MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 24997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004463	GCGG	2	8	540723	540730	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_004463	ACC	2	6	540741	540746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_004463	GC	3	6	542113	542118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_004463	CGT	2	6	543641	543646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_004463	CGC	2	6	543796	543801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_004463	ATTGA	2	10	544374	544383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_004463	CAA	2	6	544413	544418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_004463	CGG	2	6	544419	544424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_004463	AGC	3	9	544444	544452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_004463	CGT	2	6	544454	544459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_004463	GT	3	6	544542	544547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_004463	CAC	2	6	544557	544562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_004463	CCA	2	6	544609	544614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_004463	TGG	2	6	544639	544644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_004463	CGCTT	2	10	544647	544656	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1516	NC_004463	GACC	2	8	545493	545500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_004463	ACCGC	2	10	547084	547093	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1518	NC_004463	GTC	2	6	547103	547108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_004463	GAC	2	6	547238	547243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_004463	GC	3	6	547259	547264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_004463	TC	3	6	547265	547270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_004463	AAC	2	6	547271	547276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_004463	GCC	2	6	547309	547314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_004463	GA	3	6	547318	547323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_004463	GCG	2	6	549243	549248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_004463	GC	3	6	549297	549302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_004463	ACTG	2	8	549356	549363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_004463	CTGG	2	8	549373	549380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_004463	CGG	2	6	549385	549390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_004463	AT	4	8	549448	549455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_004463	TCA	2	6	549514	549519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_004463	CG	3	6	549615	549620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_004463	CTG	2	6	549625	549630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_004463	ACA	2	6	549640	549645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_004463	CGC	2	6	553265	553270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_004463	ACC	2	6	553292	553297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_004463	CTTC	2	8	553316	553323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_004463	TC	4	8	557541	557548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_004463	TCG	2	6	557551	557556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_004463	GA	3	6	557610	557615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004463	CTC	2	6	557653	557658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_004463	GAC	2	6	557697	557702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_004463	AAC	2	6	558608	558613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_004463	GC	3	6	559011	559016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_004463	CGA	2	6	559021	559026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_004463	GTT	2	6	559057	559062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_004463	AAAT	2	8	559420	559427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_004463	CAC	2	6	559483	559488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_004463	CAC	2	6	559516	559521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_004463	CA	4	8	561764	561771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_004463	GTT	2	6	561814	561819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_004463	GC	3	6	561820	561825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_004463	GC	3	6	561865	561870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_004463	CAC	2	6	561883	561888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_004463	TGG	2	6	561908	561913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_004463	CGCTT	2	10	561917	561926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1557	NC_004463	GGC	2	6	564216	564221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_004463	GCA	2	6	564853	564858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_004463	CG	3	6	564895	564900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_004463	CG	3	6	566260	566265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_004463	TA	3	6	566299	566304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_004463	CTT	2	6	568012	568017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_004463	GC	3	6	568116	568121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_004463	AAG	2	6	568220	568225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_004463	CA	3	6	569242	569247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_004463	GCG	2	6	569357	569362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_004463	ACCCC	2	10	569425	569434	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1568	NC_004463	CT	3	6	571741	571746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_004463	CGT	2	6	571750	571755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_004463	GAC	2	6	571771	571776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_004463	GGA	2	6	571779	571784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_004463	CGA	2	6	571790	571795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_004463	CCG	2	6	572687	572692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_004463	GC	3	6	574189	574194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_004463	GC	3	6	574245	574250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_004463	GGTCC	2	10	574281	574290	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1577	NC_004463	CAC	2	6	576395	576400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_004463	GC	3	6	577260	577265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_004463	GCTT	2	8	577335	577342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_004463	GCG	2	6	577405	577410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_004463	CAC	2	6	577423	577428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_004463	TCC	2	6	577438	577443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_004463	ACCCC	2	10	577473	577482	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1584	NC_004463	GCC	2	6	577523	577528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_004463	CAC	2	6	577539	577544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_004463	CCT	2	6	579777	579782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_004463	CGC	2	6	579793	579798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_004463	GCC	2	6	579821	579826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_004463	GTG	2	6	579870	579875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_004463	CGG	2	6	579908	579913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_004463	GATTG	2	10	579935	579944	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_004463	CG	3	6	579978	579983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_004463	