MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus clausii KSM-K16

Total Repeats: 13836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_006582	TTC	2	6	4199259	4199264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_006582	ACT	2	6	4199272	4199277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_006582	TTAA	2	8	4199283	4199290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_006582	T	6	6	4199307	4199312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_006582	AAG	2	6	4199380	4199385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_006582	A	6	6	4201236	4201241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_006582	CAA	2	6	4201267	4201272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_006582	CCT	2	6	4201288	4201293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13509	NC_006582	TAAA	2	8	4201301	4201308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_006582	GAA	2	6	4201361	4201366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_006582	A	7	7	4201368	4201374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_006582	AAT	2	6	4201377	4201382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_006582	TTA	2	6	4201414	4201419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_006582	AACC	2	8	4201430	4201437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13515	NC_006582	CA	3	6	4201463	4201468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13516	NC_006582	CAC	2	6	4201630	4201635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13517	NC_006582	TCT	2	6	4201668	4201673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_006582	CTG	2	6	4204339	4204344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_006582	A	7	7	4204356	4204362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_006582	TCC	2	6	4204401	4204406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13521	NC_006582	GCC	2	6	4204427	4204432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_006582	T	6	6	4204482	4204487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_006582	TTA	2	6	4204555	4204560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_006582	CAA	2	6	4204575	4204580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_006582	TTG	2	6	4204583	4204588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_006582	GA	3	6	4204608	4204613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_006582	TCC	2	6	4204664	4204669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13528	NC_006582	TAA	2	6	4204718	4204723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_006582	AATA	2	8	4206362	4206369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_006582	GA	3	6	4206391	4206396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_006582	CTC	2	6	4211023	4211028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_006582	ACT	2	6	4211059	4211064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13533	NC_006582	A	6	6	4211067	4211072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_006582	GCT	2	6	4211080	4211085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_006582	CTT	2	6	4211086	4211091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_006582	AC	3	6	4211821	4211826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13537	NC_006582	GA	3	6	4211899	4211904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_006582	GA	4	8	4211940	4211947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_006582	AAC	2	6	4211967	4211972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_006582	CCT	3	9	4213988	4213996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13541	NC_006582	TCC	2	6	4215035	4215040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13542	NC_006582	ACA	2	6	4215080	4215085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_006582	TC	3	6	4215164	4215169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13544	NC_006582	AAT	2	6	4216095	4216100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_006582	TAATT	2	10	4216108	4216117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_006582	G	6	6	4216161	4216166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_006582	ACG	2	6	4217275	4217280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_006582	AGA	2	6	4217303	4217308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_006582	CTC	2	6	4220112	4220117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13550	NC_006582	TTG	2	6	4220125	4220130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_006582	AGCA	2	8	4220193	4220200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13552	NC_006582	CCT	2	6	4220916	4220921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13553	NC_006582	TCT	2	6	4220925	4220930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_006582	TAC	2	6	4220949	4220954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_006582	GTA	2	6	4220967	4220972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_006582	CAG	2	6	4220979	4220984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_006582	AGG	2	6	4221005	4221010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_006582	ACA	2	6	4222145	4222150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_006582	CAAA	2	8	4222160	4222167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13560	NC_006582	TGT	3	9	4222235	4222243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_006582	CTG	2	6	4222309	4222314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_006582	ATA	2	6	4222345	4222350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_006582	A	6	6	4222398	4222403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_006582	ATT	2	6	4224515	4224520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_006582	ATC	2	6	4224538	4224543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_006582	CT	3	6	4225115	4225120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13567	NC_006582	CA	3	6	4225134	4225139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13568	NC_006582	T	8	8	4225142	4225149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_006582	AGT	2	6	4225185	4225190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_006582	AGG	2	6	4225195	4225200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_006582	TTG	2	6	4227310	4227315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_006582	TG	3	6	4228018	4228023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_006582	ATA	2	6	4228094	4228099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_006582	ACC	2	6	4228102	4228107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13575	NC_006582	TGACC	2	10	4228187	4228196	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13576	NC_006582	TGGA	2	8	4228224	4228231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_006582	CAA	2	6	4228232	4228237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_006582	GCCC	2	8	4228766	4228773	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13579	NC_006582	TTA	2	6	4228776	4228781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_006582	TCC	2	6	4230261	4230266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13581	NC_006582	A	7	7	4230309	4230315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_006582	A	7	7	4230370	4230376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_006582	ACAGG	2	10	4232956	4232965	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13584	NC_006582	TA	3	6	4232990	4232995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_006582	CCG	2	6	4233035	4233040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13586	NC_006582	T	6	6	4233649	4233654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_006582	CAA	2	6	4233663	4233668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_006582	TG	3	6	4233710	4233715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_006582	CAA	2	6	4233768	4233773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_006582	TCC	2	6	4240611	4240616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13591	NC_006582	CCT	2	6	4241584	4241589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13592	NC_006582	CTC	2	6	4243370	4243375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13593	NC_006582	T	6	6	4243393	4243398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_006582	ACA	2	6	4243399	4243404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_006582	TTA	2	6	4243416	4243421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_006582	TAA	2	6	4243485	4243490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_006582	CTT	2	6	4243521	4243526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13598	NC_006582	ACGA	2	8	4243541	4243548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13599	NC_006582	AGG	2	6	4243653	4243658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_006582	GAG	2	6	4243801	4243806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_006582	ATT	2	6	4243831	4243836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_006582	GATT	2	8	4243838	4243845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_006582	TTC	2	6	4243893	4243898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_006582	CAG	2	6	4243902	4243907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_006582	A	6	6	4243910	4243915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_006582	T	6	6	4243941	4243946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_006582	GTC	2	6	4243969	4243974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_006582	ATT	2	6	4243978	4243983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_006582	C	6	6	4244048	4244053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13610	NC_006582	TA	4	8	4244074	4244081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_006582	AATC	2	8	4244099	4244106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13612	NC_006582	GGC	2	6	4244117	4244122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_006582	TA	3	6	4244964	4244969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_006582	A	6	6	4244982	4244987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_006582	TTG	2	6	4245028	4245033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_006582	GCA	2	6	4245074	4245079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_006582	CTA	2	6	4245117	4245122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_006582	A	6	6	4245126	4245131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_006582	TAA	2	6	4245136	4245141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_006582	GAAT	2	8	4245228	4245235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_006582	AG	3	6	4245306	4245311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_006582	CA	3	6	4245318	4245323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13623	NC_006582	T	6	6	4245391	4245396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_006582	AGT	2	6	4245455	4245460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_006582	TGT	2	6	4245461	4245466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_006582	TCA	2	6	4245507	4245512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13627	NC_006582	CA	3	6	4245517	4245522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13628	NC_006582	T	7	7	4245575	4245581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13629	NC_006582	AAAC	2	8	4245605	4245612	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.