MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	CCT	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008566	CAA	2	6	24	29	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008566	GAA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008566	TTA	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	CTC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008566	CAA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008566	TCA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008566	CAA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008566	TCA	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008566	ACT	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008566	AAC	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008566	CTG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008566	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008566	TAA	2	6	686	691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	ATT	3	9	696	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008566	TAT	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008566	GAG	2	6	908	913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008566	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008566	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008566	ATT	2	6	1925	1930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008566	TCT	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008566	AAG	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008566	TAA	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008566	TTA	2	6	2069	2074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008566	TTA	2	6	2095	2100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008566	TGG	2	6	2170	2175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008566	GTA	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008566	ATA	2	6	2224	2229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008566	TTA	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008566	AAT	2	6	2257	2262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008566	TAC	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008566	TAT	3	9	2703	2711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008566	GTT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008566	TTC	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008566	TAT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008566	ATA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008566	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008566	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008566	AAG	2	6	3000	3005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008566	TAA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008566	TAT	3	9	3945	3953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008566	GAA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008566	TTA	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008566	CTT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008566	CAA	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008566	TAT	2	6	4910	4915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008566	TAA	2	6	4919	4924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008566	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008566	TTA	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008566	TAA	2	6	5124	5129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008566	ATA	2	6	5489	5494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008566	ATT	2	6	5611	5616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008566	GCT	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008566	ATT	2	6	6301	6306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008566	AGT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008566	ATA	2	6	6318	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008566	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008566	TAA	3	9	6610	6618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008566	TAA	2	6	6621	6626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008566	AGC	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008566	ACA	2	6	6758	6763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008566	TAA	2	6	6764	6769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008566	GAA	2	6	6778	6783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008566	ATA	2	6	7846	7851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008566	ATT	2	6	7852	7857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008566	TAT	3	9	7905	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008566	TTA	2	6	7937	7942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008566	ATT	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008566	TAT	3	9	8147	8155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008566	ATA	2	6	8201	8206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008566	TCT	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008566	AGA	2	6	8383	8388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008566	TAT	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008566	AAT	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008566	ATA	2	6	8551	8556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008566	TAT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008566	ACT	2	6	8799	8804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008566	ATA	2	6	9461	9466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008566	ATT	2	6	9493	9498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008566	ACT	2	6	9551	9556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008566	CTT	2	6	9584	9589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008566	ATA	2	6	9742	9747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008566	ACA	2	6	9811	9816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008566	ATT	2	6	9817	9822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008566	GAT	2	6	10180	10185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008566	ACT	2	6	10202	10207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008566	AGT	2	6	10214	10219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008566	ATC	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008566	CTA	3	9	10338	10346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008566	AAT	2	6	10354	10359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008566	TTA	2	6	10438	10443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008566	ATT	2	6	10454	10459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008566	ATT	2	6	10511	10516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008566	CTT	2	6	10590	10595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008566	TAA	2	6	10614	10619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008566	ATA	3	9	10637	10645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008566	ATT	2	6	10756	10761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008566	TAA	2	6	10814	10819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008566	TTG	2	6	10860	10865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008566	ATA	2	6	10919	10924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008566	ACT	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008566	TCA	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008566	TAT	2	6	11097	11102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008566	CTA	2	6	11143	11148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008566	TTA	2	6	11167	11172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008566	TAA	2	6	11280	11285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008566	ATA	2	6	11336	11341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008566	ATA	2	6	11386	11391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008566	TTA	2	6	11396	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008566	TAT	2	6	14373	14378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008566	TTA	2	6	14480	14485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008566	CTG	2	6	14652	14657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008566	TAA	2	6	14723	14728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008566	TTA	2	6	14807	14812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008566	TTA	2	6	14898	14903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008566	ATT	3	9	15018	15026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008566	TGA	2	6	15207	15212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008566	ATT	2	6	15256	15261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008566	TAG	2	6	15293	15298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008566	TAA	2	6	15364	15369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008566	AAT	2	6	15414	15419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008566	TAA	2	6	15544	15549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008566	TTA	2	6	15553	15558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008566	TAG	2	6	15649	15654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008566	TAG	2	6	15706	15711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008566	ATA	2	6	15712	15717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008566	TAA	2	6	16576	16581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008566	TAA	2	6	16649	16654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008566	ATA	2	6	16665	16670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008566	AAT	2	6	16748	16753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008566	TGT	2	6	16788	16793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008566	GTT	2	6	16877	16882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008566	GTT	2	6	16892	16897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008566	ATC	2	6	16898	16903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008566	AGT	2	6	16979	16984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008566	TTG	2	6	16989	16994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008566	TAT	2	6	17110	17115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008566	TAG	2	6	17117	17122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008566	AAT	2	6	17169	17174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008566	AAT	2	6	17219	17224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008566	TAA	2	6	17385	17390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008566	GGT	2	6	17395	17400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008566	TAA	2	6	17646	17651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008566	ATT	2	6	17785	17790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_008566	ATA	2	6	32363	32368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_008566	AAT	2	6	33106	33111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_008566	ATA	2	6	33114	33119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_008566	TAA	2	6	33160	33165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_008566	AAT	2	6	33254	33259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_008566	TAT	2	6	33451	33456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008566	TTA	2	6	34212	34217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_008566	ATG	2	6	34231	34236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.