MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia thailandensis E264 chromosome II

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007650	TGCGAG	2	12	21070	21081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007650	TTCGCT	2	12	44226	44237	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007650	GTCGGC	2	12	92082	92093	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007650	AGCGCG	2	12	111722	111733	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007650	TCGCGA	2	12	114441	114452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007650	CGCGGC	2	12	115810	115821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007650	CTGCGG	2	12	173604	173615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007650	GATTCG	2	12	205143	205154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007650	TCCCGG	2	12	232566	232577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007650	CGATGC	2	12	238493	238504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007650	CGGCGC	2	12	238986	238997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007650	CGCCAC	2	12	252983	252994	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007650	GGAACG	2	12	277012	277023	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007650	AAACAA	2	12	277267	277278	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007650	CATTTT	2	12	281081	281092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007650	GCCGGA	2	12	286623	286634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007650	CTCCGG	3	18	298869	298886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007650	CTCCGG	6	36	298893	298928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007650	CTCCGA	4	24	298929	298952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007650	GGCGCG	8	48	298957	299004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007650	CGCCGG	2	12	316165	316176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007650	GATTGA	2	12	319414	319425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007650	GAGCCG	2	12	337476	337487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007650	GGCCGG	2	12	347948	347959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007650	CGCTGT	2	12	393305	393316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007650	TGAACG	2	12	403165	403176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007650	GCGGGT	2	12	410869	410880	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007650	ACGCAT	2	12	426253	426264	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007650	GCCGGC	2	12	448527	448538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007650	GGAAGC	2	12	467342	467353	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007650	TCGGCG	2	12	474557	474568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007650	GTTCCG	2	12	478358	478369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007650	GACGGG	2	12	483873	483884	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007650	GCTGCG	2	12	495521	495532	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007650	AGGGCG	2	12	514214	514225	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007650	CGCCGA	2	12	517113	517124	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007650	ATTCGC	2	12	517444	517455	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007650	CGAAGC	2	12	518486	518497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007650	CGAAAT	2	12	536750	536761	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007650	CGGGCG	2	12	542916	542927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007650	GGCGCG	2	12	551778	551789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007650	GGGCGG	2	12	581800	581811	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007650	GCTCCG	2	12	603104	603115	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007650	TGGTCG	2	12	608894	608905	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007650	GCGACG	3	18	622419	622436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007650	GGCGCG	2	12	628458	628469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007650	CGGGCG	2	12	684850	684861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007650	AAATGA	2	12	689689	689700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007650	ATGCCG	2	12	702115	702126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007650	TACGGC	2	12	720402	720413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007650	GGGAGA	2	12	756637	756648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007650	CGCATC	2	12	782088	782099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007650	CGTGCC	3	18	782100	782117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007650	GCATCC	2	12	821303	821314	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007650	GCTGCC	2	12	825186	825197	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007650	TCCCGC	2	12	836905	836916	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007650	CGACGT	2	12	837590	837601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007650	AAATTC	2	12	843156	843167	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007650	GGCGCA	2	12	843552	843563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007650	GCGGGG	2	12	844736	844747	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007650	CTTTTC	2	12	892968	892979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007650	TGGGCA	2	12	909548	909559	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007650	ATGTAT	2	12	911165	911176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007650	CGCTGC	2	12	951493	951504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007650	TGCCGT	2	12	962747	962758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007650	GCCGGC	2	12	984466	984477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007650	TCGATG	2	12	991094	991105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007650	CGGGCG	2	12	1036002	1036013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007650	CGCGGC	2	12	1036025	1036036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007650	ATCGGA	2	12	1143472	1143483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007650	TCGCGC	2	12	1146594	1146605	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007650	TCGCGC	2	12	1156112	1156123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007650	AGGGCG	2	12	1160302	1160313	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007650	CGCGTG	2	12	1190671	1190682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007650	CCGGCG	2	12	1192208	1192219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007650	CGTGGC	2	12	1192220	1192231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007650	ACCGCC	2	12	1203326	1203337	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007650	CTGACG	2	12	1212764	1212775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007650	TTCATC	2	12	1241678	1241689	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007650	GTATTA	2	12	1251770	1251781	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007650	AGAATG	2	12	1265249	1265260	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007650	GCTGCG	2	12	1281310	1281321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007650	GTGACG	2	12	1296227	1296238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007650	TTCGCT	2	12	1322046	1322057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007650	GCTTTT	2	12	1322073	1322084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007650	CCGCGC	2	12	1324530	1324541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007650	GGGCGC	2	12	1334097	1334108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007650	CGTTCG	2	12	1350038	1350049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007650	CGGCCC	2	12	1361368	1361379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007650	GCCGTC	3	18	1380230	1380247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007650	ACCCCG	3	18	1393314	1393331	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007650	GAAGAG	2	12	1401809	1401820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007650	GAAGTT	2	12	1401828	1401839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007650	GCGCCC	2	12	1443165	1443176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007650	