	TATAAA	2	12	356906	356917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008600	CTTTTA	2	12	367690	367701	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008600	AAAAAT	2	12	372969	372980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008600	AATAGA	2	12	373216	373227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008600	AATGAT	2	12	395423	395434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008600	TTAAAT	2	12	421791	421802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008600	TTTATA	2	12	443238	443249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008600	AATGGA	2	12	447030	447041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008600	AAAAAT	2	12	451102	451113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008600	AGAGAA	2	12	465373	465384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008600	ATTTTT	2	12	475658	475669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008600	AAGTAT	2	12	487481	487492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008600	GGAAGA	2	12	494144	494155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008600	TTTTCT	2	12	497596	497607	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008600	GAAAAT	2	12	512711	512722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008600	TAAAAA	2	12	557597	557608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008600	ATCATT	2	12	563741	563752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008600	TGTATA	2	12	615976	615987	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008600	CTTTTT	2	12	629134	629145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008600	ACGTGA	2	12	639720	639731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008600	GAAAAT	2	12	666070	666081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008600	TAACAT	2	12	714935	714946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008600	ACTTAA	2	12	734575	734586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008600	ATATAC	2	12	736894	736905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008600	GTTGCA	2	12	739819	739830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008600	TTTTTA	2	12	744824	744835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008600	AGTTTA	2	12	754218	754229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008600	TTAAAA	2	12	754592	754603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008600	TTAATT	2	12	761390	761401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008600	TTTTAT	2	12	802219	802230	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008600	GTATAT	2	12	814695	814706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008600	ATAAAA	2	12	817444	817455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008600	ACATTT	2	12	820669	820680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008600	ATAAGT	2	12	820743	820754	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008600	ATGTAA	2	12	837225	837236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008600	AACGTA	2	12	847425	847436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008600	ATTTGG	2	12	849290	849301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008600	TTAAAG	2	12	854340	854351	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008600	AAATGT	2	12	881950	881961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008600	ACGAGA	2	12	881999	882010	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008600	GTTTTT	2	12	887553	887564	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008600	TCATAT	2	12	894968	894979	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008600	AAGTAG	2	12	911581	911592	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008600	TGATGG	2	12	993309	993320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008600	AAACAA	2	12	1014488	1014499	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008600	TACTTT	2	12	1025220	1025231	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008600	TAAAGA	2	12	1031821	1031832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008600	CATTTT	2	12	1032348	1032359	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008600	AATTAA	2	12	1045230	1045241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008600	CTTTTT	2	12	1046510	1046521	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008600	TCTTTT	2	12	1049093	1049104	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008600	GAGGGA	2	12	1056196	1056207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008600	AAAATA	2	12	1083945	1083956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008600	TTTGCT	2	12	1100420	1100431	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008600	CTCCTT	2	12	1108645	1108656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008600	TAATAT	2	12	1113678	1113689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008600	TCCATT	2	12	1114971	1114982	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008600	GAGGTA	2	12	1120807	1120818	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008600	AGAAAA	2	12	1134023	1134034	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008600	TTTATT	2	12	1147491	1147502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008600	ATTTTT	2	12	1148860	1148871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008600	CATTAT	2	12	1164175	1164186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008600	TTTTCT	2	12	1180984	1180995	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008600	TGTTTC	2	12	1186348	1186359	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008600	AATATA	2	12	1200305	1200316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008600	CTTTTC	2	12	1211769	1211780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008600	TTGAAA	2	12	1221819	1221830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008600	AAGTAT	2	12	1229556	1229567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008600	CTTAAA	2	12	1267676	1267687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008600	ATTGTT	2	12	1268745	1268756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008600	AAATAA	2	12	1298537	1298548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008600	ATTTAA	2	12	1304409	1304420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008600	GGACAA	2	12	1328058	1328069	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008600	GAAAAA	2	12	1346837	1346848	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008600	AATGAT	2	12	1346950	1346961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008600	GGATAA	2	12	1352457	