MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 24945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008600	A	6	6	562228	562233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_008600	ACAAT	2	10	562240	562249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3003	NC_008600	TG	3	6	562267	562272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008600	CAA	2	6	562273	562278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_008600	TTTC	2	8	562288	562295	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_008600	TAT	2	6	562320	562325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008600	TAT	2	6	562360	562365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008600	TA	3	6	562377	562382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008600	GAT	2	6	562392	562397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008600	AGG	2	6	562487	562492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008600	T	7	7	563695	563701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008600	T	7	7	563714	563720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008600	ATCATT	2	12	563741	563752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3014	NC_008600	TTA	2	6	567167	567172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008600	ATG	3	9	567241	567249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008600	T	6	6	567252	567257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008600	AT	3	6	567285	567290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008600	AGG	2	6	567297	567302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008600	CAT	2	6	567347	567352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008600	TTA	2	6	567418	567423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008600	TGT	2	6	567471	567476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008600	ATA	2	6	567488	567493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008600	AAT	2	6	567495	567500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008600	TTA	2	6	567560	567565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008600	GAA	2	6	567580	567585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008600	ACA	2	6	568153	568158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008600	TA	3	6	568160	568165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008600	GCC	2	6	568232	568237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_008600	TAA	2	6	568243	568248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008600	TTC	2	6	568277	568282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_008600	AGA	2	6	568287	568292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008600	GGC	2	6	569984	569989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_008600	GTA	2	6	569993	569998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008600	AAG	2	6	570029	570034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008600	ATA	2	6	570037	570042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008600	TTG	2	6	570062	570067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008600	ATGT	2	8	573032	573039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008600	ACTTT	2	10	573043	573052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3039	NC_008600	TATAT	2	10	573066	573075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008600	AT	3	6	573078	573083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_008600	AT	3	6	573085	573090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008600	AGG	2	6	573103	573108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008600	T	6	6	573137	573142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008600	AAT	2	6	573198	573203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008600	A	6	6	573233	573238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008600	AG	3	6	573250	573255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008600	TTC	2	6	575442	575447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008600	ATT	2	6	575453	575458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008600	AAT	2	6	575461	575466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008600	AT	3	6	575477	575482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008600	ATT	2	6	575490	575495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008600	TA	3	6	575501	575506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008600	GTAT	2	8	575518	575525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008600	TA	3	6	575580	575585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008600	AAT	2	6	575602	575607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008600	TAA	2	6	577638	577643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008600	T	7	7	577658	577664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008600	A	6	6	580071	580076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008600	AT	3	6	580086	580091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008600	T	6	6	580103	580108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_008600	AAAAT	2	10	581449	581458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008600	T	6	6	581476	581481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008600	AAT	2	6	581513	581518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008600	CAT	2	6	581530	581535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_008600	GCT	2	6	581601	581606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_008600	GA	3	6	581924	581929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008600	T	6	6	581952	581957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008600	TA	3	6	581962	581967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008600	T	6	6	581985	581990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008600	CA	3	6	582000	582005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_008600	AGA	2	6	582027	582032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008600	ATA	2	6	582049	582054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008600	AGA	2	6	582639	582644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008600	ATGT	2	8	582680	582687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008600	ATG	2	6	582750	582755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_008600	CAT	2	6	582792	582797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_008600	AAG	2	6	582821	582826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008600	AAT	2	6	583729	583734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008600	TAGA	2	8	583741	583748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008600	GAA	2	6	583755	583760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008600	ATG	2	6	583771	583776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008600	TTTTG	2	10	583805	583814	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008600	AG	3	6	583829	583834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008600	GATA	2	8	583836	583843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008600	TTG	2	6	583871	583876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008600	GAA	2	6	583900	583905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008600	AAC	2	6	583953	583958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_008600	GTTT	2	8	583990	583997	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008600	TAA	2	6	584089	584094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008600	A	6	6	589102	589107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008600	CTTT	2	8	589116	589123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_008600	A	7	7	589139	589145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008600	GAA	2	6	589147	589152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008600	GAAT	2	8	589185	589192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008600	ATT	2	6	589205	589210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008600	CTA	2	6	589262	589267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_008600	T	6	6	589281	589286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008600	TC	3	6	589296	589301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_008600	T	7	7	589306	589312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008600	TTG	2	6	589386	589391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008600	TTTG	2	8	589405	589412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008600	TAA	2	6	589413	589418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008600	AG	3	6	589474	589479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008600	AGAA	2	8	589486	589493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_008600	TTTC	2	8	590228	590235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_008600	TTA	2	6	590242	590247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_008600	TAA	2	6	590273	590278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_008600	A	7	7	590298	590304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008600	GTC	2	6	592303	592308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_008600	T	6	6	592309	592314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008600	AAG	2	6	592373	592378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008600	ATCA	2	8	592409	592416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_008600	ATG	2	6	592444	592449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008600	AAAG	2	8	592452	592459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008600	AATT	2	8	592473	592480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008600	T	6	6	594131	594136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008600	TA	3	6	594206	594211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008600	TA	3	6	594218	594223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_008600	AGG	2	6	594265	594270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008600	CAG	2	6	596263	596268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_008600	TAAG	2	8	596270	596277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008600	TTA	2	6	598652	598657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008600	T	7	7	598672	598678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_008600	TTA	2	6	598743	598748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008600	AGCT	2	8	600123	600130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_008600	TAGC	2	8	600140	600147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_008600	T	6	6	601406	601411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008600	GAA	2	6	601433	601438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008600	ATT	2	6	601446	601451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_008600	TATT	2	8	601469	601476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008600	T	7	7	601542	601548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008600	TC	3	6	601551	601556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_008600	TC	3	6	601558	601563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_008600	AAGAG	2	10	601590	601599	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_008600	TTG	2	6	601640	601645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_008600	TA	4	8	603296	603303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_008600	TTA	2	6	603339	603344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_008600	TAA	2	6	605442	605447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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