TGTTCG	2	12	1448161	1448172	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007650	TTCGAT	2	12	1482331	1482342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007650	CCTGCC	2	12	1484994	1485005	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007650	GCCCGC	2	12	1489781	1489792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007650	CGTTAC	2	12	1490117	1490128	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007650	TAACAT	2	12	1501559	1501570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007650	GGCTTG	8	48	1501702	1501749	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007650	CCGCGG	2	12	1511335	1511346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007650	AAATAG	2	12	1518447	1518458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007650	GGGCGC	2	12	1519780	1519791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007650	TTCGAG	2	12	1550203	1550214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007650	CGCATG	2	12	1557380	1557391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007650	AATCGC	2	12	1613218	1613229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007650	TTCGCC	2	12	1617650	1617661	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007650	CCCGGC	2	12	1626447	1626458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007650	GTCGAA	2	12	1627403	1627414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007650	AACGAA	2	12	1638054	1638065	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007650	CACGAC	2	12	1638563	1638574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007650	TGCGGC	2	12	1640475	1640486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007650	CGGCGC	2	12	1655474	1655485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007650	GCACGC	2	12	1657192	1657203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007650	CGCATA	2	12	1657206	1657217	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007650	GCGCGG	2	12	1662426	1662437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007650	CCGGCG	2	12	1663708	1663719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007650	GCCGCG	2	12	1676618	1676629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007650	ACAACG	2	12	1715759	1715770	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007650	GTTGCA	2	12	1725145	1725156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007650	ATATCG	2	12	1736069	1736080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007650	AACCGA	2	12	1750302	1750313	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007650	CCGACG	2	12	1780390	1780401	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007650	CCCGCG	2	12	1821245	1821256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007650	GCGCGA	2	12	1825390	1825401	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007650	GACGCG	2	12	1828916	1828927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007650	GCGCGG	2	12	1833250	1833261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007650	GCGCAC	2	12	1833355	1833366	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007650	CGCGGC	2	12	1841745	1841756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007650	CCGCGC	2	12	1845552	1845563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007650	TCGGAT	2	12	1848225	1848236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007650	GAAACC	2	12	1868416	1868427	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007650	CGCTCG	2	12	1890373	1890384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007650	CGGCTG	2	12	1890386	1890397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007650	GGCAAA	4	24	1890399	1890422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_007650	TTCCGA	2	12	1917085	1917096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007650	TGCGCG	2	12	1930899	1930910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007650	CGATGC	5	30	1939926	1939955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007650	CGGGCC	2	12	1947979	1947990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007650	CGCGCC	3	18	1948098	1948115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_007650	AGTGCC	11	66	1948116	1948181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007650	TCTCGC	2	12	2037066	2037077	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007650	TCATGC	2	12	2037879	2037890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007650	CGAACG	2	12	2038149	2038160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007650	CGGTGC	2	12	2053444	2053455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007650	CGAATA	2	12	2072536	2072547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_007650	CACCGC	2	12	2073777	2073788	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_007650	GCGATG	5	30	2091232	2091261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_007650	ACGCCG	2	12	2130303	2130314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007650	TCGCGC	2	12	2135178	2135189	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007650	GCTCGC	2	12	2160750	2160761	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007650	CCATGC	2	12	2188505	2188516	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
154	NC_007650	CACGCG	2	12	2198533	2198544	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007650	CATTTA	2	12	2216949	2216960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_007650	CGCCGG	2	12	2229122	2229133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_007650	ATCCCG	2	12	2271896	2271907	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
158	NC_007650	CGAGCG	2	12	2289409	2289420	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007650	GCATTC	2	12	2296208	2296219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_007650	GATGCC	2	12	2329952	2329963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_007650	CCCCGC	4	24	2329985	2330008	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
162	NC_007650	TCATGC	9	54	2330009	2330062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_007650	GTGCGC	2	12	2335626	2335637	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_007650	GCGCGT	2	12	2390268	2390279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_007650	GAGTGC	2	12	2399654	2399665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_007650	ATCGAT	2	12	2404935	2404946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_007650	CGGCAA	2	12	2421627	2421638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_007650	ATAAAA	2	12	2444545	2444556	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007650	TTGCGC	2	12	2488731	2488742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_007650	AAGCGT	2	12	2490005	2490016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_007650	CGCGGC	2	12	2502631	2502642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_007650	AATCGA	2	12	2514900	2514911	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_007650	CGAACG	2	12	2537743	2537754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_007650	CGCGGC	2	12	2617830	2617841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_007650	ATTCGC	2	12	2626179	2626190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_007650	CGAACG	2	12	2632400	2632411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_007650	CGTGCG	2	12	2704652	2704663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_007650	GCTTCG	2	12	2718457	2718468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_007650	CGAGCA	5	30	2729531	2729560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_007650	GCCGTC	2	12	2752782	2752793	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
185	NC_007650	CGCTCG	2	12	2753554	2753565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
186	NC_007650	ACGGCT	2	12	2753758	2753769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_007650	GACGAA	3	18	2759578	2759595	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
188	NC_007650	GCAATC	2	12	2812708	2812719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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190	NC_007650	GCGGCA	2	12	2834330	2834341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_007650	AAAGTC	2	12	2885666	2885677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.