MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 24997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004463	GAG	3	9	2052028	2052036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_004463	CCT	2	6	2052075	2052080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_004463	CTCG	2	8	2053619	2053626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_004463	GCCG	2	8	2056074	2056081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_004463	CCCT	2	8	2056151	2056158	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6006	NC_004463	TCA	2	6	2056184	2056189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_004463	CGC	2	6	2056217	2056222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_004463	ACCA	2	8	2056248	2056255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_004463	G	6	6	2056325	2056330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_004463	GGT	2	6	2056335	2056340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_004463	CCG	2	6	2056432	2056437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_004463	CG	3	6	2056452	2056457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_004463	CGC	2	6	2056535	2056540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_004463	ATG	2	6	2056555	2056560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_004463	GAC	2	6	2056668	2056673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_004463	CAAACG	2	12	2056702	2056713	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_004463	GCA	2	6	2056717	2056722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_004463	AG	3	6	2056759	2056764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_004463	AGC	2	6	2056772	2056777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_004463	ACG	2	6	2056790	2056795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_004463	GCT	2	6	2056802	2056807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_004463	GCT	2	6	2056891	2056896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_004463	CCA	2	6	2056906	2056911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_004463	AGG	2	6	2057122	2057127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_004463	GACGC	2	10	2057137	2057146	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6026	NC_004463	GCTGGC	2	12	2057234	2057245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_004463	GGT	2	6	2057276	2057281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_004463	GCA	2	6	2057296	2057301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_004463	AAC	2	6	2057323	2057328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_004463	GC	3	6	2057338	2057343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_004463	TTCT	2	8	2057884	2057891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_004463	CTGGT	2	10	2057923	2057932	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6033	NC_004463	GTCA	2	8	2058310	2058317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6034	NC_004463	GC	3	6	2058378	2058383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_004463	CAG	2	6	2058409	2058414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_004463	TTCC	2	8	2058445	2058452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_004463	GAT	2	6	2058498	2058503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_004463	GCC	2	6	2058542	2058547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_004463	GACG	2	8	2058554	2058561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_004463	CAG	2	6	2058659	2058664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_004463	TCGA	2	8	2058667	2058674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_004463	GCG	2	6	2058694	2058699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_004463	GTT	2	6	2058732	2058737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_004463	AG	3	6	2058744	2058749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_004463	TGGC	2	8	2058762	2058769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_004463	CA	3	6	2058777	2058782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_004463	CGG	3	9	2059154	2059162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_004463	CTG	2	6	2059189	2059194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_004463	GCG	2	6	2059274	2059279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_004463	CGC	2	6	2059308	2059313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_004463	GCTT	2	8	2059469	2059476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_004463	GCA	2	6	2059619	2059624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_004463	GAG	2	6	2059695	2059700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_004463	TTC	2	6	2061507	2061512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_004463	CAT	2	6	2061554	2061559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_004463	CGAG	2	8	2061589	2061596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_004463	GCA	2	6	2061621	2061626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_004463	CCG	2	6	2061635	2061640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_004463	GCA	2	6	2061661	2061666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_004463	GC	3	6	2061678	2061683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_004463	CTG	2	6	2062208	2062213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_004463	CAT	2	6	2062274	2062279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_004463	CGC	2	6	2062287	2062292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_004463	AAT	2	6	2062324	2062329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_004463	GCC	2	6	2062334	2062339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_004463	TCA	2	6	2063196	2063201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_004463	ACCG	2	8	2063252	2063259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_004463	AGG	2	6	2063269	2063274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_004463	GCTC	2	8	2063341	2063348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_004463	ACG	2	6	2063358	2063363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_004463	GCG	3	9	2063608	2063616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_004463	CGG	2	6	2063620	2063625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_004463	CTT	2	6	2063636	2063641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_004463	GC	3	6	2063658	2063663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_004463	GC	3	6	2063718	2063723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_004463	TGT	2	6	2063733	2063738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_004463	GC	3	6	2063796	2063801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_004463	CGC	2	6	2063949	2063954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_004463	CCCAA	2	10	2064116	2064125	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6080	NC_004463	CTT	2	6	2064165	2064170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_004463	GTC	2	6	2064214	2064219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_004463	GCT	3	9	2064264	2064272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_004463	CGG	2	6	2064698	2064703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_004463	CTA	2	6	2064724	2064729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_004463	CGA	2	6	2064741	2064746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_004463	TCC	2	6	2064770	2064775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_004463	GCC	2	6	2064776	2064781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_004463	CAG	3	9	2064940	2064948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_004463	GCC	2	6	2064977	2064982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_004463	CG	3	6	2065037	2065042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_004463	G	6	6	2065129	2065134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_004463	GATT	2	8	2065152	2065159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_004463	GAG	2	6	2065196	2065201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_004463	GATT	2	8	2065224	2065231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_004463	CTT	2	6	2065243	2065248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_004463	CCA	2	6	2065255	2065260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_004463	GCA	2	6	2065267	2065272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_004463	TGC	2	6	2065315	2065320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_004463	GC	3	6	2065342	2065347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_004463	GTG	2	6	2065458	2065463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_004463	ATC	2	6	2065575	2065580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_004463	TGA	2	6	2065591	2065596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_004463	CTT	2	6	2065629	2065634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_004463	AGA	2	6	2065717	2065722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_004463	AGC	2	6	2065728	2065733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_004463	CTTG	2	8	2065756	2065763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_004463	G	7	7	2065797	2065803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_004463	GTC	2	6	2065845	2065850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_004463	TTGGC	2	10	2065900	2065909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6110	NC_004463	CGT	2	6	2066014	2066019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_004463	ACA	2	6	2066050	2066055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_004463	TGA	2	6	2066149	2066154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_004463	GCA	2	6	2068142	2068147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_004463	ACGA	2	8	2068168	2068175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_004463	GCC	2	6	2068182	2068187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_004463	AGG	2	6	2068221	2068226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_004463	TCG	2	6	2068247	2068252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_004463	GTC	2	6	2068267	2068272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_004463	CCGC	2	8	2068278	2068285	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6120	NC_004463	GAGC	2	8	2068294	2068301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_004463	AGTGC	2	10	2068312	2068321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6122	NC_004463	GGCA	2	8	2068380	2068387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6123	NC_004463	GTCC	2	8	2068425	2068432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_004463	GGC	2	6	2068444	2068449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_004463	GC	3	6	2068448	2068453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_004463	TCA	2	6	2068456	2068461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_004463	GC	3	6	2068488	2068493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_004463	GA	3	6	2068555	2068560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_004463	ACT	2	6	2069332	2069337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_004463	AGG	2	6	2069361	2069366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_004463	GCCA	2	8	2069475	2069482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_004463	GCAT	2	8	2069598	2069605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_004463	TCC	2	6	2069652	2069657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6134	NC_004463	GGA	2	6	2069660	2069665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6137	NC_004463	G	6	6	2071219	2071224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_004463	TTG	2	6	2071258	2071263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6253	NC_004463	GC	3	6	2109064	2109069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_004463	GAGT	2	8	2109099	2109106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_004463	GAA	2	6	2109168	2109173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_004463	GCG	2	6	2109871	2109876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6259	NC_004463	CGAT	2	8	2109916	2109923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6260	NC_004463	CAT	2	6	2109944	2109949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6261	NC_004463	TTC	2	6	2109962	2109967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_004463	CTG	2	6	2109983	2109988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6383	NC_004463	GTG	2	6	2131749	2131754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6386	NC_004463	CGC	3	9	2133851	2133859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6387	NC_004463	AT	3	6	2133881	2133886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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