MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 24997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004463	GCA	2	6	1363158	1363163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_004463	GCC	2	6	1363184	1363189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_004463	C	6	6	1363228	1363233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3504	NC_004463	CGAC	2	8	1363314	1363321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_004463	CCCA	2	8	1363348	1363355	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3506	NC_004463	GATCG	2	10	1363407	1363416	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3507	NC_004463	CG	3	6	1363415	1363420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_004463	GAC	2	6	1363542	1363547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_004463	GGA	2	6	1363582	1363587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_004463	GC	3	6	1363596	1363601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_004463	CGC	2	6	1363607	1363612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_004463	GCAA	2	8	1365441	1365448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_004463	TGC	2	6	1365477	1365482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_004463	CTG	2	6	1365890	1365895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_004463	A	8	8	1365915	1365922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_004463	GAC	2	6	1365977	1365982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_004463	CG	3	6	1366644	1366649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_004463	CG	3	6	1366652	1366657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_004463	CCCTC	2	10	1367529	1367538	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3520	NC_004463	CGC	2	6	1368072	1368077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_004463	GC	3	6	1368076	1368081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_004463	CTG	3	9	1368099	1368107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_004463	GCC	2	6	1368130	1368135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_004463	GGA	2	6	1368150	1368155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_004463	ATT	2	6	1368198	1368203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004463	CCG	2	6	1369913	1369918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_004463	CG	4	8	1369949	1369956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_004463	GAG	2	6	1369976	1369981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_004463	GGAATG	2	12	1370437	1370448	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_004463	CTG	2	6	1370458	1370463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_004463	ACC	2	6	1370491	1370496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_004463	GGT	2	6	1370497	1370502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004463	ACA	2	6	1370541	1370546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_004463	GAC	2	6	1370578	1370583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_004463	CGA	3	9	1370606	1370614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_004463	CGG	2	6	1370632	1370637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_004463	CCAG	2	8	1370691	1370698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_004463	AAGCC	2	10	1370699	1370708	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3539	NC_004463	CGG	2	6	1372981	1372986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_004463	CAGGCA	2	12	1373011	1373022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_004463	CG	3	6	1373092	1373097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_004463	AAC	2	6	1373804	1373809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_004463	CCACC	2	10	1374171	1374180	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3544	NC_004463	GGC	2	6	1374235	1374240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_004463	CCGC	2	8	1374258	1374265	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3546	NC_004463	GGT	2	6	1374356	1374361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_004463	TTCCTT	2	12	1374396	1374407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_004463	AAC	2	6	1374453	1374458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_004463	CGAAG	2	10	1375355	1375364	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_004463	AGTT	2	8	1376199	1376206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_004463	GCG	2	6	1376214	1376219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_004463	CGC	2	6	1378510	1378515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_004463	AAC	2	6	1378537	1378542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_004463	ATA	2	6	1378669	1378674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_004463	CCTA	2	8	1380527	1380534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_004463	CTG	2	6	1380592	1380597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_004463	CAT	2	6	1380648	1380653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_004463	G	6	6	1381352	1381357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_004463	GTG	2	6	1381478	1381483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_004463	GCAG	2	8	1381495	1381502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_004463	ATGA	2	8	1381549	1381556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_004463	ATCC	2	8	1381578	1381585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_004463	CGTT	2	8	1381624	1381631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_004463	CCG	2	6	1381632	1381637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_004463	CTG	2	6	1381640	1381645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_004463	C	6	6	1381688	1381693	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3567	NC_004463	GCC	2	6	1381729	1381734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_004463	TTA	2	6	1383409	1383414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_004463	CTC	2	6	1387588	1387593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_004463	GCGCA	2	10	1387618	1387627	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3571	NC_004463	CGGGC	2	10	1387635	1387644	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3572	NC_004463	GCC	2	6	1387645	1387650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_004463	GCC	2	6	1387672	1387677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_004463	GCG	2	6	1387684	1387689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_004463	CGA	2	6	1387692	1387697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_004463	CGGC	2	8	1387770	1387777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_004463	CAG	2	6	1387789	1387794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_004463	CGA	2	6	1387815	1387820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_004463	CGA	2	6	1387824	1387829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_004463	GC	3	6	1387836	1387841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_004463	GCC	2	6	1387846	1387851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_004463	AGG	2	6	1389664	1389669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_004463	ATGC	2	8	1389685	1389692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_004463	CGTT	2	8	1389722	1389729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_004463	GTT	2	6	1391678	1391683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_004463	GCA	2	6	1391684	1391689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_004463	CAG	2	6	1391721	1391726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_004463	GC	3	6	1391728	1391733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_004463	ATC	2	6	1393242	1393247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_004463	TTG	2	6	1393290	1393295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_004463	TTCG	2	8	1396443	1396450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_004463	CCG	2	6	1396458	1396463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_004463	ACG	2	6	1396860	1396865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_004463	GAT	2	6	1396892	1396897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_004463	CG	3	6	1396898	1396903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_004463	CTG	2	6	1396942	1396947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_004463	TGCGC	2	10	1397630	1397639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3598	NC_004463	GCC	2	6	1398030	1398035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_004463	GGC	2	6	1398050	1398055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_004463	GGCC	2	8	1398063	1398070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_004463	CG	3	6	1399985	1399990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_004463	CG	3	6	1399994	1399999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_004463	AGC	2	6	1400050	1400055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_004463	GAA	2	6	1400098	1400103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_004463	TCGC	2	8	1400157	1400164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_004463	GCCTC	2	10	1403688	1403697	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3607	NC_004463	GGA	2	6	1403767	1403772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_004463	TCC	2	6	1406165	1406170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_004463	CGCTG	2	10	1408643	1408652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3610	NC_004463	TCG	2	6	1408690	1408695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_004463	TC	3	6	1408817	1408822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_004463	GAC	2	6	1408851	1408856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_004463	GTG	2	6	1409350	1409355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_004463	AG	3	6	1410041	1410046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_004463	AAGCG	2	10	1411287	1411296	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3616	NC_004463	GGT	2	6	1411329	1411334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_004463	ATCCT	2	10	1411683	1411692	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3618	NC_004463	TCG	2	6	1411698	1411703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_004463	GC	3	6	1412364	1412369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_004463	CGG	2	6	1413516	1413521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_004463	TCCG	2	8	1416214	1416221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_004463	AAC	3	9	1416231	1416239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_004463	CCG	2	6	1417076	1417081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_004463	AGCG	2	8	1417094	1417101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_004463	CTT	2	6	1417158	1417163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_004463	CAA	2	6	1417164	1417169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_004463	GAC	2	6	1417206	1417211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_004463	GT	3	6	1417997	1418002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_004463	GTC	2	6	1418036	1418041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_004463	GCTCC	2	10	1418052	1418061	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3631	NC_004463	GAC	2	6	1418101	1418106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_004463	TGC	2	6	1418116	1418121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_004463	TTC	2	6	1420545	1420550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_004463	CTG	2	6	1420627	1420632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3636	NC_004463	TTC	2	6	1422157	1422162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3639	NC_004463	CCTG	2	8	1424829	1424836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3640	NC_004463	CGC	2	6	1424878	1424883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3649	NC_004463	CCG	2	6	1426178	1426183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3662	NC_004463	CGG	2	6	1437679	1437684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3756	NC_004463	TGG	2	6	1463305	1463310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3757	NC_004463	CATAGA	2	12	1463353	1463364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3894	NC_004463	GCA	2	6	1528547	1528552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3896	NC_004463	CAG	2	6	1528690	1528695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3897	NC_004463	GGC	2	6	1528901	1528906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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