CCT	2	6	580016	580021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_004463	CAAC	2	8	580334	580341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_004463	T	6	6	580359	580364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_004463	AT	3	6	580377	580382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_004463	GTT	2	6	580465	580470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_004463	AGCGT	2	10	582403	582412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_004463	CAC	2	6	582416	582421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_004463	TGG	2	6	582441	582446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_004463	GC	3	6	582530	582535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_004463	TGA	2	6	582546	582551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004463	GGC	2	6	582564	582569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_004463	GCCC	2	8	582597	582604	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1605	NC_004463	ATC	2	6	587925	587930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_004463	CATT	2	8	587959	587966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_004463	TGC	2	6	587970	587975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_004463	ACA	2	6	588043	588048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_004463	GCC	2	6	588107	588112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_004463	GCT	2	6	588651	588656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_004463	ATT	2	6	588726	588731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_004463	A	7	7	588734	588740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004463	G	6	6	588752	588757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_004463	CAA	2	6	588812	588817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_004463	CGCGG	2	10	589382	589391	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_004463	GACGC	2	10	589400	589409	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1617	NC_004463	GCC	2	6	589425	589430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_004463	CAG	2	6	589445	589450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_004463	GAA	2	6	589460	589465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_004463	GCGCT	2	10	589466	589475	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1621	NC_004463	CCTG	2	8	590745	590752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_004463	C	6	6	591117	591122	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1623	NC_004463	CTTGA	2	10	591179	591188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1624	NC_004463	CAA	2	6	591243	591248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_004463	CGT	2	6	591277	591282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_004463	CGG	2	6	591298	591303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_004463	CCA	2	6	591321	591326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_004463	TCGGC	2	10	591349	591358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1629	NC_004463	CGG	2	6	591405	591410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_004463	CG	4	8	592279	592286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_004463	CA	3	6	593222	593227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_004463	AAGC	2	8	593243	593250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_004463	TTGAA	2	10	594072	594081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_004463	GCG	2	6	594135	594140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_004463	GCC	2	6	594152	594157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_004463	CCG	2	6	594269	594274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1637	NC_004463	CGC	2	6	594798	594803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1638	NC_004463	GCG	2	6	594810	594815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1908	NC_004463	GTC	2	6	714057	714062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1909	NC_004463	GAC	2	6	714077	714082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1910	NC_004463	TCC	2	6	716443	716448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1911	NC_004463	GGCTA	2	10	716461	716470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1912	NC_004463	GGGGC	2	10	716472	716481	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1913	NC_004463	ATCC	2	8	716507	716514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1914	NC_004463	CGG	2	6	716558	716563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1915	NC_004463	CGC	2	6	716567	716572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1916	NC_004463	CGG	2	6	716592	716597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1918	NC_004463	CGT	2	6	718001	718006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1922	NC_004463	GA	3	6	718133	718138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_004463	TCC	2	6	720649	720654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1924	NC_004463	GGGTGA	2	12	720695	720706	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1926	NC_004463	CGG	2	6	721907	721912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1929	NC_004463	GCC	2	6	722714	722719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1931	NC_004463	TC	3	6	723635	723640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1932	NC_004463	GTT	2	6	723657	723662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_004463	GGGA	2	8	723698	723705	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_004463	CG	3	6	724730	724735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1937	NC_004463	CCGG	2	8	724757	724764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1938	NC_004463	TAA	2	6	724847	724852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_004463	CTC	2	6	724853	724858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1940	NC_004463	GGC	2	6	724868	724873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1941	NC_004463	C	7	7	724947	724953	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1942	NC_004463	TTCGG	2	10	725007	725016	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1943	NC_004463	CAAC	2	8	725031	725038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1944	NC_004463	AAG	2	6	725049	725054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_004463	TGA	2	6	726981	726986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1947	NC_004463	CGG	2	6	727056	727061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1948	NC_004463	CGAT	2	8	727077	727084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1949	NC_004463	TGC	2	6	727116	727121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1950	NC_004463	TCG	2	6	727152	727157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1953	NC_004463	CCG	2	6	729037	729042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1954	NC_004463	GCG	2	6	729057	729062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1959	NC_004463	GAAA	2	8	731793	731800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1960	NC_004463	GC	3	6	732499	732504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1961	NC_004463	GAGGG	2	10	733471	733480	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1964	NC_004463	ACA	2	6	739881	739886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1969	NC_004463	CT	3	6	741390	741395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1970	NC_004463	CGG	2	6	742903	742908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1971	NC_004463	AGA	2	6	742977	742982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1979	NC_004463	CTC	2	6	746997	747002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1982	NC_004463	TCG	2	6	747143	747148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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