MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 plasmid p5482

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004703	TAC	2	6	1005	1010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004703	CTA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004703	TAG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004703	TAC	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004703	TTC	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004703	A	7	7	1541	1547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004703	TC	3	6	1548	1553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_004703	AAT	2	6	1555	1560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004703	T	7	7	1578	1584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004703	AGT	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004703	AACGT	2	10	1640	1649	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004703	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_004703	TAT	2	6	2585	2590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004703	GACG	2	8	2696	2703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004703	ACC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_004703	CA	3	6	2720	2725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004703	T	10	10	3792	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004703	A	6	6	3840	3845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004703	TATT	2	8	3884	3891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004703	A	6	6	4007	4012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004703	AAG	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004703	A	6	6	4135	4140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004703	CG	3	6	4172	4177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004703	TTTTGT	2	12	4193	4204	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004703	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_004703	T	6	6	4258	4263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004703	G	6	6	4264	4269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004703	CGA	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004703	GA	5	10	4365	4374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004703	ACG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_004703	AGCA	2	8	4394	4401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004703	AT	3	6	4442	4447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004703	TATG	2	8	4465	4472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004703	CATA	2	8	4480	4487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_004703	ATT	2	6	4496	4501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004703	T	6	6	8910	8915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004703	A	6	6	8925	8930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004703	TATT	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004703	AGT	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004703	TAT	2	6	8983	8988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004703	GTT	2	6	9065	9070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004703	ATTT	2	8	9091	9098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004703	GGC	2	6	16400	16405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004703	CGC	2	6	16427	16432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_004703	A	6	6	16640	16645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004703	AAT	2	6	18122	18127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004703	TTCTTT	2	12	18631	18642	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004703	TGG	2	6	18773	18778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004703	CAG	2	6	18826	18831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004703	CTTT	2	8	18863	18870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004703	GATA	2	8	18873	18880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004703	AAG	2	6	18890	18895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004703	C	6	6	18896	18901	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_004703	CCG	2	6	18912	18917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_004703	TTC	2	6	18982	18987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004703	AATA	2	8	18988	18995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004703	T	6	6	19002	19007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004703	TA	3	6	19028	19033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004703	TTTG	2	8	19045	19052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004703	TGTT	2	8	19059	19066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004703	TAT	2	6	19124	19129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004703	TTGCT	2	10	19479	19488	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_004703	T	6	6	19953	19958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004703	TTG	2	6	19985	19990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004703	TTA	2	6	20002	20007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004703	A	6	6	20117	20122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004703	AGT	2	6	20139	20144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004703	TA	3	6	20220	20225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004703	CCG	2	6	20256	20261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_004703	TA	3	6	20881	20886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004703	TAT	2	6	20890	20895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004703	TAA	2	6	20934	20939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004703	TTCAT	2	10	20968	20977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_004703	A	7	7	21392	21398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004703	AC	3	6	21446	21451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004703	C	6	6	21464	21469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_004703	A	8	8	22033	22040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004703	A	6	6	22044	22049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004703	T	8	8	22064	22071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004703	AC	16	32	22076	22107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_004703	GT	4	8	22110	22117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004703	CTTT	2	8	22154	22161	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_004703	T	6	6	22159	22164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004703	AT	3	6	22217	22222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004703	TC	3	6	22249	22254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004703	AGA	2	6	22281	22286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004703	GCC	2	6	22290	22295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_004703	ATTA	2	8	24331	24338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004703	TATT	2	8	24339	24346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004703	TTA	2	6	25496	25501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004703	T	6	6	25555	25560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004703	T	6	6	26704	26709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004703	AGT	2	6	26766	26771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004703	T	6	6	26780	26785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004703	T	6	6	26791	26796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004703	AAAT	2	8	26820	26827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004703	GTAT	2	8	26918	26925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004703	AT	3	6	26924	26929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004703	TA	3	6	26931	26936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004703	TG	3	6	26955	26960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004703	TAAA	2	8	26964	26971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004703	A	6	6	26969	26974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004703	CAA	2	6	28825	28830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_004703	AAT	2	6	28874	28879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004703	TAAA	2	8	28887	28894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004703	TAA	2	6	30420	30425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004703	TA	3	6	30840	30845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004703	AAAAC	2	10	30846	30855	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004703	ACA	2	6	30880	30885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004703	TAC	2	6	30892	30897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_004703	GATT	2	8	30949	30956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004703	GTA	2	6	30988	30993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004703	TAC	2	6	30996	31001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_004703	A	6	6	31407	31412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004703	GTA	2	6	31435	31440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004703	A	6	6	31449	31454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004703	A	7	7	31467	31473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004703	T	6	6	31606	31611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004703	G	7	7	31612	31618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004703	A	6	6	31650	31655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004703	GTA	2	6	31660	31665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004703	TA	3	6	31680	31685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004703	TAC	2	6	31692	31697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004703	TAGT	2	8	31722	31729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004703	TGT	2	6	31734	31739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004703	AAC	2	6	31797	31802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004703	CACC	2	8	31817	31824	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_004703	A	6	6	32941	32946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004703	T	6	6	32994	32999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004703	GATA	2	8	33005	33012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004703	TA	3	6	33011	33016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004703	AAT	2	6	33028	33033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.