MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) chromosome

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004545	AATTT	2	10	3877	3886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004545	AATTT	2	10	11886	11895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004545	TATTT	2	10	19709	19718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004545	ACATT	2	10	27541	27550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_004545	TTGTT	2	10	31119	31128	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004545	TATAT	2	10	34590	34599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004545	ATTAT	2	10	34631	34640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004545	TTTTA	2	10	34785	34794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004545	AGTTT	2	10	34847	34856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004545	AAATT	2	10	34922	34931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004545	ATTTT	2	10	34944	34953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004545	TTATT	2	10	38120	38129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004545	TTTTA	2	10	47795	47804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004545	TAATA	2	10	50579	50588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004545	TTTAT	2	10	51248	51257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004545	AATTT	2	10	56553	56562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004545	ATTTA	2	10	56640	56649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004545	TATAG	2	10	57320	57329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004545	TTTTA	2	10	58212	58221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004545	ATATT	2	10	60227	60236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004545	ATTTA	2	10	63690	63699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004545	TTTTA	2	10	70903	70912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004545	GCATG	2	10	75016	75025	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_004545	ATTTT	2	10	75078	75087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004545	AATAT	2	10	75610	75619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004545	ATTTT	2	10	83503	83512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004545	TAAAT	2	10	85751	85760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004545	ATATT	2	10	85898	85907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004545	TAAAA	2	10	86696	86705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004545	TTTTC	2	10	89012	89021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004545	TGTAT	2	10	89481	89490	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004545	TAATA	2	10	93379	93388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004545	GTTTT	2	10	98524	98533	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004545	TGTTT	2	10	101269	101278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004545	ATATA	2	10	101461	101470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004545	TTAGC	2	10	102805	102814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_004545	TTATT	2	10	112883	112892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004545	TTGTT	2	10	118390	118399	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004545	TTTTA	2	10	119224	119233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004545	ATATT	2	10	125306	125315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004545	TTTAA	2	10	125399	125408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004545	TAAAA	2	10	127370	127379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004545	ATTTT	2	10	127450	127459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004545	TATTT	2	10	127636	127645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004545	TAATA	2	10	127753	127762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004545	AAAGT	2	10	130550	130559	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004545	ATATT	2	10	138061	138070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004545	TAATT	2	10	141371	141380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004545	TAATT	2	10	142795	142804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004545	TTTAT	2	10	143774	143783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004545	AAATT	2	10	144216	144225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004545	TGAAT	2	10	152015	152024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004545	TATAT	2	10	156603	156612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004545	TAAAA	2	10	160630	160639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004545	TTGTT	2	10	165648	165657	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004545	ATTTT	2	10	172753	172762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004545	ATATA	2	10	176960	176969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004545	TATAT	2	10	179992	180001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004545	AGATA	2	10	180733	180742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004545	ATTTT	2	10	180883	180892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004545	TAAGT	2	10	181547	181556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004545	ATATT	2	10	184811	184820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004545	ATTTT	2	10	184821	184830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004545	TGTTT	2	10	184881	184890	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004545	CATTA	2	10	195554	195563	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004545	AAAAT	2	10	195570	195579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004545	TTTTG	2	10	200205	200214	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004545	TAAAA	2	10	200408	200417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004545	AATTT	2	10	201539	201548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004545	TTTAA	2	10	204169	204178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004545	TAATT	2	10	209368	209377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004545	TTCTT	2	10	210156	210165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004545	TTTAT	2	10	210422	210431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004545	TAAAA	2	10	210470	210479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004545	ATTAT	2	10	211429	211438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004545	TAAAA	2	10	216983	216992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004545	TATTT	2	10	225880	225889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004545	ATATA	2	10	225934	225943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004545	TTTAA	2	10	245779	245788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004545	TTAAT	2	10	245834	245843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004545	TTAAA	2	10	252940	252949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004545	TTTAT	2	10	253521	253530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004545	TGTAT	2	10	254743	254752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004545	ACTGA	2	10	254883	