1352468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008600	AAGAAA	2	12	1357238	1357249	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008600	AATGAA	2	12	1363402	1363413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008600	AAAAGT	2	12	1364385	1364396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008600	ATGCGA	2	12	1367783	1367794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008600	TGCTCA	2	12	1368110	1368121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008600	TTTACT	2	12	1373067	1373078	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008600	AGATTA	2	12	1391734	1391745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008600	GAAAGG	2	12	1408620	1408631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008600	CCGGAA	2	12	1417658	1417669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008600	ATACAA	2	12	1422971	1422982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008600	GTTTTT	2	12	1444515	1444526	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008600	ATTTCT	2	12	1449531	1449542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008600	TTATCA	2	12	1460665	1460676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008600	GAAGGA	2	12	1470146	1470157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008600	ACGAAA	2	12	1567640	1567651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008600	GATTGG	2	12	1567748	1567759	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008600	TTTTTA	2	12	1569593	1569604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008600	CGTGGG	2	12	1597188	1597199	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008600	ATTTTT	2	12	1602015	1602026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008600	TGGAAT	2	12	1608229	1608240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008600	GTATCC	2	12	1614668	1614679	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008600	TTTCTA	2	12	1643839	1643850	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008600	GCTTAT	2	12	1645910	1645921	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008600	AACAGG	2	12	1650385	1650396	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008600	TATAAC	2	12	1657683	1657694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008600	GTGATT	2	12	1660262	1660273	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008600	CAGTGA	2	12	1660484	1660495	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008600	TTTATT	2	12	1681474	1681485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008600	AATCAT	2	12	1693867	1693878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008600	GAAAAT	2	12	1733116	1733127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008600	TGAACT	2	12	1785789	1785800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_008600	GGTGTT	2	12	1795770	1795781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008600	AAATAA	2	12	1836858	1836869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008600	ATATTT	2	12	1850836	1850847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_008600	TTTTTA	2	12	1881911	1881922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_008600	TATAAT	2	12	1938799	1938810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_008600	CTTTTT	2	12	2016126	2016137	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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253	NC_008600	TACATT	2	12	3282907	3282918	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_008600	ATGTAC	2	12	3286194	3286205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_008600	TAACAA	2	12	3306537	3306548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_008600	TCATTT	2	12	3309651	3309662	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_008600	TTTACA	2	12	3320024	3320035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_008600	GTGTAT	2	12	3346711	3346722	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_008600	TCAAGT	2	12	3355265	3355276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_008600	AGTTTG	2	12	3362654	3362665	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_008600	AAAATT	2	12	3364702	3364713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_008600	ATTCTC	2	12	3368242	3368253	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_008600	TCAATT	2	12	3368273	3368284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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266	NC_008600	TAAAAA	2	12	3481093	3481104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_008600	TCTTAT	2	12	3490342	3490353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
268	NC_008600	CCTATT	2	12	3493681	3493692	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_008600	TAACCC	2	12	3576014	3576025	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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282	NC_008600	CTACCG	2	12	3726064	3726075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
283	NC_008600	TAATGA	2	12	3726187	3726198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_008600	TCGTAA	2	12	3804139	3804150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
292	NC_008600	TAAATT	2	12	3812426	3812437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008600	TCATTC	2	12	3821352	3821363	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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364	NC_008600	ATTTAA	2	12	4902118	4902129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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370	NC_008600	TACACA	2	12	5004878	5004889	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
371	NC_008600	TAAAAA	2	12	5005296	5005307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_008600	CAATTG	2	12	5050723	5050734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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376	NC_008600	AAAGAT	2	12	5091854	5091865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
377	NC_008600	TTCACT	2	12	5132692	5132703	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
378	NC_008600	ACGTTA	2	12	5139595	5139606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
379	NC_008600	AATACA	2	12	5190629	5190640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
380	NC_008600	TTATTT	2	12	5194006	5194017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
381	NC_008600	ATTTCT	2	12	5214281	5214292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
382	NC_008600	AAAAAT	2	12	5220243	5220254	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_008600	TACCTC	2	12	5247014	5247025	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.