MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 24945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008600	CCT	2	6	289289	289294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_008600	TGA	2	6	289308	289313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008600	TCA	2	6	289321	289326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008600	GA	3	6	289361	289366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008600	TC	3	6	289371	289376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_008600	AT	3	6	289377	289382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008600	ATGT	2	8	289385	289392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008600	T	6	6	289425	289430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008600	T	6	6	289433	289438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_008600	GTAA	2	8	289531	289538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008600	CCA	2	6	289571	289576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_008600	ATGGT	2	10	289583	289592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008600	AGAC	2	8	289621	289628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_008600	GGA	2	6	289656	289661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008600	GCG	2	6	289690	289695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_008600	CGT	2	6	289803	289808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_008600	AAC	2	6	289816	289821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_008600	TC	3	6	289841	289846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_008600	CGG	2	6	289865	289870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_008600	GGA	2	6	289897	289902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008600	CACG	2	8	290227	290234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_008600	GT	3	6	290500	290505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008600	AGC	2	6	290559	290564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_008600	ACC	2	6	290637	290642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_008600	TGG	2	6	290719	290724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008600	ACA	2	6	290869	290874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_008600	ACC	2	6	290890	290895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_008600	AGA	2	6	290933	290938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008600	GAG	2	6	291120	291125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008600	GA	3	6	291143	291148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008600	CT	3	6	291260	291265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_008600	CTGAA	2	10	291348	291357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_008600	CGG	2	6	291369	291374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_008600	TGG	2	6	291631	291636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008600	CCT	2	6	291727	291732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_008600	GGT	2	6	291863	291868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008600	CGT	2	6	292058	292063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_008600	CGT	2	6	292084	292089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008600	GAG	2	6	292107	292112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008600	GTT	2	6	292161	292166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008600	C	6	6	292234	292239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1542	NC_008600	GAT	2	6	292285	292290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008600	ATA	2	6	292367	292372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008600	TGA	2	6	292420	292425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008600	AG	3	6	292430	292435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008600	CT	3	6	292472	292477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_008600	T	6	6	292560	292565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_008600	TTC	2	6	292622	292627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_008600	T	6	6	292654	292659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008600	TTTC	2	8	292666	292673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_008600	ATA	2	6	292744	292749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008600	GTT	2	6	292752	292757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008600	T	6	6	292756	292761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008600	TA	4	8	293775	293782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008600	TA	3	6	293848	293853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008600	ATG	2	6	294670	294675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008600	TAT	2	6	294693	294698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008600	TA	3	6	294709	294714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008600	AGA	2	6	294722	294727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008600	A	7	7	294747	294753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008600	T	6	6	294759	294764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008600	TAAC	2	8	294869	294876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_008600	AGT	2	6	294915	294920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008600	AAAC	2	8	294938	294945	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_008600	TTTTA	2	10	294962	294971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008600	AACT	2	8	294983	294990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_008600	GGC	2	6	295028	295033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_008600	GCG	2	6	295090	295095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_008600	GGC	2	6	295202	295207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_008600	ATGG	2	8	295222	295229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008600	GCA	2	6	295349	295354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_008600	CGC	2	6	295396	295401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_008600	GTGA	2	8	295402	295409	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008600	TGT	2	6	295435	295440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_008600	ATT	2	6	295559	295564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008600	GC	4	8	295574	295581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_008600	GGT	2	6	295583	295588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_008600	GGA	2	6	295709	295714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008600	GAA	2	6	295973	295978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008600	GGT	2	6	296047	296052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008600	GTC	2	6	296061	296066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_008600	TCGTG	2	10	296070	296079	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1586	NC_008600	CAT	2	6	296129	296134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_008600	ATC	2	6	296197	296202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_008600	AC	3	6	296224	296229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_008600	AC	3	6	296393	296398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1598	NC_008600	TC	3	6	296616	296621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_008600	AT	3	6	296622	296627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_008600	GTAA	2	8	296774	296781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008600	CCA	2	6	296814	296819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_008600	ATGGT	2	10	296826	296835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008600	AGAC	2	8	296864	296871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_008600	GGA	2	6	296899	296904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1613	NC_008600	CACG	2	8	297470	297477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_008600	GT	3	6	297743	297748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_008600	ACA	2	6	298111	298116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_008600	ACC	2	6	298132	