254892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004545	ATTAA	2	10	255009	255018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004545	ATTAA	2	10	255061	255070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004545	TTGAA	2	10	255688	255697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004545	TTTAA	2	10	255750	255759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004545	TTGAT	2	10	255865	255874	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004545	AATTT	2	10	261038	261047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004545	ATTTA	2	10	261178	261187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004545	TTTAA	2	10	261366	261375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004545	TTAAT	2	10	266737	266746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004545	GGTAA	2	10	267187	267196	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004545	AAAAT	2	10	268486	268495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004545	TATTT	2	10	278964	278973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004545	TTTAA	2	10	287057	287066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004545	TATAA	2	10	287906	287915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004545	AAATA	2	10	289857	289866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004545	TTGTT	2	10	291034	291043	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004545	TTAAA	2	10	291082	291091	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004545	ATATT	2	10	292743	292752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004545	TATTT	2	10	299831	299840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004545	ATTCG	2	10	300052	300061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_004545	TTCTA	2	10	300200	300209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_004545	CAAAG	2	10	300315	300324	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004545	TAAAA	2	10	302915	302924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004545	AAGTG	2	10	306932	306941	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004545	ATATT	2	10	318598	318607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004545	TTTAT	2	10	318643	318652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004545	TGGTA	2	10	319891	319900	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004545	TAAAA	2	10	319940	319949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004545	TTTAA	2	10	322148	322157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004545	CAATA	2	10	330037	330046	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004545	TTTTA	2	10	330081	330090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004545	AAATA	2	10	330925	330934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004545	TTTTA	2	10	332556	332565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004545	CATTA	2	10	333817	333826	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_004545	TAAAA	2	10	335799	335808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004545	TAAAA	2	10	336526	336535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004545	CTAAA	2	10	336566	336575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_004545	ATTAT	2	10	340556	340565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004545	TTTAT	2	10	340566	340575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004545	AAATG	2	10	340973	340982	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004545	TAAAT	2	10	341024	341033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004545	TTATA	2	10	349044	349053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004545	AATAG	2	10	349145	349154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004545	TAAAT	2	10	350890	350899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004545	ATTTT	2	10	350906	350915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004545	TTTTA	2	10	350941	350950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004545	AAATT	2	10	352028	352037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004545	ATTTA	2	10	352231	352240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004545	TAAAA	2	10	358454	358463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004545	ATTAG	2	10	360610	360619	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004545	TTAAT	2	10	360684	360693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004545	AAAAC	2	10	360777	360786	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004545	ATTTA	2	10	361324	361333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004545	TATAT	2	10	361496	361505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004545	CAAAT	2	10	361763	361772	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004545	AAAAT	2	10	363170	363179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004545	TATAA	2	10	368146	368155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004545	AAATA	2	10	371591	371600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004545	TTATA	2	10	376533	376542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004545	TATAT	2	10	378150	378159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004545	ATTAA	2	10	378172	378181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004545	ACAAA	2	10	378919	378928	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004545	TAAAA	2	10	379318	379327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004545	ATACT	2	10	381143	381152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_004545	TAAAA	2	10	381172	381181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004545	TTTAC	2	10	381195	381204	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_004545	TAAAA	2	10	385871	385880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004545	CATAA	2	10	392671	392680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_004545	TATAT	2	10	395324	395333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_004545	TAATT	2	10	395388	395397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004545	ATTAT	2	10	396740	396749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_004545	ACTAT	2	10	401593	401602	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_004545	ATATT	2	10	411979	411988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_004545	TAAAA	2	10	418560	418569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_004545	TAAAA	2	10	436650	436659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_004545	TATAA	2	10	451580	451589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_004545	TAAAA	2	10	454244	454253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_004545	CATAT	2	10	455778	455787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_004545	TAAAA	2	10	455836	455845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_004545	ATTTA	2	10	456079	456088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_004545	ATTAA	2	10	456313	456322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_004545	ATATA	2	10	481061	481070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_004545	TATAT	2	10	488235	488244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.