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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004463	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004463	TGCA	2	8	1067	1074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004463	GGCA	2	8	1222	1229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004463	GCCT	2	8	1384	1391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004463	CGAA	2	8	1448	1455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004463	CTCC	2	8	1639	1646	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_004463	CTCC	2	8	1931	1938	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_004463	CGTT	2	8	2056	2063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004463	CGTC	2	8	2548	2555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004463	CGAC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004463	GCTG	2	8	2975	2982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_004463	TGGC	2	8	3918	3925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004463	CTCA	2	8	8357	8364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_004463	CAAT	2	8	8934	8941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004463	CAGC	2	8	10030	10037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004463	TAGG	2	8	10778	10785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004463	CAAC	2	8	12873	12880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004463	AGTC	2	8	12929	12936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004463	TCGA	2	8	13217	13224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_004463	CAGC	2	8	14432	14439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004463	CACC	2	8	14487	14494	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_004463	GATT	2	8	17002	17009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004463	GGTC	2	8	18406	18413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_004463	CAAT	2	8	18488	18495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004463	TTCT	2	8	20614	20621	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004463	GAAG	2	8	21301	21308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004463	AGGC	2	8	23252	23259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_004463	ACGA	2	8	23378	23385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_004463	TCAA	2	8	23389	23396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004463	CGTC	2	8	24087	24094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004463	CTAG	2	8	24510	24517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004463	TCCG	2	8	26517	26524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004463	GCCG	2	8	31997	32004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004463	ATTA	2	8	32193	32200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004463	GCCG	2	8	34932	34939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004463	GAGT	2	8	34981	34988	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004463	GGCG	2	8	35027	35034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_004463	GGCC	2	8	35601	35608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004463	ACGG	2	8	36178	36185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004463	GCAT	2	8	36707	36714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_004463	TCGT	2	8	36788	36795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004463	TCGG	2	8	41230	41237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004463	AACT	2	8	46305	46312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004463	GTCT	2	8	47137	47144	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004463	CCCG	2	8	48636	48643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_004463	CGGG	2	8	48651	48658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004463	ATCC	2	8	49221	49228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004463	GACG	2	8	49353	49360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004463	CCCG	2	8	50386	50393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_004463	CGGC	2	8	50459	50466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_004463	GCAG	2	8	50712	50719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004463	GCCC	2	8	51507	51514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_004463	ACCG	2	8	54212	54219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004463	CGAC	2	8	59307	59314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_004463	CTCG	2	8	59615	59622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_004463	TCCG	2	8	60158	60165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_004463	CGGT	2	8	60217	60224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004463	TCTG	2	8	70878	70885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004463	GGCC	2	8	72013	72020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004463	ACGG	2	8	72087	72094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004463	CAAT	2	8	72138	72145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004463	TCAA	2	8	72197	72204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_004463	GGGC	2	8	72385	72392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_004463	TTGA	2	8	72426	72433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004463	TGCC	2	8	74909	74916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_004463	ATCG	2	8	93664	93671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004463	GATA	2	8	98398	98405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004463	CAAA	2	8	100924	100931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004463	GAAT	2	8	103114	103121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004463	AGTA	2	8	103565	103572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004463	ACTC	2	8	106532	106539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_004463	CCCT	2	8	107682	107689	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_004463	CCGT	2	8	107811	107818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_004463	TCAA	2	8	107852	107859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004463	TCCA	2	8	109108	109115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004463	CTTG	2	8	113291	113298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004463	AAGG	2	8	122204	122211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004463	GAGG	2	8	122982	122989	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004463	CCCT	2	8	124308	124315	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_004463	TTCC	2	8	132231	132238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_004463	AGCG	2	8	152304	152311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004463	CAAA	2	8	152441	152448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_004463	CGAA	2	8	153602	153609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004463	CTTT	2	8	162336	162343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004463	GGAT	2	8	163778	163785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004463	CTGC	2	8	164670	164677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_004463	CGTT	2	8	165156	165163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_004463	