MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	TTTA	2	8	949	956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008568	AACT	2	8	974	981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008568	ATTA	2	8	2434	2441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008568	ATTA	2	8	2455	2462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008568	ATTA	2	8	2476	2483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008568	ATTA	2	8	2497	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008568	ATTA	2	8	2518	2525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008568	TAAT	2	8	2795	2802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008568	ACAA	2	8	3130	3137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008568	ATTT	2	8	3339	3346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008568	CTAC	2	8	3456	3463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008568	TGAA	2	8	4001	4008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008568	AACT	2	8	4152	4159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008568	ATTA	2	8	4186	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008568	TATT	2	8	4675	4682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008568	TTTC	2	8	4717	4724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008568	AATT	2	8	5826	5833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008568	AATA	2	8	5927	5934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	TAAA	2	8	6111	6118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008568	ATTA	2	8	6158	6165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008568	ATTT	2	8	6166	6173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008568	TCCT	2	8	7178	7185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008568	TATT	2	8	7835	7842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008568	TAAA	2	8	7889	7896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008568	ACCT	2	8	9082	9089	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008568	TTGT	2	8	9525	9532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008568	TAAA	2	8	10899	10906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008568	TAAA	2	8	11039	11046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008568	CTTT	2	8	11409	11416	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008568	ATAA	2	8	11489	11496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008568	AGAT	2	8	11503	11510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008568	TAAA	2	8	13034	13041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008568	ATTA	2	8	13105	13112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008568	GATT	2	8	13233	13240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008568	TTAT	2	8	13327	13334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008568	TTAA	2	8	13663	13670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008568	TATT	2	8	13848	13855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008568	TAAT	2	8	14256	14263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008568	TTTA	2	8	14524	14531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008568	ATAC	2	8	14591	14598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008568	CTTA	2	8	15420	15427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008568	ATTT	2	8	16240	16247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008568	TAAA	2	8	16303	16310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008568	CTTT	2	8	16322	16329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008568	TTTA	2	8	17890	17897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008568	ACAT	2	8	17988	17995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008568	ATTT	2	8	18671	18678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008568	AATA	2	8	18687	18694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008568	ACTT	2	8	18808	18815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008568	ACAA	2	8	18959	18966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008568	ATGT	2	8	19299	19306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008568	TGAA	2	8	22649	22656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008568	TTAC	2	8	23805	23812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008568	TTAC	2	8	23826	23833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008568	TTTG	2	8	28300	28307	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.