MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TC	3	6	107	112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008598	CA	3	6	459	464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008598	TA	3	6	2054	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008598	CT	3	6	3685	3690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008598	TA	3	6	3767	3772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008598	TA	3	6	4348	4353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008598	AT	3	6	4742	4747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008598	AG	3	6	4842	4847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008598	AG	3	6	5150	5155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008598	CT	3	6	5163	5168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008598	AG	3	6	5437	5442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008598	CT	3	6	7025	7030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008598	TC	3	6	7101	7106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008598	GT	3	6	7185	7190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008598	CA	3	6	7773	7778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008598	TA	3	6	7933	7938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008598	AT	3	6	7974	7979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008598	TA	3	6	8100	8105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008598	TA	3	6	16323	16328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008598	CA	3	6	16350	16355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008598	TA	3	6	18085	18090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008598	AT	7	14	18372	18385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008598	TC	3	6	18552	18557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008598	TA	3	6	20015	20020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008598	CT	3	6	20658	20663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008598	CT	3	6	21879	21884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008598	AT	3	6	21956	21961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008598	TA	3	6	22701	22706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008598	AT	3	6	24152	24157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008598	TA	3	6	24363	24368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008598	TA	3	6	24404	24409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008598	AT	3	6	24789	24794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008598	TA	3	6	24914	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008598	CA	3	6	25234	25239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008598	TA	3	6	25352	25357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008598	TA	3	6	26993	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008598	TA	3	6	27851	27856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008598	CT	4	8	28411	28418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008598	TA	3	6	29905	29910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008598	AT	3	6	31946	31951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008598	TA	3	6	34111	34116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008598	AT	3	6	34461	34466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008598	TA	3	6	34550	34555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008598	TA	3	6	34844	34849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008598	CA	3	6	41827	41832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008598	TC	3	6	47519	47524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008598	AT	3	6	49302	49307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008598	AT	3	6	55459	55464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008598	TA	3	6	55576	55581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008598	AT	3	6	55933	55938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.