MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 2

Total Repeats: 8988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008391	GCG	2	6	3	8	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008391	TTG	2	6	2223	2228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008391	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008391	CG	3	6	2273	2278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008391	GC	3	6	4153	4158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008391	GGC	2	6	4606	4611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008391	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008391	CG	3	6	4629	4634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008391	GAC	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008391	CTT	2	6	4699	4704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008391	GCG	2	6	6354	6359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008391	T	6	6	6384	6389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008391	CG	5	10	7243	7252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008391	CGA	2	6	7264	7269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008391	GTGG	2	8	7272	7279	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008391	ACG	2	6	7280	7285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008391	CG	3	6	7298	7303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008391	GTT	2	6	7332	7337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008391	GCC	2	6	7347	7352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008391	CGT	2	6	8118	8123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008391	GCCGC	2	10	8124	8133	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_008391	CGC	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008391	CG	3	6	8147	8152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008391	CGC	2	6	8171	8176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008391	GGTCG	2	10	9689	9698	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008391	CGTAAT	2	12	9716	9727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008391	CGG	2	6	9798	9803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008391	GC	3	6	9813	9818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008391	GGAA	2	8	10526	10533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008391	CG	3	6	10565	10570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008391	T	6	6	10643	10648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008391	GCC	2	6	10651	10656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008391	GC	3	6	10668	10673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008391	GATC	2	8	11954	11961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008391	GGCT	2	8	12152	12159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008391	CGGTC	2	10	12697	12706	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008391	TG	3	6	12755	12760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008391	GAA	2	6	12774	12779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008391	GCG	2	6	13280	13285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008391	ATT	2	6	13315	13320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008391	GC	3	6	13323	13328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008391	GGGC	2	8	13394	13401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008391	CGGC	2	8	13420	13427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008391	TGCG	2	8	13428	13435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008391	CCGG	2	8	13436	13443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008391	GTCAG	2	10	15259	15268	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008391	CG	4	8	15278	15285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008391	GCG	2	6	15290	15295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008391	AGG	2	6	15300	15305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008391	CGAC	2	8	15333	15340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008391	GCG	2	6	15341	15346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008391	CGG	2	6	15347	15352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008391	CGGCC	2	10	15809	15818	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_008391	GGC	2	6	15844	15849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008391	CCGG	2	8	17456	17463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008391	GC	3	6	17543	17548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008391	GC	3	6	17560	17565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008391	C	6	6	17609	17614	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_008391	GTG	2	6	17799	17804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008391	CGG	2	6	17862	17867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008391	GCG	2	6	17889	17894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008391	GAC	2	6	17937	17942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008391	GAA	2	6	17989	17994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008391	CAA	2	6	17995	18000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008391	TGATT	2	10	18233	18242	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008391	TCG	3	9	18774	18782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008391	CAC	2	6	18804	18809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008391	GCC	2	6	19941	19946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008391	GCC	2	6	19956	19961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008391	TCGAG	2	10	20030	20039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008391	GATC	2	8	20048	20055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008391	TTC	2	6	20124	20129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008391	GGC	2	6	20160	20165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008391	TCG	2	6	20271	20276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008391	CGG	2	6	20284	20289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008391	CGC	2	6	20304	20309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008391	CCGG	2	8	20383	20390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008391	TCG	2	6	20415	20420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008391	GCC	2	6	20442	20447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008391	GCGG	2	8	20462	20469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008391	G	6	6	20839	20844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008391	G	6	6	20857	20862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008391	ACGCC	2	10	20863	20872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_008391	CG	3	6	20896	20901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008391	AGGCG	2	10	20906	20915	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008391	TGTT	2	8	20916	20923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008391	CGG	2	6	20925	20930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008391	GCA	2	6	20966	20971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008391	TGCC	2	8	21122	21129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008391	GCCG	2	8	21152	21159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008391	GGCC	2	8	21163	21170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008391	TCGA	2	8	21178	21185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008391	TTG	2	6	24736	24741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008391	GCG	2	6	24829	24834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008391	GAT	2	6	24885	24890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008391	GCG	2	6	24914	24919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008391	CGG	2	6	24943	24948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008391	CAG	2	6	24949	24954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008391	CGGG	2	8	26330	26337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008391	GCG	2	6	26449	26454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008391	TTG	2	6	26456	26461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008391	GGGC	2	8	26496	26503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008391	CGAT	2	8	26515	26522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008391	CGT	2	6	26538	26543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008391	ATT	2	6	26583	26588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008391	GCG	2	6	26614	26619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008391	CCG	2	6	26629	26634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008391	CCG	2	6	26650	