MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	ATT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008564	ATC	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008564	AAC	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008564	TAT	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	GCA	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008564	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008564	AAT	2	6	170	175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008564	TAT	2	6	238	243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008564	TAT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008564	CTT	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008564	CTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008564	TAA	2	6	442	447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008564	CAT	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008564	ACA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008564	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008564	TAA	2	6	621	626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008564	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008564	GTT	2	6	671	676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008564	TAT	2	6	702	707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008564	TAG	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008564	CTG	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008564	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008564	TAA	2	6	1521	1526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008564	ATT	3	9	1531	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008564	TAT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008564	TAT	2	6	1585	1590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008564	TTA	2	6	2538	2543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008564	TAA	2	6	2663	2668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008564	ATT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008564	TAA	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008564	TTA	2	6	3081	3086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008564	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008564	TAT	2	6	3162	3167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008564	TTA	3	9	3198	3206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008564	ATA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008564	AAT	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008564	AAG	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008564	TAA	3	9	3788	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008564	CAT	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008564	ATT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008564	TAA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008564	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008564	TAA	2	6	3916	3921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008564	ACT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008564	AAC	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008564	ATA	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008564	ACA	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008564	ATT	2	6	6919	6924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008564	TAA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008564	TAA	2	6	6955	6960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008564	ATA	2	6	7717	7722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008564	CCA	2	6	9623	9628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008564	ATA	2	6	9637	9642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008564	ATT	2	6	11780	11785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008564	GTT	2	6	13668	13673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008564	TAA	2	6	13822	13827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008564	ATC	2	6	13936	13941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008564	TAA	2	6	13964	13969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008564	AAT	2	6	14003	14008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008564	TAT	2	6	14034	14039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008564	TTA	2	6	14043	14048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008564	AGG	2	6	16776	16781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008564	TTA	2	6	17732	17737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008564	TCT	2	6	17763	17768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008564	ATT	2	6	17900	17905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008564	ATA	2	6	17911	17916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008564	ATA	2	6	18000	18005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008564	TAA	2	6	18507	18512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008564	GTA	2	6	18582	18587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008564	TAA	2	6	19130	19135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008564	GTT	2	6	19782	19787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008564	AAT	2	6	19877	19882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008564	TAT	2	6	19924	19929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008564	AAT	2	6	19981	19986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008564	ATT	2	6	19987	19992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008564	TTA	2	6	22606	22611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008564	AAC	2	6	22628	22633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008564	GTT	2	6	22880	22885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008564	TAT	2	6	23361	23366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008564	TTA	2	6	23660	23665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008564	TTA	2	6	24349	24354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008564	CTC	2	6	26026	26031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008564	AAT	2	6	26043	26048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008564	TTA	2	6	26146	26151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008564	AAG	2	6	26289	26294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008564	ATT	2	6	26420	26425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008564	ATT	2	6	28179	28184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008564	ATA	3	9	28201	28209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008564	ATA	3	9	28235	28243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008564	TAA	2	6	30124	30129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008564	ATT	2	6	30151	30156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008564	GGA	2	6	33483	33488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008564	AAT	2	6	34988	34993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008564	TTA	2	6	35003	35008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008564	AAT	2	6	38723	38728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008564	ATT	2	6	39347	39352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008564	TAC	2	6	42186	42191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008564	GCT	2	6	42379	42384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008564	ATT	2	6	42389	42394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008564	TTA	2	6	42500	42505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008564	ATT	2	6	42578	42583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008564	ATA	2	6	43774	43779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008564	TAA	2	6	43782	43787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008564	TTA	2	6	43801	43806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008564	TAG	2	6	43853	43858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008564	AAG	2	6	43876	43881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008564	CTT	2	6	43903	43908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008564	TAT	2	6	43939	43944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008564	TGT	2	6	43971	43976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008564	TTA	2	6	43979	43984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008564	TAA	2	6	44089	44094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008564	AAT	2	6	44806	44811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008564	ATT	2	6	44815	44820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008564	CAT	2	6	44882	44887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008564	ATT	2	6	44930	44935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008564	ATT	2	6	45208	45213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008564	TAT	2	6	45273	45278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008564	TAA	2	6	45282	45287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008564	TAA	2	6	46358	46363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008564	ATT	3	9	46376	46384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008564	TAA	2	6	46409	46414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008564	ATT	2	6	47396	47401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008564	AAG	2	6	47461	47466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008564	AAT	2	6	47523	47528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008564	ATT	2	6	48780	48785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008564	TAA	2	6	48810	48815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008564	AAT	2	6	48877	48882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008564	GTG	2	6	48925	48930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008564	TAA	2	6	50450	50455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008564	AAT	2	6	50466	50471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008564	ATT	2	6	50501	50506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008564	TAA	2	6	50527	50532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008564	ATT	2	6	50544	50549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008564	GAA	2	6	50595	50600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008564	ATT	2	6	51502	51507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008564	ATA	2	6	51519	51524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008564	ATT	3	9	51527	51535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008564	GAA	2	6	51578	51583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008564	AAT	3	9	51603	51611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008564	TAA	2	6	52475	52480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008564	GAA	2	6	52590	52595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008564	AAT	3	9	52615	52623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008564	TCC	2	6	53402	53407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008564	TAA	2	6	53429	53434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_008564	ATA	2	6	53447	53452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_008564	TAA	2	6	59934	59939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.