MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	CCAA	2	8	485	492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008566	ATTA	2	8	739	746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008566	ATTA	2	8	772	779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	ATTA	2	8	838	845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008566	ATTA	2	8	855	862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	ATTA	2	8	887	894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	GTAT	2	8	1749	1756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008566	TAAT	2	8	1981	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008566	ATTA	2	8	1995	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008566	CAAA	2	8	2033	2040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008566	AATC	2	8	2081	2088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008566	ATAC	2	8	2162	2169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008566	ACTT	2	8	2911	2918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008566	TTTC	2	8	4096	4103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008566	TTAT	2	8	4221	4228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	TTAA	2	8	4241	4248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008566	ATTT	2	8	4831	4838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008566	ACTT	2	8	4954	4961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008566	TTTA	2	8	5643	5650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008566	TAAA	2	8	6019	6026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008566	GCAA	2	8	6187	6194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008566	ATTT	2	8	6394	6401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008566	GAAG	2	8	6701	6708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008566	ATTT	2	8	6892	6899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008566	TTAA	2	8	7859	7866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008566	TTTG	2	8	7880	7887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008566	AATT	2	8	8293	8300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008566	ATTA	2	8	8317	8324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008566	AATA	2	8	8497	8504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008566	TTAT	2	8	8526	8533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008566	AGAA	2	8	8843	8850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008566	TATT	2	8	9690	9697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008566	AATA	2	8	10885	10892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008566	ATTT	2	8	10985	10992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008566	AAAT	2	8	11192	11199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008566	AGTT	2	8	14394	14401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008566	TCTT	2	8	14590	14597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008566	TATT	2	8	14856	14863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008566	ATAA	2	8	14939	14946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008566	TTAA	2	8	14958	14965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008566	TAAT	2	8	15009	15016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008566	TTAA	2	8	15354	15361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008566	TTAT	2	8	15445	15452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008566	TATT	2	8	15575	15582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008566	AAAT	2	8	15591	15598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008566	TAAT	2	8	16584	16591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008566	TATT	2	8	16657	16664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008566	AGTA	2	8	16867	16874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008566	TTAT	2	8	16969	16976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008566	CTTA	2	8	17311	17318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008566	TATC	2	8	17362	17369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008566	CAAT	2	8	17516	17523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008566	TTAA	2	8	17570	17577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008566	ATTA	2	8	17813	17820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008566	AGTT	2	8	18209	18216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008566	ATAA	2	8	18908	18915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008566	TAAT	2	8	19059	19066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008566	ATCA	2	8	19067	19074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008566	ATTT	2	8	19158	19165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008566	TAAA	2	8	19335	19342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008566	ATTA	2	8	20285	20292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008566	TTTA	2	8	21758	21765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008566	ATTT	2	8	21894	21901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008566	AGTT	2	8	22356	22363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008566	TAGA	2	8	22635	22642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008566	TTTA	2	8	22900	22907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008566	AGAT	2	8	23130	23137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008566	ATTT	2	8	23203	23210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008566	AATC	2	8	23479	23486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008566	AAAT	2	8	23531	23538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008566	TTTG	2	8	23728	23735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008566	AAAT	2	8	24016	24023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008566	CCAA	2	8	25399	25406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008566	CTTT	2	8	25503	25510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008566	TCTT	2	8	27396	27403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008566	GAAA	2	8	27454	27461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008566	AATA	2	8	27543	27550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008566	TAAA	2	8	27763	27770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008566	ATTT	2	8	27987	27994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008566	TTAT	2	8	28141	28148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008566	TTAA	2	8	29387	29394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008566	TTTG	2	8	29414	29421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008566	TGTA	2	8	29723	29730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008566	TATT	2	8	31798	31805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008566	TTTA	2	8	31887	31894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008566	GATT	2	8	32090	32097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008566	TAAG	2	8	32112	32119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008566	TTTA	2	8	32351	32358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008566	ATTT	2	8	33131	33138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008566	ATTT	2	8	33141	33148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008566	AAAT	2	8	33175	33182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008566	ATTT	2	8	33230	33237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008566	ATCT	2	8	33265	33272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008566	TTAG	2	8	33288	33295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008566	CTAT	2	8	33314	33321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008566	ATTT	2	8	33333	33340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008566	ATTT	2	8	34218	34225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.