298137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_008600	AGA	2	6	298175	298180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1622	NC_008600	GA	3	6	298385	298390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008600	CT	3	6	298502	298507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_008600	CTGAA	2	10	298590	298599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1631	NC_008600	GAG	2	6	299349	299354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1770	NC_008600	TAA	2	6	307287	307292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_008600	CCT	2	6	321025	321030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1913	NC_008600	TGA	2	6	321044	321049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_008600	TCA	2	6	321057	321062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1915	NC_008600	GA	3	6	321097	321102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_008600	TC	3	6	321107	321112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1917	NC_008600	AT	3	6	321113	321118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_008600	ATGT	2	8	321121	321128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_008600	T	6	6	321161	321166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1920	NC_008600	GTAA	2	8	321266	321273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1921	NC_008600	CCA	2	6	321306	321311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1922	NC_008600	ATGGT	2	10	321318	321327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_008600	AGAC	2	8	321356	321363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1924	NC_008600	GGA	2	6	321391	321396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_008600	GCG	2	6	321425	321430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1927	NC_008600	AAC	2	6	321551	321556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1928	NC_008600	TC	3	6	321576	321581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1929	NC_008600	CGG	2	6	321600	321605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1930	NC_008600	GGA	2	6	321632	321637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1931	NC_008600	CACG	2	8	321962	321969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1932	NC_008600	GT	3	6	322235	322240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_008600	AGC	2	6	322294	322299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1934	NC_008600	ACC	2	6	322372	322377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1935	NC_008600	TGG	2	6	322453	322458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_008600	ACA	2	6	322603	322608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1937	NC_008600	ACC	2	6	322624	322629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1938	NC_008600	AGA	2	6	322667	322672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_008600	GAG	2	6	322854	322859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1940	NC_008600	GA	3	6	322877	322882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1941	NC_008600	CT	3	6	322994	322999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1942	NC_008600	CTGAA	2	10	323082	323091	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1943	NC_008600	CGG	2	6	323103	323108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1944	NC_008600	TGG	2	6	323365	323370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_008600	CCT	2	6	323461	323466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1946	NC_008600	GGT	2	6	323597	323602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_008600	CGT	2	6	323792	323797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1948	NC_008600	CGT	2	6	323818	323823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1949	NC_008600	GAG	2	6	323841	323846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_008600	GTT	2	6	323895	323900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_008600	C	6	6	323968	323973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1952	NC_008600	GAT	2	6	324019	324024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_008600	ATA	2	6	324101	324106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_008600	TGA	2	6	324156	324161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_008600	AG	3	6	324166	324171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1956	NC_008600	CT	3	6	324208	324213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1957	NC_008600	T	7	7	324293	324299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_008600	TA	3	6	324311	324316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_008600	AGTAAT	2	12	324359	324370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1960	NC_008600	T	6	6	324373	324378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1961	NC_008600	CTA	2	6	324444	324449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1962	NC_008600	TA	3	6	324454	324459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1963	NC_008600	AAT	2	6	324465	324470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_008600	A	6	6	324478	324483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_008600	GAT	2	6	324488	324493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_008600	ATT	2	6	324509	324514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1967	NC_008600	ATTA	2	8	324560	324567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1968	NC_008600	AT	4	8	324605	324612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1969	NC_008600	CTT	2	6	324627	324632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1970	NC_008600	ATT	2	6	324646	324651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1971	NC_008600	TAA	2	6	324690	324695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1972	NC_008600	A	7	7	324694	324700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1973	NC_008600	ATT	2	6	324707	324712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1974	NC_008600	AGAA	2	8	324751	324758	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1975	NC_008600	AT	3	6	324761	324766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_008600	TC	3	6	324898	324903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1977	NC_008600	T	7	7	324935	324941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1978	NC_008600	A	6	6	333249	333254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_008600	CTT	2	6	333262	333267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1980	NC_008600	AGCT	2	8	333278	333285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1981	NC_008600	T	6	6	333288	333293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1982	NC_008600	GCCC	2	8	333301	333308	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1983	NC_008600	CCTT	2	8	336564	336571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1984	NC_008600	TGAT	2	8	336580	336587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1985	NC_008600	A	6	6	336591	336596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1986	NC_008600	A	6	6	337929	337934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1987	NC_008600	T	6	6	337957	337962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1988	NC_008600	T	6	6	337977	337982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1989	NC_008600	TTTGC	2	10	337993	338002	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1990	NC_008600	TG	3	6	338026	338031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1994	NC_008600	ATGT	2	8	339102	339109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1995	NC_008600	AGA	2	6	339130	339135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1996	NC_008600	GCA	2	6	339150	339155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1997	NC_008600	GT	4	8	339697	339704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_008600	AGT	2	6	339706	339711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_008600	T	8	8	339711	339718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_008600	A	6	6	339771	339776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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