MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 11078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008542	CGC	2	6	599305	599310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2002	NC_008542	GCG	2	6	599319	599324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_008542	GGCG	2	8	601944	601951	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2004	NC_008542	GTGA	2	8	603174	603181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_008542	GGC	3	9	604958	604966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_008542	TGA	2	6	604968	604973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_008542	ATTA	2	8	604995	605002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_008542	ACCG	2	8	605003	605010	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_008542	TCATT	2	10	605061	605070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2010	NC_008542	GAG	2	6	605075	605080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_008542	TGGC	2	8	605889	605896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2012	NC_008542	TCA	2	6	605932	605937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_008542	TTC	2	6	605980	605985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_008542	CGCGG	2	10	606049	606058	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2015	NC_008542	GGAAG	2	10	606061	606070	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_008542	CGG	2	6	606087	606092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_008542	CGG	2	6	606103	606108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_008542	GTT	2	6	606152	606157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_008542	CTG	3	9	606194	606202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_008542	GCT	2	6	606213	606218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_008542	TGA	2	6	606283	606288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_008542	AAGT	2	8	606341	606348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_008542	TGAG	2	8	606384	606391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_008542	AACCG	2	10	606404	606413	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2025	NC_008542	GGC	2	6	606468	606473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_008542	GCA	2	6	606499	606504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_008542	TGG	2	6	606519	606524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_008542	TGG	2	6	606679	606684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_008542	CGA	2	6	606703	606708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_008542	GAC	2	6	606728	606733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_008542	GCA	2	6	606777	606782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_008542	GT	3	6	606830	606835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_008542	GAA	2	6	606836	606841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_008542	GAAA	2	8	606872	606879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_008542	GAA	2	6	606917	606922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_008542	CAG	2	6	606945	606950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_008542	G	6	6	607092	607097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_008542	GGA	2	6	607136	607141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_008542	GTT	2	6	607255	607260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_008542	GAT	2	6	607370	607375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_008542	TACC	2	8	607407	607414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2042	NC_008542	CTG	2	6	607433	607438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_008542	TGC	2	6	607476	607481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_008542	GTC	2	6	607488	607493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_008542	TCGTG	2	10	607497	607506	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2046	NC_008542	GGA	2	6	607595	607600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_008542	AC	3	6	607815	607820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_008542	AGG	2	6	607874	607879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_008542	CAC	2	6	607885	607890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2050	NC_008542	CCT	2	6	607956	607961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2051	NC_008542	AGAC	2	8	608015	608022	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2052	NC_008542	CAC	2	6	608099	608104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_008542	TG	3	6	608110	608115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_008542	AC	3	6	608121	608126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2055	NC_008542	GTC	2	6	608190	608195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_008542	CCA	2	6	608215	608220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_008542	ATG	2	6	608243	608248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_008542	GAA	2	6	608328	608333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_008542	GTAA	2	8	608334	608341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_008542	GAT	2	6	608413	608418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_008542	TGG	2	6	608517	608522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_008542	GCGAA	2	10	608665	608674	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2063	NC_008542	AGT	2	6	608733	608738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_008542	GCGA	2	8	608740	608747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2065	NC_008542	G	6	6	608901	608906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_008542	TCC	2	6	608911	608916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2067	NC_008542	GGGAG	2	10	608983	608992	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_008542	GCAT	2	8	609012	609019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2069	NC_008542	AAAC	2	8	609280	609287	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2070	NC_008542	TC	3	6	609303	609308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2071	NC_008542	G	6	6	609369	609374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_008542	GACA	2	8	609434	609441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2073	NC_008542	AAC	2	6	609472	609477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2074	NC_008542	AGG	2	6	609545	609550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_008542	AGC	2	6	609561	609566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_008542	AAAG	2	8	609575	609582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_008542	GTC	2	6	609603	609608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2078	NC_008542	TA	3	6	609637	609642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_008542	G	6	6	609908	609913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_008542	GA	3	6	610132	610137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_008542	AGG	2	6	610217	610222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_008542	TGG	2	6	610243	610248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_008542	TAA	2	6	610260	610265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_008542	ATG	2	6	610336	610341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_008542	TTGA	2	8	610354	