MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC 14580 chromosome

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006322	CTTGAA	2	12	49785	49796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006322	ATCAGC	2	12	69257	69268	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006322	TTGATA	2	12	86313	86324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006322	ACATTC	2	12	96820	96831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006322	TAAAGT	2	12	100178	100189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006322	AGTCAA	2	12	100197	100208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006322	GTTTTT	2	12	116263	116274	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006322	ACATTC	2	12	159776	159787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006322	TTTTAT	2	12	163313	163324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006322	TTATAG	2	12	183153	183164	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006322	TTTTAT	2	12	210449	210460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006322	CTTTTT	2	12	227708	227719	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_006322	GCTGGG	2	12	266357	266368	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_006322	AAACGG	2	12	281942	281953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006322	AGAGAA	2	12	338240	338251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006322	AGAAAA	2	12	355514	355525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006322	AAATTT	2	12	365978	365989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006322	TTAATT	2	12	465815	465826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006322	TGATAA	2	12	465989	466000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006322	ATGATA	2	12	585443	585454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006322	ACATTC	2	12	613471	613482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006322	CGAGTG	2	12	626347	626358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_006322	TTTTTG	2	12	642951	642962	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006322	ATATTA	2	12	655055	655066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006322	CAAGAT	2	12	671076	671087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_006322	TTAAAT	2	12	678817	678828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006322	TTTTGA	2	12	705409	705420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006322	AAACGA	2	12	791424	791435	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_006322	TTTTTC	2	12	842213	842224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_006322	ACATTC	2	12	922452	922463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006322	AAAGAA	2	12	930047	930058	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006322	GTGCTG	2	12	942231	942242	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_006322	CGAAAA	2	12	954323	954334	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_006322	ATCGCC	2	12	967079	967090	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006322	GAAAAA	2	12	976277	976288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006322	AGAAAG	2	12	1015941	1015952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006322	GTTATA	2	12	1030060	1030071	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006322	GGCAAG	2	12	1097511	1097522	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_006322	TAGTAT	2	12	1098572	1098583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006322	AATTTA	2	12	1110234	1110245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006322	TCATTG	2	12	1111460	1111471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006322	TTTTGT	2	12	1124471	1124482	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006322	ACTATT	2	12	1141231	1141242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006322	AGAAAA	2	12	1208426	1208437	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006322	CTTTGC	2	12	1252099	1252110	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006322	ATGATT	2	12	1440283	1440294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006322	GAAACC	2	12	1440435	1440446	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006322	AAGAGA	2	12	1471609	1471620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006322	TTTAAA	2	12	1476681	1476692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006322	TAATTA	2	12	1540029	1540040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006322	ATGAAA	2	12	1544965	1544976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006322	ACGATA	2	12	1558347	1558358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006322	TTCAAA	2	12	1586530	1586541	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_006322	ATCATT	2	12	1588593	1588604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006322	TTTTTC	2	12	1588876	1588887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006322	ATATTG	2	12	1590408	1590419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006322	ATCATT	2	12	1592014	1592025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006322	AATTTA	2	12	1596378	1596389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006322	GGTGCT	2	12	1604889	1604900	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_006322	TTATAT	2	12	1612588	1612599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006322	CATATA	2	12	1625624	1625635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_006322	ATCCGC	2	12	1627419	1627430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006322	AGGCGC	2	12	1678893	1678904	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006322	AGAAAC	2	12	1722137	1722148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006322	TTTAAT	2	12	1771412	1771423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006322	TATTTT	2	12	1785557	1785568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006322	GTCTTC	2	12	1854399	1854410	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006322	TCTTTT	2	12	1887402	1887413	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_006322	GATTTT	2	12	1892799	1892810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006322	TGAAAA	2	12	1920191	1920202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006322	GTTAAA	2	12	1959263	1959274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006322	TGATCT	2	12	1985855	1985866	