MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 393

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008564	ATT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008564	ATC	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008564	AAC	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008564	TAT	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008564	ATTA	2	8	123	130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008564	GCA	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008564	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008564	AAT	2	6	170	175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008564	T	6	6	189	194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008564	TTAA	2	8	211	218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008564	TAT	2	6	238	243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008564	TAT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008564	CTT	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008564	CTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008564	TA	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008564	T	7	7	427	433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008564	TAA	2	6	442	447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008564	CAT	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008564	ATAA	2	8	482	489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008564	ACA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008564	T	6	6	520	525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008564	A	7	7	526	532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008564	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008564	CT	3	6	608	613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008564	TAA	2	6	621	626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008564	T	6	6	645	650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008564	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008564	GTT	2	6	671	676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008564	TAT	2	6	702	707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008564	T	7	7	722	728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008564	AAAATT	2	12	747	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008564	TAG	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008564	CTG	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008564	AT	3	6	1369	1374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008564	T	6	6	1431	1436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008564	AGAA	2	8	1437	1444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008564	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008564	TAA	2	6	1521	1526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008564	ATT	3	9	1531	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008564	TAT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008564	ATTA	2	8	1574	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008564	TAT	2	6	1585	1590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008564	ATTA	2	8	1607	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008564	ATTA	2	8	1624	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008564	ATTA	2	8	1657	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008564	GTAT	2	8	2501	2508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008564	TTA	2	6	2538	2543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008564	A	6	6	2575	2580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008564	T	6	6	2628	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008564	TAA	2	6	2663	2668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008564	ATT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008564	TA	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008564	ATTA	2	8	2717	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008564	TAAAT	2	10	2728	2737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008564	TAA	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008564	CAAA	2	8	2776	2783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008564	TTA	2	6	3081	3086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008564	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008564	T	7	7	3131	3137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008564	TAT	2	6	3162	3167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008564	TTA	3	9	3198	3206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008564	ATA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008564	AAT	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008564	AATT	2	8	3746	3753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008564	AAG	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008564	TAA	3	9	3788	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008564	TAAT	2	8	3804	3811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008564	AT	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008564	CAT	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008564	TAAT	2	8	3840	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008564	ATTAT	2	10	3849	3858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008564	TAAT	2	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008564	ATT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008564	TAA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008564	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008564	TAA	2	6	3916	3921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008564	ACT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008564	A	7	7	4501	4507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008564	AAC	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008564	T	6	6	5406	5411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008564	ATA	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008564	ATTAT	2	10	5432	5441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008564	A	7	7	5467	5473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008564	TAAA	2	8	6767	6774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008564	TACA	2	8	6789	6796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008564	ACA	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008564	T	7	7	6864	6870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008564	A	7	7	6876	6882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008564	CAAA	2	8	6898	6905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008564	ATT	2	6	6919	6924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008564	TAA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008564	TAA	2	6	6955	6960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008564	A	6	6	7140	7145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008564	A	6	6	7656	7661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008564	TAAA	2	8	7663	7670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008564	T	6	6	7673	7678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008564	A	8	8	7679	7686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008564	AT	3	6	7698	7703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008564	ATA	2	6	7717	7722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008564	CCA	2	6	9623	9628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008564	ATA	2	6	9637	9642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008564	AAAT	2	8	10712	10719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008564	T	6	6	11708	11713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008564	T	6	6	11736	11741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008564	A	6	6	11746	11751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008564	ATT	2	6	11780	11785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008564	ATTTT	2	10	11789	11798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008564	T	9	9	11795	11803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008564	TTAT	2	8	11817	11824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008564	TAATA	2	10	11863	11872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008564	AT	3	6	11884	11889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008564	GTT	2	6	13668	13673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008564	A	6	6	13754	13759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008564	TAA	2	6	13822	13827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008564	TGAA	2	8	13894	13901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008564	ATAA	2	8	13906	13913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008564	ATC	2	6	13936	13941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008564	TAA	2	6	13964	13969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008564	TAAA	2	8	13981	13988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008564	AAT	2	6	14003	14008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008564	TAT	2	6	14034	14039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008564	TTA	2	6	14043	14048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008564	ACTT	2	8	14054	14061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008564	T	8	8	14099	14106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008564	T	6	6	14110	14115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008564	TACTT	2	10	14125	14134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008564	T	6	6	14133	14138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008564	ATTA	2	8	14152	14159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008564	AGG	2	6	16776	16781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008564	ATTT	2	8	17338	17345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008564	TTTTTA	2	12	17494	17505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008564	T	8	8	17551	17558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008564	A	6	6	17575	17580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008564	TTA	2	6	17732	17737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008564	TCT	2	6	17763	17768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008564	A	6	6	17791	17796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008564	TG	3	6	17860	17865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008564	TAAA	2	8	17873	17880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008564	ATT	2	6	17900	17905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008564	ATA	2	6	17911	17916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008564	ATA	2	6	18000	18005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008564	TAA	2	6	18507	18512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008564	GTA	2	6	18582	18587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008564	TAA	2	6	19130	19135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008564	CTAATT	2	12	19192	19203	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_008564	GTT	2	6	19782	19787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008564	ATAA	2	8	19803	19810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008564	AAATA	2	10	19843	19852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008564	AAT	2	6	19877	19882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008564	ATTTT	2	10	19908	19917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008564	TAT	2	6	19924	19929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008564	ATTTT	2	10	19935	19944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008564	AAT	2	6	19981	19986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008564	ATT	2	6	19987	19992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008564	AGCT	2	8	20003	20010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_008564	TTTTAA	2	12	20022	20033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008564	A	8	8	20097	20104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008564	A	12	12	20116	20127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008564	T	6	6	20192	20197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008564	ATTT	2	8	20533	20540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008564	TAAAT	2	10	20566	20575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_008564	TTAA	2	8	20621	20628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008564	TTA	2	6	22606	22611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008564	AAC	2	6	22628	22633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_008564	TAATT	2	10	22809	22818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008564	TTTA	2	8	22830	22837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008564	GTT	2	6	22880	22885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_008564	TTA	2	6	23660	23665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_008564	TTA	2	6	24349	24354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_008564	T	6	6	24415	24420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_008564	T	7	7	26137	26143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_008564	TTA	2	6	26146	26151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_008564	TTAA	2	8	26169	26176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_008564	T	6	6	26215	26220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_008564	A	9	9	26225	26233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_008564	T	7	7	26348	26354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_008564	ATT	2	6	26420	26425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_008564	ATT	2	6	28179	28184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_008564	A	7	7	33463	33469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_008564	TAAT	2	8	48847	48854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008564	AAT	2	6	48877	48882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_008564	A	7	7	48893	48899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_008564	T	7	7	48918	48924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_008564	GTG	2	6	48925	48930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_008564	A	7	7	49682	49688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_008564	TAA	2	6	50450	50455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.