610361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2087	NC_008542	TCC	2	6	610467	610472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2088	NC_008542	TGA	2	6	610500	610505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_008542	ACC	2	6	610645	610650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2090	NC_008542	GTTT	2	8	610654	610661	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_008542	TCC	2	6	610731	610736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2092	NC_008542	GGA	2	6	610748	610753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_008542	GGT	2	6	610868	610873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_008542	CGG	2	6	610955	610960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_008542	CTCAT	2	10	610982	610991	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2096	NC_008542	CGT	2	6	611063	611068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_008542	GCT	2	6	611117	611122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_008542	GT	3	6	611316	611321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_008542	GT	3	6	611451	611456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_008542	AC	3	6	611460	611465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2101	NC_008542	CTT	2	6	611479	611484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_008542	GCAAC	2	10	611507	611516	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2103	NC_008542	TGA	2	6	611530	611535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_008542	GAT	2	6	611597	611602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_008542	CCCG	2	8	611658	611665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2106	NC_008542	GCG	2	6	611690	611695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_008542	CAAT	2	8	611754	611761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2108	NC_008542	TCAA	2	8	611826	611833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2109	NC_008542	TCT	2	6	611843	611848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_008542	CCG	2	6	611921	611926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2111	NC_008542	ATC	2	6	611932	611937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_008542	ATC	2	6	614106	614111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_008542	TGT	2	6	614153	614158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_008542	CGGGG	2	10	614161	614170	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2115	NC_008542	GAG	2	6	614214	614219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_008542	CG	3	6	614221	614226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2117	NC_008542	ACGC	2	8	615911	615918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2118	NC_008542	T	6	6	615957	615962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_008542	GCG	2	6	616011	616016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_008542	T	7	7	617570	617576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_008542	GGCGG	2	10	617577	617586	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2122	NC_008542	AAG	2	6	617624	617629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_008542	TGC	2	6	617673	617678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_008542	CAA	2	6	617707	617712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_008542	AAT	2	6	617748	617753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_008542	CGC	2	6	618472	618477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2127	NC_008542	CTCC	2	8	618506	618513	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2128	NC_008542	TCAT	2	8	618597	618604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2129	NC_008542	CTAA	2	8	618661	618668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2130	NC_008542	A	6	6	618680	618685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_008542	TG	3	6	618755	618760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_008542	GAAG	3	12	625360	625371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_008542	GGAAC	2	10	632804	632813	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2134	NC_008542	GA	3	6	633573	633578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_008542	CGG	2	6	634859	634864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_008542	GC	3	6	634868	634873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2137	NC_008542	CA	3	6	636145	636150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2138	NC_008542	GCCGG	2	10	636231	636240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2139	NC_008542	GAGCG	2	10	636261	636270	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2140	NC_008542	GTGCG	2	10	636838	636847	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2141	NC_008542	GCT	2	6	636866	636871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_008542	TGA	2	6	636902	636907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2144	NC_008542	TGAT	2	8	637043	637050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_008542	TCAA	2	8	637055	637062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2146	NC_008542	GAA	2	6	637066	637071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_008542	A	6	6	638015	638020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2148	NC_008542	CTCA	2	8	638060	638067	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2149	NC_008542	TGAG	2	8	638079	638086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2150	NC_008542	GGA	2	6	638101	638106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_008542	GCA	2	6	639165	639170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2152	NC_008542	ACA	2	6	639238	639243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2153	NC_008542	CAT	2	6	639296	639301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2155	NC_008542	TGGC	2	8	639404	639411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2156	NC_008542	GCC	2	6	639413	639418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2158	NC_008542	CG	4	8	639932	639939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2159	NC_008542	GGC	2	6	639979	639984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2161	NC_008542	GC	3	6	640010	640015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2162	NC_008542	CCGG	2	8	640025	640032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2163	NC_008542	GCC	2	6	640094	640099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2164	NC_008542	GC	3	6	640117	640122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2165	NC_008542	TGC	2	6	640142	640147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2257	NC_008542	GCGCG	2	10	672720	672729	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2262	NC_008542	GC	3	6	673312	673317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2268	NC_008542	GCG	2	6	678267	678272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2272	NC_008542	CGA	2	6	679006	679011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2274	NC_008542	TCG	2	6	680179	680184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2413	NC_008542	CGGC	2	8	723995	724002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2414	NC_008542	GGC	2	6	724015	724020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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