26655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008391	CGG	2	6	26692	26697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008391	GAG	2	6	26708	26713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008391	CGG	2	6	27605	27610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008391	GCC	2	6	27616	27621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008391	CGT	2	6	27623	27628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008391	A	7	7	28564	28570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008391	ATGCG	2	10	28603	28612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008391	GC	3	6	28620	28625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008391	CG	4	8	28626	28633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008391	AAC	2	6	29773	29778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008391	T	6	6	29867	29872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008391	CGC	2	6	31196	31201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008391	GTGC	2	8	31218	31225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008391	GCC	2	6	33179	33184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008391	GCGG	2	8	33186	33193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008391	CGT	2	6	33291	33296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008391	CG	3	6	33301	33306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008391	CGT	2	6	34142	34147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008391	TTTG	2	8	34190	34197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008391	GT	3	6	34203	34208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008391	GC	3	6	34211	34216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008391	GC	3	6	35292	35297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008391	GC	3	6	35306	35311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008391	AGGT	2	8	35315	35322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008391	CCG	2	6	35361	35366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008391	GGC	2	6	35369	35374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008391	CGT	2	6	36642	36647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008391	CG	3	6	36957	36962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008391	GCG	2	6	36972	36977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008391	GCG	2	6	37593	37598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008391	T	6	6	37622	37627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008391	TATAA	2	10	39547	39556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008391	GTTT	2	8	39568	39575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008391	CGC	2	6	42039	42044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008391	GTC	2	6	42082	42087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008391	TGT	2	6	42090	42095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008391	CCGGC	2	10	42103	42112	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146	NC_008391	AGC	2	6	42180	42185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008391	G	6	6	42221	42226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008391	CCA	2	6	42228	42233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_008391	ATC	2	6	42247	42252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008391	CA	3	6	42352	42357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008391	GTC	2	6	44467	44472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008391	ATGC	2	8	44502	44509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008391	GACAC	2	10	44537	44546	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_008391	TCA	2	6	44842	44847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_008391	ACGG	2	8	44850	44857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_008391	TGG	2	6	44910	44915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_008391	CGG	2	6	49594	49599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_008391	GGC	2	6	50306	50311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_008391	ATGC	2	8	50336	50343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_008391	ATT	2	6	55672	55677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008391	GGA	2	6	55682	55687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008391	AAG	2	6	55699	55704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_008391	TA	3	6	58843	58848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008391	GCG	2	6	58874	58879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_008391	GC	3	6	58883	58888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
188	NC_008391	GTC	2	6	58897	58902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_008391	GC	3	6	92942	92947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_008391	AGCGC	2	10	92956	92965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
274	NC_008391	CG	3	6	92966	92971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
275	NC_008391	GC	3	6	92996	93001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
276	NC_008391	CGA	2	6	93047	93052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_008391	C	6	6	93297	93302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
284	NC_008391	TCC	2	6	93310	93315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_008391	ATTG	2	8	93365	93372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_008391	CGGCC	2	10	94587	94596	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
287	NC_008391	GCC	3	9	94594	94602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_008391	CGC	2	6	94607	94612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_008391	CGG	2	6	94613	94618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_008391	A	7	7	94626	94632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008391	CCG	2	6	94669	94674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_008391	GGC	2	6	94678	94683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_008391	CG	4	8	98953	98960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
294	NC_008391	CCG	2	6	99520	99525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_008391	GC	3	6	99555	99560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
296	NC_008391	T	6	6	99621	99626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_008391	TG	3	6	99642	99647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
298	NC_008391	TCT	2	6	100701	100706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_008391	GC	3	6	100762	100767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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328	NC_008391	CG	3	6	112029	112034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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331	NC_008391	CG	3	6	112589	112594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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334	NC_008391	GGC	2	6	112664	112669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
335	NC_008391	GCG	2	6	114230	114235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
336	NC_008391	GCC	2	6	114243	114248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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339	NC_008391	GCG	2	6	114327	114332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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413	NC_008391	CCA	3	9	134761	134769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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418	NC_008391	CG	3	6	137308	137313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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420	NC_008391	GGC	2	6	137381	137386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_008391	TCG	2	6	137392	137397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_008391	GCG	2	6	137501	137506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_008391	CCGCGC	2	12	137539	137550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_008391	GCG	2	6	137551	137556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_008391	C	6	6	141178	141183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
429	NC_008391	GC	3	6	141193	141198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
430	NC_008391	CGC	3	9	143277	143285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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465	NC_008391	GCG	2	6	162072	162077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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485	NC_008391	CG	3	6	165190	165195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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