MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella quintana str. Toulouse

Total Repeats: 508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005955	GGGGA	2	10	3676	3685	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005955	TGGTT	2	10	9027	9036	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005955	AAAAT	2	10	9509	9518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005955	ATCAT	2	10	11495	11504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_005955	TAAAA	2	10	12968	12977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005955	AAAGT	2	10	16025	16034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005955	AAAAC	2	10	20089	20098	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_005955	GCAAA	2	10	20475	20484	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005955	GGTGC	2	10	21076	21085	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_005955	TAAAA	2	10	33628	33637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005955	CCTTT	2	10	39625	39634	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_005955	TAGCA	2	10	39678	39687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_005955	TGTGT	2	10	43961	43970	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005955	TAAAA	2	10	44233	44242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005955	GAACA	2	10	44647	44656	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_005955	ATTAA	2	10	45304	45313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005955	ATTTA	2	10	51844	51853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005955	AAATC	2	10	52201	52210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005955	AAGAA	2	10	55519	55528	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005955	TGATT	2	10	64892	64901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005955	TGATG	2	10	68005	68014	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005955	GGAAT	2	10	71378	71387	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005955	TTTGC	2	10	74636	74645	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_005955	TAAAA	2	10	78783	78792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005955	CGATC	2	10	79198	79207	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_005955	AAAAG	2	10	79396	79405	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005955	GGGTT	2	10	83656	83665	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005955	CTCAT	2	10	83749	83758	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_005955	ATTTT	2	10	86937	86946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005955	TGGCA	2	10	95669	95678	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_005955	ATTAA	2	10	121275	121284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005955	GCATG	2	10	121963	121972	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_005955	AAAAG	2	10	124117	124126	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005955	TAATA	2	10	125084	125093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005955	CTTAA	2	10	125147	125156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_005955	GTTTT	2	10	133433	133442	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005955	CAATA	2	10	137283	137292	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_005955	TCAGA	2	10	145891	145900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_005955	TTTAG	2	10	145932	145941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005955	ATCAT	2	10	146028	146037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_005955	AATAA	2	10	160238	160247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005955	AAATT	2	10	160248	160257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005955	ATAAA	2	10	161448	161457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005955	ATTCT	2	10	161968	161977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_005955	GAAAG	2	10	172056	172065	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005955	TGATG	2	10	172213	172222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005955	AAAAT	2	10	172644	172653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005955	ATTGA	2	10	176762	176771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005955	TCTAT	2	10	177767	177776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_005955	TATAT	2	10	178256	178265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005955	CAATT	2	10	179062	179071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_005955	TAAAG	2	10	183319	183328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005955	TAAAG	2	10	186529	186538	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005955	CGTTG	2	10	190150	190159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_005955	AATAA	2	10	191336	191345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005955	TACTT	2	10	191721	191730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_005955	TACAA	2	10	191848	191857	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_005955	TTTTA	2	10	198729	198738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005955	GAGGG	2	10	198799	198808	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005955	TTTTG	2	10	203174	203183	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005955	CAATA	2	10	204609	204618	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_005955	ATTTT	2	10	210000	210009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005955	TGTAT	2	10	210097	210106	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005955	TGTTT	2	10	222506	222515	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005955	AGAGG	2	10	222913	222922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005955	AAGCA	2	10	225909	225918	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_005955	TATAA	2	10	226812	226821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005955	AATTC	2	10	240610	240619	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_005955	TCTAT	2	10	246570	246579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_005955	CATTT	2	10	255269	255278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_005955	TTTGG	2	10	277374	277383	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005955	AGAAA	2	10	283632	283641	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005955	AAAGG	2	10	283798	283807	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005955	GCAAT	2	10	286847	286856	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_005955	GGTTG	2	10	287525	287534	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005955	GCAAG	2	10	288901	288910	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_005955	GTTGT	2	10	304136	304145	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005955	ATTTA	2	10	316013	316022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005955	TTCGT	2	10	316373	316382	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_005955	AAGAA	2	10	317738	317747	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005955	GGAGT	2	10	317831	317840	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005955	TTGAT	2	10	318162	318171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005955	AGGGA	2	10	321386	321395	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005955	AAGGC	2	10	326531	326540	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_005955	TTTTA	2	10	330516	330525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005955	TTTTG	2	10	330979	330988	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005955	TAAAT	2	10	332730	332739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005955	TCAAG	2	10	335030	335039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_005955	GAAAG	2	10	335327	335336	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005955	TAGGA	2	10	336614	336623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005955	TATGA	2	10	336740	336749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005955	AGATA	2	10	336811	336820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005955	TATTT	2	10	341938	341947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005955	TGGAA	2	10	344300	344309	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005955	TGAAA	2	10	349625	349634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005955	TTACC	2	10	350714	350723	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_005955	AAAAT	2	10	366921	366930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005955	TTACT	2	10	374031	374040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_005955	TGAGC	2	10	376009	376018	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_005955	GGATA	2	10	381122	381131	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005955	ACAAA	2	10	381149	381158	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_005955	ATATT	2	10	387151	387160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005955	GTTTT	2	10	399615	399624	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005955	ATTAT	2	10	403040	403049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005955	TTATT	2	10	403801	403810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005955	GTAAA	2	10	403977	403986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005955	TTTGT	2	10	407322	407331	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005955	TAAAA	2	10	408299	408308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005955	CTTAA	2	10	408507	408516	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_005955	GTATG	2	10	412388	412397	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005955	TGTTT	2	10	412480	412489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005955	TTATT	2	10	412566	412575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005955	ATTTT	2	10	412940	412949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005955	AATAT	2	10	412967	412976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005955	ATTTT	2	10	421862	421871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005955	AGTTT	2	10	422238	422247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005955	ATTTT	2	10	427013	427022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005955	TTGAG	2	10	429710	429719	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005955	CACTT	2	10	429734	429743	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_005955	TTTAT	2	10	430706	430715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005955	TCTAT	2	10	430835	430844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_005955	TTTAC	2	10	438423	438432	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_005955	ATTTT	2	10	439851	439860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005955	TATTT	2	10	442007	442016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005955	GTTTG	2	10	446750	446759	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005955	AAAGT	2	10	447028	447037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005955	AATTA	2	10	447090	447099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005955	ATAAA	2	10	447486	447495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005955	ATTTT	2	10	451316	451325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005955	TGAAT	2	10	451406	451415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005955	CATTG	2	10	453328	453337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_005955	TTTAT	2	10	454445	454454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005955	AAGCG	2	10	455167	455176	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_005955	TAAAT	2	10	456299	456308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005955	TTTTA	2	10	456831	456840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005955	ATAAA	2	10	458134	458143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005955	AATCA	2	10	462189	462198	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_005955	ATTTT	2	10	466905	466914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005955	TATTC	2	10	467379	467388	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_005955	TTTAA	2	10	469231	469240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005955	TCAAT	2	10	469321	469330	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_005955	TATTT	2	10	469570	469579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005955	ATGAT	2	10	470053	470062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005955	TCTTT	2	10	472215	472224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_005955	ATATA	2	10	472264	472273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005955	TAAAT	2	10	473163	473172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005955	AATTT	2	10	473547	473556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005955	AGTTG	2	10	474090	474099	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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