MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008392	AGGC	2	8	4806	4813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008392	CAAC	2	8	5049	5056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008392	TGCG	2	8	7763	7770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008392	GCCG	2	8	7835	7842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008392	CGAA	2	8	10696	10703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008392	CAAA	2	8	11955	11962	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008392	CTCC	2	8	16636	16643	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_008392	CCCG	2	8	16742	16749	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_008392	CCCG	2	8	38320	38327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008392	AAGC	2	8	41363	41370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008392	GCCT	2	8	42941	42948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008392	CGCC	2	8	48160	48167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_008392	ATGG	2	8	52953	52960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008392	GGCC	2	8	53512	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008392	ATGG	2	8	53857	53864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008392	CGGC	2	8	53873	53880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008392	CGGG	2	8	54191	54198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008392	GCCG	2	8	54304	54311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008392	CTGC	2	8	54342	54349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008392	CCAA	2	8	56476	56483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008392	CATT	2	8	56490	56497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008392	ATCG	2	8	62185	62192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008392	GCCG	2	8	63878	63885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008392	TGCG	2	8	66848	66855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008392	GCCG	2	8	76738	76745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008392	TCCG	2	8	76748	76755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008392	CGGC	2	8	79809	79816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008392	TCGG	2	8	93013	93020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008392	GAGC	2	8	93127	93134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008392	GGCC	2	8	93152	93159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008392	CGGC	2	8	93702	93709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008392	TCCT	2	8	98879	98886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008392	GACG	2	8	98899	98906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008392	CGGC	2	8	98953	98960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008392	GGCG	2	8	100642	100649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008392	AGGT	2	8	102230	102237	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008392	CCTG	2	8	102561	102568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008392	CGTC	2	8	102718	102725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008392	GCCG	2	8	104661	104668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008392	CCCG	2	8	105025	105032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_008392	CCCG	2	8	105090	105097	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008392	GCGG	2	8	112377	112384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008392	GGCA	2	8	112600	112607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008392	GCCG	2	8	121413	121420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008392	TTCG	2	8	122487	122494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008392	GCCG	2	8	126317	126324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008392	CATG	2	8	128451	128458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008392	TGCA	2	8	128475	128482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008392	CGGG	2	8	128509	128516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008392	CATT	2	8	131483	131490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008392	GCGA	2	8	131617	131624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008392	GAAT	2	8	131783	131790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008392	GTGC	2	8	137621	137628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008392	CTCC	2	8	139177	139184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008392	GATG	2	8	139271	139278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008392	ATTC	2	8	141880	141887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008392	ACCA	2	8	152875	152882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008392	TTCG	2	8	153042	153049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008392	CATT	2	8	153072	153079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008392	CACT	2	8	153257	153264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008392	CGCT	2	8	153297	153304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008392	CCGT	2	8	165576	165583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008392	TCGG	2	8	165595	165602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008392	TGAA	2	8	165626	165633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008392	GGCA	2	8	166969	166976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008392	GACG	2	8	167797	167804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008392	GTCC	2	8	167833	167840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008392	GAAT	2	8	171585	171592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008392	CGAC	2	8	171662	171669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008392	GTCG	2	8	173635	173642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008392	CGAT	2	8	173645	173652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008392	CCCG	2	8	176881	176888	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_008392	GCCG	2	8	177807	177814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008392	CGGG	2	8	177821	177828	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008392	CGAT	2	8	177865	177872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008392	CACT	2	8	177999	178006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008392	TCGA	2	8	179326	179333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008392	GCAT	2	8	179335	179342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008392	CCGA	2	8	181644	181651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008392	GCAG	2	8	184254	184261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008392	GACG	2	8	184275	184282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008392	GCCA	2	8	184492	184499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008392	GCCG	2	8	184605	184612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008392	TCGA	2	8	188016	188023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008392	TCGA	2	8	188141	188148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008392	CACC	2	8	188732	188739	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_008392	GCGT	2	8	190122	190129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008392	TGCG	2	8	193160	193167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008392	TGCG	2	8	194350	194357	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008392	GGAC	2	8	194837	194844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008392	GACG	2	8	195809	195816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008392	CGTT	2	8	201003	201010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008392	AACC	2	8	201895	201902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008392	CAAT	2	8	203030	203037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008392	GATC	2	8	203040	203047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008392	TAGC	2	8	203660	203667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008392	TTCG	2	8	205280	205287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008392	CCCA	2	8	209887	209894	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_008392	ATTC	2	8	212060	212067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008392	GCCA	2	8	215800	215807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008392	CCGG	2	8	215910	215917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008392	TCGA	2	8	217206	217213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008392	GTTG	2	8	217364	217371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008392	GCCG	2	8	217388	217395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008392	CTCA	2	8	221184	221191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008392	CCGA	2	8	221280	221287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008392	GTTG	2	8	226053	226060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008392	TCCA	2	8	226620	226627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008392	ATCG	2	8	226935	226942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008392	TGCC	2	8	227086	227093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008392	CGGG	2	8	227130	227137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008392	GTTC	2	8	241104	241111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008392	CGGC	2	8	244819	244826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008392	GGGC	2	8	244863	244870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008392	CGAT	2	8	245051	245058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008392	CGCC	2	8	247879	247886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_008392	ACGC	2	8	247903	247910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008392	ACCG	2	8	248618	248625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008392	GCCC	2	8	248845	248852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008392	CAGC	2	8	252158	252165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008392	CGTC	2	8	252223	252230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008392	GTGC	2	8	253353	253360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008392	CACG	2	8	253386	253393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008392	GTCG	2	8	254530	254537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008392	CCGC	2	8	254540	254547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_008392	GTCC	2	8	256485	256492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008392	GTCG	2	8	259951	259958	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008392	GGCC	2	8	260011	260018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008392	ACGC	2	8	260182	260189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008392	CGTC	2	8	260212	260219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008392	ACGC	2	8	260220	260227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008392	CCGG	2	8	267383	267390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008392	CGAT	2	8	268499	268506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008392	GCTT	2	8	269491	269498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008392	GCAC	2	8	270757	270764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008392	ACCG	2	8	270788	270795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008392	TGCG	2	8	270982	270989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008392	GCCC	2	8	272367	272374	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_008392	GGAC	2	8	272381	272388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008392	GCCG	2	8	273253	273260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008392	TCGA	2	8	273303	273310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008392	ATTG	2	8	273406	273413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008392	GCCC	2	8	273760	273767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_008392	TCGG	2	8	273786	273793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008392	GCAC	2	8	274126	274133	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008392	CTTC	2	8	274157	274164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008392	ATCG	2	8	274168	274175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008392	CGCA	2	8	274601	274608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008392	GCCG	2	8	274816	274823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008392	GACC	2	8	275613	275620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008392	CCTG	2	8	279650	279657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_008392	CGGC	2	8	955452	955459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_008392	GCCG	2	8	958974	958981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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