MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteroides fragilis YCH46 DNA

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006347	TAAACC	2	12	719	730	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006347	ATTTTA	2	12	41987	41998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006347	AACGGT	2	12	84183	84194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006347	TTTTTG	2	12	112558	112569	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006347	ACGGCA	2	12	115666	115677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006347	CGTTTT	2	12	290001	290012	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006347	TAATAT	2	12	296343	296354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006347	CTTTTT	2	12	393355	393366	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006347	TAAAGA	2	12	414934	414945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006347	TAAGAA	2	12	433592	433603	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006347	AAGGTA	2	12	488799	488810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006347	AGGTAA	2	12	522810	522821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006347	GAAAAA	2	12	614015	614026	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006347	AAATGT	2	12	627132	627143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006347	TTCTAT	2	12	692537	692548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006347	AGAAAC	2	12	716339	716350	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006347	TTTATT	2	12	720297	720308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006347	TATAAA	2	12	781267	781278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006347	TTAGTA	2	12	811661	811672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006347	TTTATA	2	12	832293	832304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006347	AAGTAA	2	12	832395	832406	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006347	TTAATT	2	12	860629	860640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006347	ATGAAT	2	12	889867	889878	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006347	GTATCA	2	12	984612	984623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_006347	ATTGTA	2	12	1059654	1059665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006347	TAAATC	2	12	1062654	1062665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006347	TTTCTT	2	12	1088269	1088280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_006347	TTTTTA	2	12	1105961	1105972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006347	GATGAA	2	12	1112635	1112646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006347	AATTTA	2	12	1145530	1145541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006347	TATTTC	2	12	1153669	1153680	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006347	TAAAAG	2	12	1208202	1208213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006347	GAAACG	2	12	1313959	1313970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_006347	TGAGCG	2	12	1315628	1315639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006347	CTTTTT	2	12	1455882	1455893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006347	GCAAAA	2	12	1468333	1468344	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_006347	GATATT	2	12	1479951	1479962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006347	GATAGT	2	12	1484635	1484646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006347	AAAAGT	2	12	1522608	1522619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006347	TATTCT	2	12	1565905	1565916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006347	TTTTGT	2	12	1634092	1634103	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006347	TATGCT	2	12	1664560	1664571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_006347	TTCTAT	2	12	1723132	1723143	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006347	AAAATA	2	12	1775146	1775157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006347	TTCTTT	2	12	1775658	1775669	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_006347	TATTGG	2	12	1818421	1818432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006347	TTTTAT	2	12	1886136	1886147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006347	TCTTTT	2	12	1902789	1902800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006347	TTGTTT	2	12	1923789	1923800	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006347	GCTTTA	2	12	1959431	1959442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_006347	ATACAT	2	12	1960251	1960262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006347	AGAACA	2	12	1969742	1969753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006347	GTAATA	2	12	1969799	1969810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006347	CTATTA	2	12	2094567	2094578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006347	CTTTGT	2	12	2097591	2097602	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006347	CATTTA	2	12	2132281	2132292	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_006347	TATAAA	2	12	2153452	2153463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006347	TAGTTA	2	12	2184624	2184635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006347	AATTAT	2	12	2185186	2185197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006347	TTTGTT	2	12	2195392	2195403	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006347	AATGAA	2	12	2195488	2195499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006347	GCAAGG	2	12	2324662	2324673	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006347	AATACT	2	12	2383560	2383571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_006347	CTTTTT	2	12	2410416	2410427	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006347	GCATAA	2	12	2425311	2425322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_006347	TGAATA	2	12	2425507	2425518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006347	GTCTTT	2	12	2510103	2510114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006347	GTCTAC	2	12	2626872	2626883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006347	AAAACA	2	12	2629073	2629084	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_006347	ATTTTT	2	12	2640875	2640886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006347	CTAATA	2	12	2650637	2650648	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_006347	TGCGCA	2	12	2736153	2736164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006347	ACTTAT	2	12	2769247	2769258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006347	AATATT	2	12	2771356	2771367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006347	ATTTTT	2	12	2771390	2771401	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006347	ACGAAT	2	12	2771982	2771993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006347	TTGTTT	2	12	2780449	2780460	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006347	TTTGTA	2	12	2802606	2802617	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006347	TCAAAA	2	12	2810005	2810016	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_006347	AGAAAA	2	12	2835785	2835796	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006347	TCATAT	2	12	2845332	2845343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006347	GAATCC	2	12	2847506	2847517	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006347	TTTGTA	2	12	2867458	2867469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006347	TAAACC	2	12	2868218	2868229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006347	GGTATA	2	12	2895016	2895027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006347	AATGAA	2	12	2971238	2971249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006347	CACATA	2	12	2980223	2980234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006347	TGGCAC	2	12	3016446	3016457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006347	ATTCCT	2	12	3026166	3026177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006347	ACAGGA	2	12	3029210	3029221	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_006347	ACAATT	2	12	3037313	3037324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_006347	CAAATA	2	12	3050535	3050546	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_006347	ATAAAA	2	12	3056652	3056663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006347	AGTGAG	2	12	3076337	3076348	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006347	AAATAA	2	12	3087905	3087916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006347	ATAAAA	2	12	3120900	3120911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006347	TCGCTT	2	12	3143098	3143109	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006347	GAGGAA	2	12	3146398	3146409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006347	GCTTCT	2	12	3146887	3146898	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006347	TAAAGG	2	12	3147388	3147399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006347	TAAAAG	2	12	3147410	3147421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006347	AGAATA	2	12	3147730	3147741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006347	TAAAAA	2	12	3151423	3151434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006347	TAAGAA	2	12	3161428	3161439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006347	GCGGGC	2	12	3204724	3204735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006347	GACTGG	2	12	3235175	3235186	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006347	ATTATG	2	12	3277628	3277639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006347	TTTTTC	2	12	3288288	3288299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006347	TAGACA	2	12	3298743	3298754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_006347	TCGTTT	2	12	3320473	3320484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_006347	CAAAGC	2	12	3324399	3324410	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006347	TTTTAA	2	12	3358942	3358953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006347	ATAAAG	2	12	3441955	3441966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006347	TACCTT	2	12	3453827	3453838	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006347	TGTGTT	2	12	3457035	3457046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006347	TTTTAT	2	12	3469013	3469024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006347	TATATT	2	12	3480276	3480287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006347	TTATTT	2	12	3496497	3496508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006347	AAATAA	2	12	3530189	3530200	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006347	CAACAC	2	12	3586724	3586735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_006347	ATAAAA	2	12	3626310	3626321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006347	TAAAAT	2	12	3640879	3640890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006347	AGATAC	2	12	3664883	3664894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_006347	TTAAAA	2	12	3716922	3716933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006347	ATTATA	2	12	3822480	3822491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006347	TACAAA	2	12	3831734	3831745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_006347	ATACTA	2	12	3855457	3855468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.