MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 2

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008543	GCCCGG	2	12	2583	2594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008543	GCGGGG	2	12	2658	2669	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008543	CCGGCA	2	12	3282	3293	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008543	GCGTGC	2	12	17005	17016	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008543	TGCCAC	2	12	30155	30166	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008543	CGAGCG	2	12	75219	75230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008543	AATATT	2	12	116701	116712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008543	CGTCAC	2	12	126710	126721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008543	AACACT	2	12	140794	140805	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008543	CCGCGC	2	12	144114	144125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008543	TTGTCG	2	12	188122	188133	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008543	GTGCCG	2	12	195558	195569	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008543	CGAGGC	2	12	195733	195744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008543	GCCGAT	2	12	195818	195829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008543	CGAGCC	2	12	195835	195846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008543	CGATCG	2	12	196231	196242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008543	GTTGAC	2	12	210123	210134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008543	GACGCA	2	12	223211	223222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008543	GGCGGG	2	12	224480	224491	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008543	CGACGG	2	12	257581	257592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008543	GCTTTT	2	12	262070	262081	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008543	CGGCAG	2	12	280254	280265	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008543	TTTCTA	2	12	290831	290842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008543	TGTGCG	2	12	294712	294723	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008543	GTTTTT	2	12	324815	324826	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008543	CGTTGT	2	12	356779	356790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008543	CGGCGC	2	12	378671	378682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008543	CGATAT	2	12	428029	428040	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008543	GCGGGC	2	12	449524	449535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008543	CCGATA	2	12	456369	456380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008543	AGGTGA	2	12	463482	463493	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008543	TTCTCT	2	12	498579	498590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008543	TGGGTC	2	12	517675	517686	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008543	ATCCGA	2	12	522443	522454	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008543	TCGACC	2	12	558369	558380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008543	CGGCGA	2	12	568641	568652	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008543	TATGCA	2	12	616900	616911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008543	CCCGCA	2	12	620665	620676	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008543	GCATCG	2	12	705866	705877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008543	CCCGAG	2	12	746573	746584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008543	CCGATG	2	12	780143	780154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008543	GGCGCG	2	12	804382	804393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008543	TTGTTC	2	12	814237	814248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008543	ATTTTC	2	12	834970	834981	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008543	CCGCGC	2	12	835460	835471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008543	TGTCGG	2	12	866024	866035	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008543	GCTCGC	2	12	866698	866709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008543	CGGGGC	2	12	876581	876592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008543	GCAGCG	2	12	906334	906345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008543	GGAAGC	2	12	908122	908133	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008543	GAACCG	2	12	910285	910296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008543	ATGACG	3	18	916783	916800	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008543	CGCACT	2	12	918360	918371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008543	GGGCGC	2	12	1048069	1048080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008543	AGCGCG	2	12	1094011	1094022	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008543	CCAGCG	2	12	1094034	1094045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008543	GAAGTT	2	12	1094199	1094210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008543	TCGCGC	2	12	1095676	1095687	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008543	CCGGCA	2	12	1096050	1096061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008543	CCGTCT	2	12	1102693	1102704	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008543	TGAAAT	2	12	1102747	1102758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008543	GCCGCA	2	12	1120187	1120198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008543	CGCCGG	2	12	1135438	1135449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008543	GTTCGA	2	12	1136452	1136463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008543	GGGCCG	2	12	1152182	1152193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008543	AAGGGG	2	12	1176897	1176908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008543	TCCGGC	2	12	1183335	1183346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008543	GGCCGT	2	12	1262812	1262823	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008543	AGGCGG	2	12	1293518	1293529	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008543	CGCCGG	2	12	1334165	1334176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008543	ATGGCG	2	12	1342659	1342670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008543	TTTCTG	2	12	1353775	1353786	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008543	GCGATT	2	12	1385310	1385321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008543	GGGGAT	2	12	1401140	1401151	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008543	GTCGGT	2	12	1414949	1414960	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008543	CCGCGG	2	12	1417463	1417474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008543	CCGATG	2	12	1417886	1417897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008543	CAACGA	2	12	1436713	1436724	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008543	CCCGTC	2	12	1467756	1467767	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008543	CCCTTG	2	12	1502713	1502724	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008543	CACTCC	2	12	1502732	1502743	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008543	CGGCCC	2	12	1581058	1581069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008543	CGGCAG	2	12	1582454	1582465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008543	ACACGT	2	12	1606674	1606685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008543	ATATTG	2	12	1640545	1640556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008543	CTCCTG	2	12	1641511	1641522	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008543	CACGCC	2	12	1646542	1646553	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008543	CATATC	2	12	1655186	1655197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008543	GCACCG	5	30	1673856	1673885	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008543	GCCCGC	2	12	1674800	1674811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008543	GCCCCC	2	12	1679428	1679439	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_008543	CGTGCG	2	12	1717433	1717444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008543	TTGCAA	2	12	1724765	1724776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008543	TTCGGT	2	12	1810319	1810330	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008543	TATGCA	2	12	1810398	1810409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008543	CGCGCC	2	12	1829683	1829694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008543	ACTGTC	2	12	1863226	1863237	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008543	TGGTAT	2	12	1939317	1939328	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008543	ATCGTT	2	12	1939885	1939896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008543	TTCAGC	2	12	1948919	1948930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008543	CGCTGG	2	12	1949202	1949213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008543	GGTTCG	2	12	1956559	1956570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008543	CGCCGG	2	12	1958363	1958374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008543	TCGCCG	2	12	2029381	2029392	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008543	AAAAAT	2	12	2041174	2041185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008543	GTCGGC	2	12	2052059	2052070	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008543	GCCGGC	2	12	2058917	2058928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008543	AACGGA	2	12	2068750	2068761	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008543	TCGCCG	2	12	2088335	2088346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008543	CCGGCA	2	12	2141473	2141484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008543	CGTCGC	2	12	2147392	2147403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008543	TCGGCG	2	12	2152512	2152523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008543	CGAAGC	2	12	2155873	2155884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008543	CGAGCA	2	12	2162110	2162121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008543	CGTTCA	2	12	2225461	2225472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008543	TTCGGC	2	12	2257753	2257764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008543	GACGCG	2	12	2304172	2304183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008543	GGCCAC	2	12	2304390	2304401	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008543	GCCCGC	2	12	2327939	2327950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008543	AGCGCG	2	12	2403759	2403770	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008543	TCAGGA	2	12	2425080	2425091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008543	CCGCTC	2	12	2521337	2521348	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008543	GCGGCA	2	12	2569608	2569619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008543	CGGGAG	2	12	2599659	2599670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008543	CGATGA	2	12	2638887	2638898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008543	AACGCG	2	12	2654202	2654213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008543	TTGCGC	2	12	2663901	2663912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008543	CGAGCG	2	12	2678348	2678359	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008543	GCGTGC	2	12	2690946	2690957	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008543	CAAGAT	2	12	2694996	2695007	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008543	GAAAAT	2	12	2718142	2718153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008543	CAGGAT	2	12	2718874	2718885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_008543	TGCGCG	2	12	2723690	2723701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008543	TTCGCG	2	12	2738139	2738150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008543	CGATAT	2	12	2760131	2760142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_008543	TTACGT	2	12	2812894	2812905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_008543	CTGTCG	2	12	2863774	2863785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008543	CAATCG	2	12	2863936	2863947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008543	GGCCGG	2	12	2868771	2868782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008543	AAGCCG	2	12	2882756	2882767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008543	GGATCG	2	12	2937702	2937713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_008543	TCTTTT	2	12	2941490	2941501	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_008543	GCGCGG	2	12	2988272	2988283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.