CCGG	2	8	165250	165257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_004463	GCCT	2	8	165871	165878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004463	GCGA	2	8	165883	165890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_004463	GCTC	2	8	166061	166068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_004463	CTCG	2	8	168656	168663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_004463	GCCC	2	8	170589	170596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_004463	CGGG	2	8	175982	175989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_004463	CTTA	2	8	176032	176039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004463	CTCC	2	8	176778	176785	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_004463	TGCC	2	8	183951	183958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_004463	TCCG	2	8	193034	193041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004463	TGGA	2	8	194609	194616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004463	CGCT	2	8	194620	194627	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_004463	GACG	2	8	194719	194726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_004463	GCCT	2	8	201798	201805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_004463	TGGG	2	8	201866	201873	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004463	GTGG	2	8	209506	209513	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004463	GGCA	2	8	217309	217316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_004463	AATG	2	8	217318	217325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004463	AATG	2	8	217337	217344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004463	ATCT	2	8	220469	220476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_004463	TTCC	2	8	222309	222316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004463	CACT	2	8	222494	222501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004463	GAAA	2	8	235590	235597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004463	CTGG	2	8	250174	250181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004463	TTGC	2	8	251691	251698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_004463	GTCA	2	8	251727	251734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_004463	CGGC	2	8	253255	253262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_004463	CCGG	2	8	260000	260007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_004463	CCTC	2	8	261340	261347	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_004463	TCCT	2	8	269416	269423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_004463	TCGA	2	8	271555	271562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_004463	CCGG	2	8	280690	280697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004463	ACGG	2	8	288131	288138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_004463	CGAA	2	8	288158	288165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_004463	AGCG	2	8	288206	288213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_004463	ATGG	2	8	290420	290427	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004463	GCGG	2	8	297428	297435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_004463	CGAT	2	8	297569	297576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004463	AGCA	2	8	301091	301098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_004463	GCCG	2	8	301264	301271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004463	GGGC	2	8	303767	303774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_004463	CGGT	2	8	307167	307174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004463	GATC	2	8	312950	312957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004463	ACGC	2	8	315401	315408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_004463	ACCT	2	8	316010	316017	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_004463	GCTC	2	8	316702	316709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_004463	TGTA	2	8	317948	317955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004463	CAAA	2	8	317961	317968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004463	AGGC	2	8	318019	318026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004463	ACGA	2	8	323484	323491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_004463	CTTC	2	8	334152	334159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_004463	GCAT	2	8	335830	335837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_004463	CCGT	2	8	338356	338363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004463	AGCG	2	8	338794	338801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_004463	GAGC	2	8	338802	338809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004463	GGCT	2	8	338858	338865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_004463	CGAG	2	8	341192	341199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_004463	CGGA	2	8	347960	347967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_004463	CATG	2	8	356400	356407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_004463	GCCG	3	12	365769	365780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_004463	GGCG	2	8	365847	365854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_004463	GGCG	2	8	367735	367742	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_004463	GGCC	2	8	367809	367816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_004463	CGAC	2	8	371395	371402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_004463	CGTC	2	8	377334	377341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_004463	GCCG	2	8	379561	379568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_004463	CGCT	2	8	382140	382147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_004463	CGCC	2	8	382217	382224	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
158	NC_004463	CCCG	2	8	385917	385924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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483	NC_004463	CCGC	2	8	1374258	1374265	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
484	NC_004463	AGTT	2	8	1376199	1376206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_004463	GCAG	2	8	1381495	1381502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_004463	ATGA	2	8	1381549	1381556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_004463	CGTT	2	8	1381624	1381631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_004463	CGGC	2	8	1387770	1387777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
491	NC_004463	ATGC	2	8	1389685	1389692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_004463	CGTT	2	8	1389722	1389729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_004463	TCCG	2	8	1416214	1416221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_004463	AGCG	2	8	1417094	1417101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_004463	CCTG	2	8	1424829	1424836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_004463	CGGG	2	8	1425767	1425774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_004463	CAGG	2	8	1426126	1426133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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