MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 24997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004463	GGC	2	6	366463	366468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_004463	GCC	2	6	366493	366498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_004463	ATG	2	6	366936	366941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004463	AG	3	6	367072	367077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004463	AC	3	6	367203	367208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_004463	GGCG	2	8	367735	367742	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_004463	GGCC	2	8	367809	367816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_004463	ATT	2	6	367840	367845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004463	GCT	2	6	367894	367899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_004463	CTCCG	2	10	367982	367991	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1011	NC_004463	TGA	2	6	368364	368369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004463	GAG	2	6	368388	368393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004463	GC	3	6	368394	368399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_004463	GC	3	6	368402	368407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_004463	TCG	2	6	368422	368427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_004463	CG	3	6	368538	368543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_004463	CTC	2	6	368548	368553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_004463	CG	3	6	368579	368584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_004463	GC	3	6	368591	368596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_004463	GAC	2	6	368605	368610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_004463	CCG	2	6	369507	369512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_004463	TAA	2	6	369593	369598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_004463	GC	3	6	369695	369700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_004463	TCG	2	6	369718	369723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_004463	CGC	2	6	369798	369803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1027	NC_004463	CGAC	2	8	371395	371402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_004463	CGG	2	6	371415	371420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1031	NC_004463	CAG	2	6	372305	372310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_004463	GCCAG	2	10	372332	372341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1033	NC_004463	GT	3	6	377211	377216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1036	NC_004463	CGTC	2	8	377334	377341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_004463	CGGCC	2	10	379468	379477	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1038	NC_004463	TCC	2	6	379488	379493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_004463	CAC	2	6	379517	379522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1041	NC_004463	TCC	2	6	379570	379575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1043	NC_004463	GGC	2	6	379654	379659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_004463	CGCT	2	8	382140	382147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_004463	TCCC	2	8	382152	382159	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1046	NC_004463	C	6	6	382157	382162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_004463	CGCC	2	8	382217	382224	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1049	NC_004463	GAG	2	6	382302	382307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004463	GTC	2	6	382319	382324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_004463	GC	4	8	382337	382344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_004463	G	6	6	382386	382391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004463	GCG	2	6	382402	382407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_004463	CGT	2	6	382418	382423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_004463	CGA	2	6	382435	382440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1057	NC_004463	CG	3	6	384722	384727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_004463	ACG	2	6	384751	384756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1061	NC_004463	GCA	2	6	385881	385886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_004463	CCCG	2	8	385917	385924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1063	NC_004463	CG	3	6	386761	386766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_004463	GAC	2	6	386780	386785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1068	NC_004463	GCC	2	6	386903	386908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1073	NC_004463	CGG	2	6	389780	389785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_004463	CGG	2	6	390239	390244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_004463	GACC	2	8	390261	390268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_004463	CGAG	2	8	390608	390615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1090	NC_004463	AGCGC	2	10	392811	392820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1098	NC_004463	ATCG	2	8	393184	393191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_004463	CGGC	2	8	394413	394420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_004463	ATC	2	6	394428	394433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1103	NC_004463	CGA	2	6	394536	394541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_004463	GCCG	2	8	394542	394549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_004463	CGCA	2	8	394552	394559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_004463	TCC	2	6	394609	394614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_004463	GCT	2	6	394620	394625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_004463	GCC	2	6	394696	394701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_004463	CGG	2	6	394712	394717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_004463	GCG	2	6	394776	394781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_004463	GAG	2	6	395779	395784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004463	CGA	2	6	395791	395796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_004463	AC	3	6	395878	395883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_004463	GTG	2	6	395949	395954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_004463	CG	4	8	396880	396887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_004463	GC	3	6	396956	396961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_004463	GCG	2	6	396967	396972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_004463	CAAA	2	8	396979	396986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_004463	GTTA	2	8	397052	397059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004463	ACCTG	2	10	397063	397072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1121	NC_004463	GGC	2	6	399082	399087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_004463	CAG	2	6	399902	399907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_004463	CCA	2	6	399933	399938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1125	NC_004463	CAA	2	6	399952	399957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_004463	CG	3	6	401282	401287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_004463	GAC	2	6	401328	401333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_004463	GGCTG	2	10	401346	401355	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1130	NC_004463	CGG	3	9	403936	403944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_004463	CAA	2	6	403977	403982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_004463	CT	3	6	404126	404131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_004463	GA	3	6	404149	404154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004463	GAT	2	6	404248	404253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_004463	GAC	3	9	406396	406404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_004463	TCGT	2	8	407149	407156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1405	NC_004463	AGGG	2	8	509135	509142	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_004463	G	6	6	509140	509145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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