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_006322	TGAAAA	2	12	1989232	1989243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006322	TTGAGA	2	12	2031567	2031578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006322	CTCCTT	2	12	2031705	2031716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006322	TTCAAA	2	12	2054292	2054303	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006322	AGTATA	2	12	2057409	2057420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006322	TCATGA	2	12	2061929	2061940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_006322	ATGATT	2	12	2071718	2071729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006322	AAGGGT	2	12	2110616	2110627	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006322	TCAAAA	2	12	2136272	2136283	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006322	CGTTTT	2	12	2196117	2196128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_006322	TTAATA	2	12	2196923	2196934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006322	TTTATG	2	12	2204270	2204281	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006322	TTCTGC	2	12	2204512	2204523	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006322	TTTCTC	2	12	2225956	2225967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006322	TGCATA	2	12	2239635	2239646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_006322	CCCGCT	2	12	2257636	2257647	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_006322	TGCATC	2	12	2325321	2325332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006322	TCAGCT	2	12	2333807	2333818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006322	AAAAGG	2	12	2367780	2367791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006322	TTGAAA	2	12	2371022	2371033	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006322	ATGTAT	2	12	2376728	2376739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006322	CCGATG	2	12	2441434	2441445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006322	TTTTTA	2	12	2482857	2482868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006322	CTCTCC	2	12	2495231	2495242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_006322	TGCGGT	2	12	2495584	2495595	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_006322	GGCGTC	2	12	2495784	2495795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006322	AACATA	2	12	2509191	2509202	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_006322	ATTTTT	2	12	2543010	2543021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006322	TCAACA	2	12	2547140	2547151	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006322	CTTTGT	2	12	2559648	2559659	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_006322	AAAATG	2	12	2559756	2559767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006322	ATTTTT	2	12	2574352	2574363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006322	TTTTAC	2	12	2598254	2598265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006322	TGCCCC	2	12	2606961	2606972	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_006322	AATTCT	2	12	2606983	2606994	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006322	TGACTT	2	12	2634100	2634111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006322	GAAAAA	2	12	2640947	2640958	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006322	ACAGAC	2	12	2662496	2662507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006322	CAATTC	2	12	2665179	2665190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006322	ATTATC	2	12	2694936	2694947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_006322	AAAATG	2	12	2695130	2695141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006322	TAAAAA	2	12	2709894	2709905	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006322	TTTATT	2	12	2710939	2710950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006322	CATAAT	2	12	2711741	2711752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_006322	CTAAGC	2	12	2727126	2727137	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006322	ATTATC	2	12	2730246	2730257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_006322	TCATTT	2	12	2773849	2773860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006322	TTATCT	2	12	2793407	2793418	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_006322	CTTTTT	2	12	2823705	2823716	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_006322	TAAAAC	2	12	2854629	2854640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_006322	TTGAGT	2	12	2858279	2858290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006322	AGCAGG	2	12	3053476	3053487	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_006322	CCGTAA	2	12	3060774	3060785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006322	TTTTGA	2	12	3137244	3137255	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006322	AAAAGG	2	12	3163307	3163318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006322	ATTGTA	2	12	3171908	3171919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006322	AAATAG	2	12	3209013	3209024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006322	TCTTTA	2	12	3255500	3255511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_006322	ATAATT	2	12	3321292	3321303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006322	GTTAAC	2	12	3358332	3358343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_006322	TGAATT	2	12	3411574	3411585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006322	CTTTTT	2	12	3428638	3428649	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_006322	TTTTTC	2	12	3456080	3456091	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_006322	AAGGGG	2	12	3523047	3523058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006322	ACTCCA	2	12	3540272	3540283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_006322	AATCAA	2	12	3562513	3562524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_006322	TTTCAT	2	12	3576821	3576832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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148	NC_006322	TGTAAT	2	12	3633401	3633412	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006322	ACGTGA	2	12	3656874	3656885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_006322	TGATAA	2	12	3729956	3729967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_006322	TGACAT	2	12	3917230	3917241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.