MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 3

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008062	TCCGCA	2	12	4432	4443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008062	CGGCCC	2	12	4456	4467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008062	GACCGC	2	12	72360	72371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008062	TGCCGA	2	12	75900	75911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008062	CGGTCG	2	12	76452	76463	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008062	TCCGCA	2	12	83554	83565	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008062	TAGAAA	2	12	151928	151939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008062	CCATGC	2	12	152154	152165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008062	TGGCGC	2	12	160543	160554	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008062	TCAAGG	2	12	217712	217723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008062	GGTTCG	2	12	245984	245995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008062	GCCGCT	2	12	269516	269527	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008062	AGCGCG	2	12	312491	312502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008062	ACCGCG	2	12	312596	312607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008062	GTGCTA	2	12	324323	324334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008062	GCCCCG	2	12	326864	326875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008062	CGGCGC	2	12	328120	328131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008062	TCGCGG	2	12	360957	360968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008062	GCACTC	2	12	364967	364978	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008062	CGAAGC	2	12	366023	366034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008062	GACGGT	2	12	366339	366350	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008062	GAAAAC	2	12	396721	396732	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008062	GGAGCA	2	12	398268	398279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008062	GCGTGC	2	12	403440	403451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008062	CGTTCG	2	12	423729	423740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008062	CGCCTG	2	12	479831	479842	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008062	TGCCCG	2	12	509913	509924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008062	CGTTTT	2	12	537566	537577	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008062	CTGTGC	2	12	555123	555134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008062	CGGGGG	2	12	577938	577949	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008062	CTTTTT	2	12	588678	588689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008062	CCGGCG	2	12	625922	625933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008062	CCGGGC	2	12	630421	630432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008062	AGCGGG	2	12	702113	702124	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008062	GCCGGC	2	12	705866	705877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008062	CATCGG	2	12	712808	712819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008062	GGCGCA	2	12	726585	726596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008062	GGGCCC	2	12	766230	766241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008062	GCCGGC	2	12	766277	766288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008062	CGGTGT	2	12	782841	782852	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008062	AACGAA	2	12	802448	802459	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008062	CGGCCG	2	12	805044	805055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008062	ACGGGC	2	12	821493	821504	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008062	ACGTTC	2	12	858481	858492	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008062	GCGCCG	2	12	896230	896241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008062	CGCATG	2	12	901563	901574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008062	TGCCCG	2	12	906785	906796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008062	GCGCCG	2	12	915678	915689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008062	AGCCGC	2	12	933043	933054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008062	GCGGGA	2	12	943007	943018	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008062	TCTGCA	2	12	950951	950962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008062	AATCGA	2	12	973219	973230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008062	TGCCGG	2	12	976083	976094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008062	CGTCGC	2	12	990785	990796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008062	GACGGA	2	12	1001005	1001016	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008062	TCGGCA	2	12	1041618	1041629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008062	GCTCGC	2	12	1041688	1041699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008062	ACGCCG	2	12	1051484	1051495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008062	CGGCTT	2	12	1100268	1100279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008062	GCCGGC	2	12	1110790	1110801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008062	GCTGGC	2	12	1138533	1138544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008062	CGCGGA	2	12	1141200	1141211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008062	CTTCGA	2	12	1172285	1172296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.