MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	ATTTTA	2	12	21918	21929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008277	AATTAA	2	12	45145	45156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008277	TAAATT	2	12	79105	79116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008277	ATTAAA	2	12	86628	86639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008277	CAATAA	2	12	101084	101095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008277	AAAACT	2	12	101179	101190	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008277	ATTAAA	2	12	109316	109327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008277	ATAGCA	2	12	148209	148220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008277	TTAAAA	2	12	202720	202731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008277	AAAATA	2	12	203528	203539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008277	TAAATA	2	12	244507	244518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008277	TAATAG	2	12	354219	354230	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008277	TTAAAA	2	12	358009	358020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008277	AAATTT	2	12	389190	389201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008277	TAAAAA	2	12	393532	393543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008277	TAAAAA	2	12	395213	395224	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008277	TTAATA	2	12	412750	412761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008277	TTCAAA	2	12	418814	418825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008277	ATTAGT	2	12	437553	437564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008277	TCGCTT	2	12	439749	439760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008277	ATTAGT	2	12	440790	440801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008277	TCGCTT	2	12	442986	442997	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008277	AATAAA	2	12	446206	446217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008277	CAATTT	2	12	446256	446267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008277	AAATTG	2	12	446271	446282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008277	TTCGCC	2	12	449237	449248	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008277	CTATTA	2	12	462069	462080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008277	AATAAG	2	12	551717	551728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008277	TAAATT	2	12	581015	581026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008277	TAATTA	2	12	594011	594022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008277	AATTTT	2	12	614965	614976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008277	TTAGTT	2	12	632748	632759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008277	TTGTTT	2	12	681668	681679	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008277	TCTTTA	2	12	692105	692116	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008277	TTTAAT	2	12	709298	709309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008277	ATTATA	2	12	734932	734943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008277	AATTTT	2	12	761601	761612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008277	TTTATG	2	12	779361	779372	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008277	TATTTT	2	12	779405	779416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008277	TCTAAA	2	12	786447	786458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008277	AAATTA	2	12	797181	797192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008277	GTTTTA	2	12	823026	823037	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008277	TAATGT	2	12	832655	832666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008277	GAATTT	2	12	832692	832703	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008277	TATTTT	2	12	889938	889949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.