MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 24945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008600	TACTTT	2	12	1025220	1025231	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5002	NC_008600	AGT	2	6	1025303	1025308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_008600	TAT	2	6	1025325	1025330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_008600	A	7	7	1025360	1025366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008600	TA	3	6	1025373	1025378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008600	TAA	2	6	1025390	1025395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008600	AGG	2	6	1025417	1025422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008600	T	6	6	1025998	1026003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_008600	GAG	2	6	1026027	1026032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008600	AG	3	6	1026046	1026051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008600	TAT	2	6	1026080	1026085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008600	ATA	2	6	1026404	1026409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008600	TTA	2	6	1026441	1026446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008600	T	7	7	1026819	1026825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008600	T	7	7	1026852	1026858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008600	AAT	2	6	1026867	1026872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008600	A	6	6	1026904	1026909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008600	AAAT	2	8	1026913	1026920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008600	AAG	2	6	1026949	1026954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008600	AAT	2	6	1026957	1026962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008600	TAA	2	6	1027033	1027038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008600	T	6	6	1027049	1027054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008600	T	6	6	1027057	1027062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_008600	ATA	2	6	1027113	1027118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_008600	TCAA	2	8	1027257	1027264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_008600	TAT	2	6	1028308	1028313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_008600	TTGG	2	8	1028321	1028328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008600	ATT	2	6	1028333	1028338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008600	A	6	6	1028347	1028352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008600	TCG	2	6	1028370	1028375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_008600	CA	3	6	1028518	1028523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_008600	ATT	2	6	1028574	1028579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_008600	CCT	2	6	1028692	1028697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_008600	T	6	6	1028697	1028702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_008600	TTA	2	6	1028733	1028738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_008600	TATAA	2	10	1028867	1028876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008600	TGG	2	6	1028877	1028882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008600	TA	3	6	1030749	1030754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008600	T	7	7	1030793	1030799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_008600	ATT	2	6	1030800	1030805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008600	GA	3	6	1030832	1030837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008600	GAA	3	9	1030887	1030895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008600	GTA	2	6	1030927	1030932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008600	GCAAA	2	10	1030950	1030959	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_008600	CAAA	3	12	1030956	1030967	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_008600	ATT	2	6	1030984	1030989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008600	TGA	2	6	1031000	1031005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008600	ATT	2	6	1031011	1031016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008600	T	6	6	1031078	1031083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008600	GGA	2	6	1031110	1031115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008600	TA	3	6	1031144	1031149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008600	TAA	2	6	1031189	1031194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008600	ATT	3	9	1031206	1031214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_008600	ATT	2	6	1031254	1031259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008600	T	7	7	1031352	1031358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008600	TCA	2	6	1031388	1031393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_008600	AGA	2	6	1031421	1031426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008600	TAC	2	6	1031459	1031464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_008600	GAA	2	6	1031544	1031549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008600	TAA	2	6	1031591	1031596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_008600	A	6	6	1031605	1031610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_008600	CAA	2	6	1031671	1031676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_008600	GTG	2	6	1031689	1031694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_008600	ATGT	2	8	1031697	1031704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_008600	TAA	2	6	1031720	1031725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_008600	AGAA	2	8	1031762	1031769	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008600	ATGG	2	8	1031796	1031803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_008600	AG	3	6	1031813	1031818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_008600	TAAAGA	2	12	1031821	1031832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_008600	ATT	2	6	1031850	1031855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_008600	T	7	7	1031858	1031864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_008600	TA	3	6	1031869	1031874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008600	ATTA	2	8	1031904	1031911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_008600	CTT	2	6	1031921	1031926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_008600	TC	3	6	1031930	1031935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_008600	TACGA	2	10	1031959	1031968	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_008600	T	6	6	1031975	1031980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_008600	T	6	6	1032005	1032010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_008600	TTG	2	6	1032151	1032156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_008600	AT	3	6	1032165	1032170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_008600	TGA	2	6	1032293	1032298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_008600	T	6	6	1032302	1032307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008600	ACT	2	6	1032337	1032342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008600	CATTTT	2	12	1032348	1032359	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5085	NC_008600	AG	3	6	1032365	1032370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_008600	ACG	2	6	1032412	1032417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_008600	CGTA	2	8	1032500	1032507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_008600	GTG	2	6	1032539	1032544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008600	TAG	2	6	1032556	1032561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_008600	CTT	2	6	1032584	1032589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_008600	AT	3	6	1032852	1032857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008600	GTA	2	6	1032912	1032917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008600	AAAG	2	8	1032927	1032934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_008600	TGG	2	6	1037134	1037139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008600	TGAAT	2	10	1038100	1038109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008600	TTA	2	6	1038150	1038155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_008600	ATGAA	2	10	1038159	1038168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008600	GAA	3	9	1038189	1038197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_008600	A	6	6	1038228	1038233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008600	ATT	2	6	1038249	1038254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_008600	AAG	2	6	1038257	1038262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008600	TA	3	6	1038278	1038283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_008600	TAT	2	6	1038349	1038354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_008600	T	7	7	1038605	1038611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008600	ATA	2	6	1040097	1040102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_008600	ACC	2	6	1040109	1040114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_008600	GGT	2	6	1040124	1040129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_008600	TAT	2	6	1040136	1040141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008600	TTTTA	2	10	1040179	1040188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008600	T	6	6	1040199	1040204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_008600	AGGG	2	8	1040227	1040234	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_008600	ATAA	2	8	1040697	1040704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008600	AAG	2	6	1040991	1040996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008600	TGA	2	6	1041119	1041124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008600	TTG	2	6	1041134	1041139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008600	A	7	7	1041236	1041242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_008600	T	7	7	1041455	1041461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008600	TCA	2	6	1041464	1041469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_008600	GGA	2	6	1041490	1041495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_008600	A	6	6	1042454	1042459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_008600	TAA	2	6	1043479	1043484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008600	AGT	2	6	1043496	1043501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_008600	TGCT	2	8	1043521	1043528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_008600	T	6	6	1043528	1043533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_008600	T	6	6	1043560	1043565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_008600	GGT	2	6	1043651	1043656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008600	TAT	2	6	1045104	1045109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_008600	ACTT	2	8	1045134	1045141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_008600	AAC	2	6	1045168	1045173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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