MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60-2

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008565	AT	4	8	2426	2433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008565	AT	3	6	3598	3603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008565	AT	3	6	4345	4350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008565	TA	3	6	4368	4373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008565	AT	3	6	5754	5759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008565	AT	3	6	7404	7409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008565	AC	3	6	11641	11646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008565	TA	3	6	12210	12215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008565	GA	3	6	14994	14999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008565	TC	4	8	15679	15686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008565	AT	3	6	16188	16193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008565	AT	3	6	16395	16400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008565	TA	3	6	17279	17284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008565	TA	3	6	19038	19043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008565	AT	3	6	20571	20576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008565	AT	3	6	20880	20885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008565	AT	3	6	22058	22063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008565	TA	3	6	22455	22460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008565	TA	3	6	22535	22540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008565	TA	3	6	22543	22548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008565	TA	3	6	22551	22556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008565	TC	3	6	23202	23207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008565	AT	3	6	23416	23421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008565	TA	3	6	24049	24054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008565	AC	4	8	25059	25066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008565	TA	3	6	25309	25314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008565	TA	3	6	25439	25444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008565	AT	4	8	25493	25500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008565	TA	3	6	25611	25616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008565	AT	3	6	31431	31436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008565	TA	3	6	31477	31482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008565	AT	3	6	31528	31533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008565	TA	3	6	31795	31800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008565	CT	3	6	32023	32028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008565	AT	3	6	32499	32504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008565	AC	4	8	33085	33092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008565	AT	3	6	33615	33620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008565	TA	3	6	34349	34354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008565	TA	4	8	34626	34633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008565	AT	3	6	34948	34953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008565	TA	3	6	35271	35276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008565	TA	3	6	35560	35565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008565	TA	3	6	35988	35993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008565	AT	3	6	36334	36339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008565	TA	3	6	36785	36790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008565	AT	5	10	39555	39564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008565	TA	3	6	40168	40173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008565	TA	3	6	40201	40206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008565	AT	5	10	40979	40988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008565	TA	3	6	41856	41861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008565	TA	3	6	41911	41916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008565	TA	3	6	42340	42345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008565	TA	3	6	42353	42358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008565	TA	3	6	42828	42833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008565	TA	4	8	44168	44175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008565	TA	3	6	44249	44254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008565	TA	3	6	44723	44728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008565	GT	3	6	44817	44822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008565	TA	3	6	44892	44897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008565	TA	3	6	46554	46559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008565	AT	3	6	47276	47281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008565	AT	3	6	47574	47579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008565	AT	3	6	47690	47695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008565	AT	4	8	48378	48385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008565	AC	3	6	50024	50029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008565	TA	4	8	51783	51790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008565	AT	3	6	52455	52460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008565	AT	3	6	58296	58301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008565	TA	3	6	58304	58309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008565	TG	3	6	58772	58777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008565	TA	3	6	59516	59521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.